說在前面：
這章不看也沒什麼關係，因為這些設定都已經融入到故事當中了，只是這樣單獨寫出來可以讓大家看的更清楚，下一章開始正文。
1.所有生命全部吃素
2.故事開始的時候N只有15歲
3.每種mega精靈只有一隻
4.一個人最多只能mega一隻精靈
5.即使有著10級的等級優勢，普通精靈也很難戰勝mega精靈
6.即使有著10級的等級優勢，mega精靈也很難戰勝神獸
7.Mega進化石是從達到條件的精靈體內生出來的，並不能取下
8.達到條件的訓練家是直接將力量傳入精靈體內完成mega進化的，不存在鑰石的設定（我不想讓mega成為爛大街的東西）
9.原作中許多反派boss都被英雄們（遊戲中的主角們）感化了，有的甚至擔當館主或者天王，本作的大型反派組織只保留等離子團
10.只有相同的族系（如：波波，比比鳥，比雕）才能生蛋，百變怪是否除外另行考慮
11.為了方便與交錯火焰合招，交錯閃電被設定成了物理屬性的遠端攻擊技能
12.如果電系招式的威力強到一定程度,是可以擊傷地面系的精靈的（雖然傷害依然會大打折扣），畢竟現實中的避雷針也有被雷劈壞的時候，這也解釋了為什麼皮神可以電倒隆隆巖
13.離開地面的地屬性對電系沒有抗性
14.夢幻只有一隻
15.書中的PP並不是按技能分開計算的，而是有一個總量，相當於藍條
16.透子的Mega比雕是特例中的特例，有史以來僅此一隻的自然Mega，進化原理與神獸Mega類似，即使是戰鬥結束也不會退出Mega形態
17.本書中的神獸是真的有毀滅世界的實力，以力量見長的神獸全力一擊甚至可以擊沉一座小島，而Mega進化作為本作唯一可能戰勝神獸的手段，自然也有著相當強大的力量
18.如果用遊戲中那種戰鬥中吃果的設定，就算比賽的時候有規則加以限制，那在與野生精靈對戰的時候也能使用“多多吃樹果”戰略了。為了避免這種情況，我更改了精靈從樹果中獲取力量的方式，即：神奇寶貝可以透過食用一些特殊的樹果來激發潛力，精靈戰鬥之前可以吃多種樹果，但只能保留最後一顆樹果的力量，且在一顆樹果發揮力量之後，30分鐘內無法透過使用其他樹果激發潛力。
另外註明：精靈透過食用樹果獲得的力量源自精靈自身潛力，並不是樹果包含這種力量，樹果只是用於引出精靈力量的媒介，相當於一種無毒無害，營養豐富的興奮劑。
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由於食用樹果激發潛力是神奇寶貝自身的特性，而且對神奇寶貝的身體也沒有損害，所以在比賽之前用樹果激發潛力的行為並不違反神奇寶貝對戰的精神
19.我稍微修改了一下聯盟大賽的參賽制度，遊戲中打排位的時候，所有精靈都被鎖在了50級，我就基於這個，拿50級來作為參賽的條件，只要擁有6只50級的精靈，就有資格參加聯盟大賽的選拔賽，而拿齊8個徽章的選手，能夠直接保送16強，進入主會場對戰，而且如果不集齊徽章將沒有挑戰天王的資格，天王都不能挑戰，那更沒資格挑戰冠軍了。
我之所以對聯盟大賽做出這樣的改動，是因為原作動畫中的小剛和小霞已經非常強了，我不覺得能夠打贏他們兩個拿到徽章的人會有很多。
雖然一個地區可能不止有8個道館，可是作為遊戲黨，八個道館是我必須跨過的挑戰，“這個道館打不過可以打別的”，我不想在書中留下這樣逃避挑戰的餘地
20.為了以防萬一我還是說明一下，精靈的HP歸零，代表的是該精靈失去戰鬥能力，並不代表精靈被打死了
21.為了防止人們不依靠自身實力，而是依靠人數優勢大量捕捉精靈，神奇寶貝世界制定了一條法律：禁止任何組織聚眾進入野外的精靈棲息地！結伴而行的人數超過5人要上報警局，超過10人要有警察陪同，超過20人絕對不許
22.精靈球在收容神奇寶貝的時候有兩種模式，一種是較為自由的“放養”模式，神奇寶貝可以較為自由的出入精靈球；另一種是用來制服不願聽話的精靈的“籠養”模式，被收服過的精靈在沒有訓練家同意的情況下不可能從球中脫出。因為精靈球要保證其嚴密性，不讓球內的精靈之力洩露，所以即使是放養模式，神奇寶貝想要以自己的意志衝出精靈球也頗為費勁，可比起毫無掙脫可能的籠養模式也要自由許多
23.如果用遊戲中那種戰鬥中吃果的設定，就算比賽的時候有規則加以限制，那在與野生精靈對戰的時候也能使用“多多吃樹果”戰略了。為了避免這種情況，我更改了精靈從樹果中獲取力量的方式，即：神奇寶貝可以透過食用一些特殊的樹果來激發潛力，精靈戰鬥之前可以吃多種樹果，但只能保留最後一顆樹果的力量，且在一顆樹果發揮力量之後，30分鐘內無法透過使用其他樹果激發潛力。
補充說明：精靈透過食用樹果獲得的力量源自精靈自身潛力，並不是樹果包含這種力量，樹果只是用於引出精靈力量的媒介，相當於一種無毒無害，營養豐富的興奮劑。
由於食用樹果激發潛力是神奇寶貝自身的特性，而且對神奇寶貝的身體也沒有損害，所以在比賽之前用樹果激發潛力的行為並不違反神奇寶貝對戰的精神。
24.石板只能對同屬性的神奇寶貝起效，且只有傳說中的神奇寶貝可以將其融入體內，伊布因為是基因非常不穩定的神奇寶貝，所以非常恰好的可以讓石板入體，還附帶進化效果。