黃帝與蚩尤的這場大戰十分慘烈，直殺得天昏地暗，屍橫遍野。
然而風伯雨師在天上終於不敵應龍，負傷飛走，蚩尤敗局已定。
《雲笈七籤紀傳部》雲：“（黃帝）驅應龍以處南極，殺蚩尤與夸父。”
蚩尤天生神體，即使手腳、頭顱被斬斷，拼接之後依然能迅速復活。所以趁蚩尤被應龍的雷霆之擊撕裂虎軀，片刻之間無法恢復時，黃帝趕緊用利劍將他大卸八塊，這才驚魂未定地擦了擦汗。
他命人迅速地將蚩尤的屍塊運送四方，分別葬在相距非常遙遠的幾個地方，又用咒符鎮壓，避免蚩尤再次復活。蚩尤的眾多兄弟也盡數被誅。
黃帝遂威震天下，鑄九鼎，立九州，成為天下共主。
他感激玄女功德，尊玄女為“帝師”。
玄女在道教中地位崇高，被認為是至真天仙，乃大道衍化、南方離火所化生，稱之為“九天玄母天尊”，是九天道法之祖，符法咒之宗。
玄女在女仙神系中地位僅次於西王母，掌管天機秘典，歷史上多次應劫顯凡，真形幻相，形態不一。
在各種歷史傳說中，春秋時助越亡吳、薛仁貴徵東、劉伯溫得兵法、漢高祖建都皆與九天玄女有關。
應龍在此戰中立下汗馬功勞，但消耗了太多神力，無法返回天庭，於是蟄居在南方的山澤裡。《山海經大荒北經》雲：“應龍已殺蚩尤，又殺夸父，乃去南方處之，故南方多雨。”
女也再也飛不回天空，只好留在人間。她的所居之處常年乾旱無雨。
風伯雨師倒沒啥損失，繼續做們的風雨之神。
根據記載，“風伯雨師”很早就被人們祭祀崇拜，秦漢時已列入國家的祀典。唐宋以後，雨師的地位被從佛教中脫胎出來的龍王所取代。
在黃帝眾妻子中，嫘祖首先馴養家蠶、創造蠶絲業，被人們奉為“先蠶娘娘”，又有懿德，於是成了黃帝的正妃。
軒轅黃帝大戰蚩尤是中國上古時代極其重要的事件。黃帝勝利之後一統中原，成為華夏共主，位列“五帝”之首。
中國以儒家思想為主流，一向強調“正統”，史家又多有“成王敗寇”的傳統，因此“黃帝戰蚩尤”逐漸被描述為正義與邪惡的戰爭，以《史記五帝本紀》為代表，流傳甚廣。
然而歷史上對蚩尤的惡評未必公允。《山海經校注》雲：“蓋夸父與蚩尤同為炎帝之裔，在黃炎鬥爭中，蚩尤起兵為炎帝復仇，夸父亦加入蚩尤戰團”。
涿鹿之戰後，黃帝的帝位日趨穩固，但部落眾多的華夏大地依然有許多人表示不服。
刑天就是其中之一。
他是一名身強力壯的上古巨人，本是炎帝手下大將。炎帝在阪泉之戰中被黃帝打敗，刑天和其他部下都很不服氣。
當蚩尤舉兵對抗黃帝時，刑天很想去參加這場戰爭，但炎帝此時已經臣服於黃帝，堅決阻止了刑天的行動。
如今蚩尤失敗，慘遭屠戮，刑天再也按捺不住心中的熊熊怒火。他帶領他的兒子和手下揭竿而起，發誓要和黃帝爭奪帝位！
誰也攔不住英勇善戰的刑天。這位巨人左手持盾，右手拿斧，一直殺到黃帝的宮前，大叫著要與黃帝決一高下。
黃帝大怒，提起切金斷玉的昆吾寶劍就和刑天打了起來。
他們兩人形體相差巨大，但黃帝身上也流著神明血脈，是人中之龍。況且黃帝與蚩尤大戰過，雖然略有不敵，但又怎能怕了刑天，讓天下人認為他姬軒轅軟弱可欺，天天反抗他的統治？
於是兩人從宮內殺到宮外，一直殺到了常羊山。
黃帝劍術神通，尋著一個空隙，匹練般的劍光向刑天的脖子砍去。刑天防禦不及，頭顱被黃帝斬落下來，落到地上，又順著陡坡向山腳下滾去。
被斬首的刑天厲聲慘叫，但他是神人，頭顱被削去卻可以不死。
他彎下腰，在地上到處找自己的頭顱，但由於沒有眼睛，所以他沒有發現自己的頭顱就在常羊山腳下。
黃帝擔心刑天找到頭顱後會恢復如初，於是舉起昆吾神劍向常羊山劈去。
常羊山在一聲巨響中被劈成了兩半，刑天碩大的頭顱滾進了低窪的兩山之間。
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黃帝浮空，展開咒術，那兩半高山又轟然合二為一，把刑天的頭顱埋葬在了裡面。
失去視力和聽覺的刑天透過皮膚感受到周圍的微妙變化，知他再也無法尋回自己的頭顱，但他依然不肯放棄。
相反，他的怒火與鬥志更加猛烈的燃燒了起來。只見他緩緩地站了站起來，那失去了頭顱的身軀比以前立得更加偉岸筆直。
他的雙手緊緊握著斧和盾，向四周憤怒地揮舞著。即使要以兩個**當眼睛，拿肚臍做嘴，他也要不屈地與黃帝戰鬥下去！
這位亙古的巨人就這樣不停地揮舞、不停地反抗著，直到他力竭被殺的那一刻。
常羊山從此陰雲鬱結，碧天不開，還時時聽見悶雷在山谷中轟鳴迴響。那是失敗的刑天一直不甘地揮舞著武器，要與敵人永遠地戰鬥下去。
來自四方的反抗還在繼續。《史記正義》引《龍魚圖》雲：“黃帝攝政……。蚩尤沒後，天下復擾亂。黃帝遂畫蚩尤形象以威天下。天下鹹謂蚩尤不死，八方萬邦皆為弭服”。
蚩尤是人人敬畏的站神，不僅黃帝要用“蚩尤未死”來震懾天下，後來更有傳言說，蚩尤做了黃帝的臣屬，成為“黃帝六相”之一，負責掌管天時。
至於夸父，一定會有人問：夸父不是追逐太陽時渴死的嗎？又怎麼會被應龍所殺？
其實，中國上古的族群名稱經常與部落首領同名，所以兩個事件所提到的“夸父”並不是同一個人。
夸父的首領被應龍所殺後，剩下的夸父族人逃回了原來的居住地。
這次戰爭的破壞力足以改變氣候，於是戰後不久，大地發生了嚴重的旱災，太陽象個大火球，烤得大地龜裂，江湖涸幹，一片荒涼。
於是，夸父族中的一位英雄向太陽追去，發誓要把太陽摘下來。太陽見夸父發火，也有點心慌，一面向他射出熱力，一面加快速度向西落去。
夸父健步如飛，瞬息間追了萬里。眼看快要追到太陽落山的地方禺谷的時候，太陽的熱量使他感到頭暈目眩、焦渴難耐。
夸父喝乾了黃河的水，連渭水也喝幹了，還是感到口渴難忍，最後像大山一樣轟然倒地。
這就是盡人皆知的“夸父逐日”的故事。