話說當初黃蓉將一切都告訴黃藥師後，父女倆就一起離島而去，到了張家口。
在張家口事件中，父女倆強勢插手，先順著劇情稍作謀劃，救出了包惜弱，讓她與楊鐵心重續前緣，又令楊康認祖歸宗。
待完顏洪烈追來，直接以雷霆手段，滅了完顏洪烈與其麾下梁子翁、侯通海、沙通天一眾武林高手，還順手屠戮千餘金兵，卻放了歐陽克一馬，只教訓他一頓了事。
之後許多劇情都是因歐陽克而起，若非弄死了歐陽克，歐陽鋒也不會與他們不死不休，有了今日的不殺之恩，黃藥師武功又已遠超歐陽鋒，日後歐陽鋒想必不會，也不敢再與他們為敵。
之後郭靖與楊康進行了一場公平比武，郭靖於梁子翁藥蛇的機緣，黃蓉並未剝奪，喝過蛇血，功力大增的郭靖自然獲勝，完成了這場十八年之約。
隨後楊鐵心決定，跟包惜弱到終南山下隱居，楊康則是被丘處機帶回全真教教導，當然，是以俗家弟子的身份，畢竟他已經跟穆念慈有婚約，不可能出家做道士。
至於郭靖，沒了原劇中那麼多機緣巧合，諸事纏身，自然是回了大漠，因為他的母親還在大漠，那裡還有一個華箏公主在等他。
如今的郭靖，是註定成不了北俠了，他只能成為鐵木真的金刀駙馬，替蒙古東征西討。
金兵被黃蓉和黃藥師這對如同鬼神的父女殺得膽寒，兩人所到之處，金兵退避三舍。
他們洗劫了張家口所有金人權貴的糧倉，將糧食一掃而空，甚至連金軍的糧草都沒放過，但百姓家中的糧食他們卻秋毫無犯。
父女倆一路向北，毫無顧忌的掠奪著金國糧草，結果羅長風發給她的一千斤黃金一分沒花，卻成了群友中為阿九提供糧食最多的一個。
金國又是派出大量高手刺殺，又是派出大軍圍剿，卻反而損兵折將，死傷慘重，被殺得一點脾氣都沒有。
他們食材有阿九提供，休息有胡八一提供的後世單兵帳篷，找個深山老林，危崖絕壁一窩，金國拿他們毫無辦法。
金國權貴與軍隊沒了糧食，自然只得向百姓徵集，結果逼得百姓沒了活路，揭竿而起，金國開始內亂。
金國焦頭爛額，阿九那邊卻是壓力大減，天下各地百姓相繼得到賑災糧，闖軍也開始不斷縮水。
許多活不下去，無奈跟著造反的百姓見朝廷開始大肆賑災，他們有了活路，自然不願再去幹那掉腦袋的事，紛紛逃離闖軍，返回家鄉。
大明逐漸開始穩定，闖軍進逼京城的步伐幾近停滯，讓朝廷有了更多喘息之機。
而且在羅長風和眾群友跟阿九分析了朝廷的弊端後，阿九說服了崇禎，對朋黨和閹黨舉起了屠刀，尤其是東林黨，遭到了血腥清洗。
反正大明現在已經爛得差不多，乾脆就給它動個大手術，陣痛之後總會迎來新生。
大明並非完全無糧，只是糧食都被收攏在權貴們的糧倉中，不肯拿出來，所謂“朱門酒肉臭，路有凍死骨”，阿九這番舉措，使得大明的饑荒大為緩解。
大明正在經歷於灰燼中浴火重生的過程，要不了多久，阿九將帶著自己訓練出來的刺客隊，對闖軍發起反攻，奪回被闖軍佔領的地盤。
大明新軍也早已整訓完成，隨時可以調往北方邊境，對後金韃子發起反攻，《碧血劍》世界的掌控，只是時間問題了。
目光轉回黃蓉這邊，父女倆一路北上，所向披靡，甚至直接殺進金國皇宮，取了金國皇帝的腦袋，順帶著將國庫也給洗劫一空。
他們這一路上不光搶糧，還刺殺金國大大小小的官員與將領，金國基本上算是被他們兩個人給挑翻了。
在殺穿金國國土後，父女倆暫時沉寂了一段時間，然後去了襄陽城，找到獨孤劍冢，黃蓉用幾壇美酒征服了神鵰，然後她便開始給群友們提供大量菩斯曲蛇膽，令群友們實力大增。
其中好處最大的，自然便是摸金三人組，他們沒有根基，修行起步最慢，得到菩斯曲蛇膽後，卻迅速躋身高手行列。
而在父女倆於劍冢修習的時間，蒙古見金國內亂，又缺乏糧草，有機可乘，當下果斷出兵，短短年餘時間便滅了金國，成吉思汗鐵木真也在這一年逝世。
父女倆便在這個時候再度出山，大肆刺殺蒙古將領，所向披靡，無人可擋。
最後是郭靖出面求情，才保下了朮赤、察合臺、窩闊臺、拖雷、哲別、蒙哥、忽必烈一眾，但條件是蒙古退出中原。
蒙古無奈之下，只得退出中原，並立誓永不再進中原，黃蓉與黃藥師在無意之間，成了大宋的守護神。
而不能南下，蒙古便開始往西用力，多年以後，郭靖帶著蒙古大軍一直打到了西班牙，整個歐洲幾乎都成了蒙古的地盤。
但無論蒙古國力多強大，卻始終不敢再覬覦大宋，或許他們有滅了大宋的實力，憑黃蓉與黃藥師兩人，也不可能將他們屠盡。
可他們何須屠盡？只要幹掉高層領袖就可以了嘛！沒有人願意整天過得提心吊膽，擔心自己什麼時候就在睡夢中被人割去了腦袋，所以蒙古的統治者，再沒動過南下大宋的想法。
反正歐洲的環境也挺好，沒必要去大宋找刺激，是以蒙古舉族遷往歐洲，以後世義大利、法國、德國的範圍為蒙古帝國的主要國土，在那落地生根，蒙古大草原則是成了他們的牧場。
大宋這邊，蒙古退走後，宋理宗趙昀立刻派出大軍，將北方屬於大宋的地盤全部搶佔回來，並將國都重新從臨安遷回汴京。
宋理宗派出使者，想要請黃藥師到汴京擔任國師之職，卻被黃藥師拒絕，他徑自帶著黃蓉趕往華山，參加華山論劍。
最終黃蓉繼承東邪之號，黃藥師卻以一敵四，並戰而勝之，成了天下第一，是為新的中神通。
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在黃蓉將道元經和長風劍法傳給黃藥師之前，他不是黃蓉對手，但他本身功力就比黃蓉深厚，得到道元經，將真氣質量提升上來後，黃蓉自然就打不過他了。
便在華山論劍結束時，羅長風收到了世界掌控成功的訊息。