並非簡單的基米拉獸進化至千年獸，看這只千年魔獸的形態，分明與最終千年獸中的赤色頭顱相似，但還缺少另一顆黑色頭顱，身外也沒有重重數碼環帶進行封印。簡直像是過去時空的最終千年獸借基米拉獸/千年獸之軀復活再現。
是了，一乘寺賢製造的那只基米拉獸復活為千年獸之後就徹底失蹤，莫非是直接穿越時空到了這裡？
“無限再生與自我增殖的能力？有趣！”千年魔獸詭笑道。以往的最終千年獸力量貫穿過去未來，幾乎不死，強則強矣，卻還是被秋山遼找到擊殺或者說限制的辦法，現在有了這兩種能力倒是對它做了最後的補足，“說不定我還要感謝你，暗黑騎士獸！”
如果不是騎士的鋼鐵面罩遮掩，暗黑騎士獸此時一定是面容扭曲，自己的造物居然敢違抗自己，明明應該沒有神智的野獸居然會說話！？
感受到主人的意志，陰影獸急了。
被陰影獸所庇護，天野姐弟所在的zone碎片尚算平靜，只是以暗黑騎士獸為中心徹底與其他三色指揮官分割開來。天野音音冷豔看著時空亂流肆虐中的戰鬥，暗黑騎士獸與暴君神威碰撞所洩出的強大氣息讓她的身體不住顫慄。
千年魔獸的出現更是讓她絕望，但是事情的突然變化似乎開啟了某個心結：“也許可以…”
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陰影獸影子暴漲，就要吞噬昏睡的天野琴音，為主人奪取這最強的xros·code！
“陰影獸！”一直面無表情的天野音音突然踏出一步，陰影獸的壓制還在，但在它即將離體突入天野琴音之時，天野音音終於獲得部分行動力。
因這突然的叫聲愣住，陰影獸的動作遲疑了片刻。
“……天野音音，強制數碼組合！”
強制數碼組合的力量將陰影獸拖拽過來，地面颳起晦暗的旋風。
“巴卡娜~！這樣的事情，怎麼可能！？”一直使用xros·code進行戰鬥的紅藍指揮官從沒想過人類也能和數碼獸進行組合！？
人類與數碼獸合體，這在數碼世界並非沒有先例，弧光機的網路進化就是！因為陸峰的插手，九尾狐獸究極進化為沙古牙獸，大古拉獸究極進化為混沌騎士獸多藉助了外力，李建良和大耳獸更是至今待在歐洲。但網路進化仍然有兩個成功的例子，正是身為超究極體的暴君天使獸x·天人形態與多路站龍獸·雙子星形態。
但是，網路進化是在馴獸師與數碼獸心靈高度一致，一心同體才能達成，與陰影獸和天野音音這樣互相敵對的情況完全不同。
大片佈滿血色眼瞳的影子旋轉著纏繞上來，強大的力量形成暴風將天野音音的衣物撕碎。陰影獸沒有實體，最終形成了以天野音音人類之身為主體，陰影獸浮動於皮膚與空氣中的形態，詭異得彷彿魔女。
眼睛，睜開！
自由死亡下墜（freedeathfall）！
魔女音音揮手擊出兩道黑光，一道擊碎了囚禁天野悠的牢籠，一道喚醒昏睡的天野琴音。
跨過無盡時空，沉睡了很久很久的天野琴音再次甦醒——“我琴音剛睡醒就又看到美麗的姐姐大人了！！”
活力十足的元氣少女，雖然感覺有點鬧騰。但當對方稱呼自己“姐姐大人”的時候，儘管仍然不認識對方，魔女音音仍然感到一陣滿足。凝望沉默的天野悠之後，魔女音音第二次動作。
常雨大地破碎，rainzone分崩離析，只有陰影獸所具有的影子世界能毫無滯澀地穿越狂暴的時空亂流阻隔，將這一對弟弟妹妹送出暗黑騎士獸的控制範圍。
“……這是何等滑稽的鬧劇！！”被天野音音的膽大妄為所震驚地暗黑騎士獸怒氣勃發，雙頭大槍刺破重重時空亂流如流星貫下！
殺死我（killme）！！
藉助影子無物能傷的特性發動陰影獸最拉仇恨的技能，將暗黑騎士獸的攻擊鎖定在自己身上，這樣…弟弟妹妹們就能活下去了吧！
“帶著我的弟弟妹妹走吧！”魔女音音最後滿足地看了一眼遠去的弟弟妹妹，“很快，我就要變成真正的魔女了……”
羽翼長刀劃破時空，以不可思議的速度劈向魔女音音。但終究，在臨頭那一刻停住了——“你以為我會被你這小小的把戲擺佈嗎！？”
暗黑騎士獸的語氣憤怒而又瘋狂。差一點，就差一點！將天野悠和琴音送走，自己則葬身在蛇鐵封神丸刀下，即救出了弟弟妹妹，又令暗黑騎士獸損失邁向巔峰最重要的臂助，真是個簡單易行的好計劃…才怪！
暗黑騎士獸現在一定能感覺到自己的神經都在因為憤怒而抽動。微微停滯的長刀帶著巨大的動能與魔女音音擦肩而過，金色的刀光瞬間掃滅三分之一的rainzone碎片。
今天發生的事情都太過出乎意料，性格謹慎的暗黑騎士獸決定暫時退卻，那邊千年魔獸已經擺脫莫斯提獸的封鎖，重獲新生的它正興致高昂地與莫斯提獸、林中仙女獸、高吼獸x4等數碼獸戰鬥。
“陰影獸，你的意志怎能被一個區區人類小女孩壓制！”暗黑騎士獸一聲冷哼，“給我把我等聖戰之軍帶走！”
“…是…的，……主人！”魔女音音的手艱難舉起，黑色x-loader發出刺目黑光，rainzone裡所有暗黑騎士獸的部下，包括得力大將昏暗獸，以及被封印在黑水晶裡各個zone大名鼎鼎的數碼獸全都化作一股股資料彙集到暗黑騎士獸身上，令它實力大增。
感受到體內陰影獸的意志因為魔女音音違抗暗黑騎士獸的命令而越來越強的反抗，天野音音已經開始失去對身體的控制權，被暗黑騎士獸撈在手中。“既然要成為魔女，那就隨我一起尋一座魔王的城堡吧！”
披風閃耀的魔法陣開啟道路，暗黑騎士獸迅速消失在時空亂流中。
遲疑了一下，陸峰沒有展開追擊。他還能引導時空夾縫中的小數之門進行超視距打擊，但這對暗黑騎士獸能起到多大作用很難說，更何況狀態異常的天野音音還在它手中。
千年魔獸已經察覺到這次敵人的難纏，莫斯提獸與暴君天使獸·天國形態都絕非弱者，隨著陸峰的加入，它的局面變得十分危急。借體重生畢竟不是完整形態和實力迴歸，得益於暗黑騎士獸為它增添的無限再生與自我增殖能力，儘管處於下風，千年魔獸仍然屹立不倒。
作為存在貫穿過去未來的異種，千年魔獸為自己謀劃的打破宿命獲得重生之地，又豈能一點後手都無？
轟隆隆——
崩碎的大地在震動。
深深嵌在大地之中的黑水晶在搖動，在呼應千年魔獸的呼喚！陸峰等人只知道這些黑水晶具有“封印”功能，卻不知道這些黑水晶全都是千年魔獸在與英雄指揮官秋山遼戰鬥之時就為復活準備好的——高純度的黑暗種子！
一枚枚黑水晶飛起，不斷粉碎匯入赤色龍頭那不穩定態的機體中。千年魔獸的軀體不停脹縮，變得更加龐大，氣勢一升再升！
這時，暴君神威的粉碎之錘（hammerofmj?lnir）已到，粉碎一切的古樸巨錘將千年魔獸增加的資料軀體一擊粉碎。
無限再生能力發動，缺損的軀體開始恢復。“真是有力的攻擊~！”千年魔獸狡黠地嘀咕著。它龐大的身軀在zone碎片中移動，身後是浩浩蕩蕩，彷彿倦鳥歸巢般飛來的無數黑水晶。
“不好，它要逃了！”蒼沼切羽叫道。
所有人開始對千年魔獸發動圍攻，莫斯提獸試圖用混沌降階（chaosdegrade）阻擋千年魔獸，可從過去復甦智慧的千年魔獸同樣是操縱時空的大行家，此時破碎的rainzone到處時空亂流肆虐，也對施展時空技能非常不利。
天國裁決（thekingdomofheavenaward）的白虹與恆星粉碎者（burningstarcrusher）的火炎巨劍同時到達，林中仙女獸的攻擊接踵而至。然而這些必殺技都未能對千年魔獸造成多大傷害。
均分空間(sharingspace)！！
千年魔獸周身彷彿裹著一層空間風暴，綿密細碎地分割著每一寸空間，讓rainzone粉碎的更加徹底。它龐大的身軀已經“擠”入時空夾縫中，就要順著時空亂流漂流到未知的地方。
這時，一道綠虹跨越時空而來——陸峰引導的小數之門攻擊終於抵達！瑩綠色的資料洪流組成環狀的柱形通道，在一片混亂的時空夾縫中構建出一個穩定的能量傳輸線路，然後一舉投射過來。
時空亂流中最後傳來又一聲怒吼，就漸漸沉寂。破碎的常雨大地依然暴雨傾盆，只是如碎裂的彩圖玻璃，一片一片凌亂地對接著。雨落無聲，像一臺失真的放錄機。
“千年魔獸死了嗎？”林中仙女獸問道。
陸峰搖頭，千年魔獸的存在形式十分特殊，並不是單純力量能夠殺死的。
rainzone一役後，暗黑騎士獸與魔女音音全無訊息，數碼世界七大勢力之一的twilight一夜之間轟然倒塌，立刻引起其他勢力的爭奪。就連一直隱藏的美樹原洛倫也帶著被奴役催眠的武器種族現世，大肆侵奪twilight的zone。巴古拉軍龐大的戰爭也開始發動，七將軍以比三元士還要霸道的姿態揮軍發動一場場戰爭，與三色指揮官發生劇烈的摩擦。而尚數無主的幾個zone則成了大家爭奪最激烈的地方。