眾人來到舉子們靜坐的地方，有幾個衙役從貢院搬出了幾張桌椅，供尹繼善等四人落座。方坐下，還沒等尹繼善發話，福爾泰就開口喊道：“這位是欽差大臣尹大人，你們把鬧事的主謀供出來，尹大人會酌情處理，減輕你們的罪責。”
尹繼善皺了皺眉，剛剛在五阿哥那裡就隨便插嘴，自己看在五阿哥的面子上並沒有說什麼。可當著眾多考生的面，搶在自己前面說話也就算了，隨讓他是五阿哥的伴讀，可一開口就定了人家的罪，這哪是審案，分明是想引起譁變！
其中一個舉子冷哼一聲：“今科舉子在此靜坐根本沒什麼主謀，純是偶然而發，是考生對科考排定的榜上之名不服，為什麼事前排定的名次在發榜前一天突然更改，這是什麼道理，是不是考官收了人家的錢財徇情枉法？國家掄才為何舞弊科場？請欽差大人明察□□，為天下考生討回公道！”
傅恆轉向尹繼善：“尹大人，這下你都看明白了吧，皇上不知詳情一定責怪我辦事不力惹出此番風波，下邊的這些考生也不明真相，認為我這考官弄虛作假、營私舞弊、收人錢財、更改名次呢。”
永琪對這名舉子的回答十分失望，他定了定神，一拍桌子說道：“大膽刁民，你如果知道排定的名次在發榜前一天被改動了？”
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許多考生們哈哈大笑，笑得永琪莫名奇妙，也十分惱火，立即怒喝道:“你們還不如實招供，還笑什麼，再笑連命也笑掉了。”
有一個考生止住笑說道：“這位大人，天下可有不透風的牆？欽差大人既然身負聖命千里迢迢遠來江南，何必斤斤計較我們這些小小考生的過錯？請欽差大人認真查一查收受賄賂、隨意更改名次，踐踏挑才綱紀之人是誰，將這人奏明皇上嚴加懲處，並詔告天下，讓天下讀書人明晰真相。否則，天下學士寒心，認為官場腐敗，吏治廢弛，科場弊竇叢生，再加上連年澇災不斷，倘若有人振臂一呼，大清必將重步亡明之後塵。”
“住口！”紀曉嵐哪容他再說下去，什麼都敢說，他還要不要命了。大聲呵斥道：“狂妄書生，口出狂言，皇上聖明，必將查明真相，哪用得到你來胡說八道，還不快快退下！”
那名書生見此不僅沒退下，還理直氣壯地說道：“莫非大人有意為營私舞弊、弄虛作假之人開脫罪責不成？皇上派大人來查問此事也不過是掩人耳目？”幾句話問得紀曉嵐有些狼狽，他本來是想為他解圍的，誰想到他竟然說出這麼一番話來，可又不能不管他，任他繼續口出狂言丟了性命。
於是紀曉嵐轉向尹繼善：“此等讀書之人，雖有滿腹經綸，但行事如此莽撞，審事偏執，容易意氣用事……”
“慢著，紀大人，這些書生如此危言聳聽，煽動人心，聚眾滋事，還說不知道誰是主謀？你這麼袒護他，我以為你就是主謀，就是此次鬧事的策動人。”福爾泰見紀曉嵐竟在言語中袒護這些考生，立刻不忿的說道。
紀曉嵐見他面露得色，不欲與他糾纏下去，著急地向傅恆使了個眼色，請他幫忙說上兩句。傅恆明白他的意圖，看到之後不慌不忙的說道：“尹大人，這位書生雖然口出狂言，可說得也有些道理，請尹大人認真查詢一下，為何更改名次的原因吧！如果這樣查問下去，只怕是一無所獲啊。”
尹繼善從開始被福爾泰搶話後就再沒有開口，由著眾人發揮，他只管仔細聽著和看著。他早就明白五阿哥和七阿哥之間的明爭暗鬥導致的緊張關係，此時他已能夠猜中五阿哥的真實目的是打擊七阿哥。既然案情已經明了，也就沒必要在這裡折騰下去了，趁早回京稟明皇上才是正事。
尹繼善吩咐紀曉嵐親自去說服考生們，先讓他們從貢院前散去，自己會向皇上稟明一切，朝廷定會給他們一個明確的交代。
永琪不願事情就這麼結束，連忙讓福爾泰攔住紀曉嵐，衝上前去對尹繼善道：“尹大人，剛剛紀大人說這些書生行事莽撞，審事偏執，難道就不能是發現原先排定的名次有差，即時給予更正麼？”
傅恆意識到永琪這樣說等於是當眾指責自己徇私舞弊，冷冷的說道：“五阿哥懷疑傅某營私舞弊，隨意排定名次？那好吧，傅某這就隨尹大人去一趟貢院，當場審定那些試卷！不然，我傅恆是跳進黃河也洗不清。五阿哥如此心思與作為也被任命副主考，只怕有辱考官之名呀！”
見永琪還要糾纏，尹繼善毫不示弱地說：“前後兩個十名的試卷，尹繼善都要帶回京師請皇上審閱，是非功過自由皇上裁定，我等應該相信皇上的英明吧？”說完轉身同傅恆一起離去，丟下五阿哥在那裡把牙咬得咯咯直響。
尹繼善回到京城後，把查訪經過奏報給乾隆。對於永琪更改名次一事，尹繼善不願隱瞞，同帶回的考卷一起，如實上呈給乾隆。乾隆看過後很不舒服，但他十分清楚，南闈科場事件與北闈風波一樣，都是皇子之間的較量。乾隆痛心之餘，只好把責任推在這些大臣身上。
一旨令下，原對考生們的處理不變，眾考生於保和殿參加複試，皇帝親自命題，於半年後正式開考。應天府科考一案，江蘇巡撫託恩多（1）瀆職免官，永不敘用，傅恆、紀曉嵐失察，罰俸3年，降一級留用。命陳宏謀回江蘇，以總督銜管巡撫事。
詔書是發下去了，可永琪還是要罰地，招來永琪當面狠狠訓斥一頓，將爵位降為貝子，令永琪閉門讀書，洗心思過。