卡卡西之前溝通了十二正經十二處重要穴位：上肢處，左右肩井兩處大穴、左右合谷兩處大穴、命門穴、關元穴；下肢處，左右足三裡兩處大穴、左右委中穴兩處大穴、左右湧泉兩處大穴。
1.肩井，肩部的最高處，此穴位是勾連查克拉海與忍者結印的重要紐帶。
卡卡西，肩井無損情況下，第一天僅用一個多時辰，就讓未受波及左臂經脈重新貫通！
2.合谷，人體四總穴之一，手背虎口位置。千鳥流可以自如在手中釋放，與此穴密不可分。
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卡卡西，前後用了三天的時間。一方面，卡卡西在肩井穴微量製造千鳥流查克拉，這時候千鳥查克拉就會響應原本的執行路線，感應合谷穴所在而漫流，開闢出新的、不穩固經脈；另一方面，普通查克拉隨後一點點滲透開闢的經脈，這一過程每進行到半個時辰便會停止，恢復查克拉、恢復精神力。
以卡卡西的精神意志程度，每進行這麼一次，都會無力癱倒在病床數個時辰：最開始，要三個時辰以上；到後來，一個時辰左右的懷疑人生。
痛苦，無疑是千鳥流查克拉響應穴位之間感應，在本已枯竭、或者壞死的經脈中開闢一條新的通道出來。那滋味，卡卡西可以很明確的說，生不如死！但就是在這個時候，卡卡西不可以選擇去死、更不能讓自己被擊垮，他還需要製造源源不斷的普通查克拉跟上千鳥流查克拉的腳步，將千鳥流這一次微量衝擊所開闢的經脈通道：去鞏固，防止退後；去滋養，防止萎縮！
3.命門，第二腰椎與第三腰椎棘突之間。與三焦玄關互為表裡，命門為表、三焦為裡。忍者只要有足夠的精神能量、肉體能量，製造源源不斷查克拉，查克拉便會透過命門流遍全身。
卡卡西目前只涉及到命門的程度，三焦根本無從下手，人體一切元氣聚集於此處溫煦五臟六腑、滋養生機。
4.關元，臍中下三寸，乃元陽出入的地方。
卡卡西十二經脈十二穴道中，最隱蔽、也是最陰險的一個穴道位置。因為關元穴就在查克拉氣海之下，故而，它也是卡卡西千鳥流最快釋放的穴位。若敵人只關注卡卡西的手腳，絕對會吃一個大虧。
5.足三裡，人體四總穴之一，外膝眼下量三寸位置。
卡卡西，微量千鳥流查克拉自關元而發，與足三裡自發產生感應。因為有了右臂經脈經驗，這一過程只比第一天打通左臂稍稍耗時。左腿足三裡穴位、右腿足三裡穴位，一共只是兩日出頭而已。
6.委中穴，人體四總穴之一，膝蓋背後正中心位置。
卡卡西，微量千鳥流查克拉自命門而發，與委中穴自發產生感應。過程，難以想象的慘烈。卡卡西傷勢最重，莫過於整個身後，眾多經脈都消融與血肉之中，不復存在。如果說之前數天的時光，卡卡西是在重新打通那些個枯竭、壞死的經脈通道，那麼之後的接近九日時間，卡卡西根本是在從沒有經脈的血肉中生生開闢出一條嶄新經脈出來！
對於邁特凱，對於三代猿飛日斬，僅僅是說的輕巧而已。邁特凱日後或許會體會這種極致的痛苦，因為他的八門遁甲開到後三門也是非人的極限；而三代猿飛日斬，作為忍界的教授，他從一開始就知道卡卡西的情況，他也明悟卡卡西重新成為忍者的艱難程度：如果這樣都可以重新站起，那麼日後自己讓出火影的位置，又有何未嘗不可！
第一次嘗試，是卡卡西在忍界的第一聲、也是最後一次的淒厲：“啊！！！”
聞訊趕來木葉醫療忍者、護士，面對的只是卡卡西大汗淋漓下冰冷無比的眸子，以及直抵心口所在的千鳥流長刃：“關門，謝謝！”
沒有任何的一絲的花裡花哨，卡卡西固然清晰地記著十二正經執行的全部基礎路線、固然命門穴與委中穴千鳥流查克拉有所感應。但這一次，再不會有殘存的經脈、破損的經脈作為依託。
卡卡西必須要將千鳥查克拉當作普通的查克拉一般操控，一點點從血肉中開闢查克拉經脈出來。當卡卡西一次性千鳥流查克拉無以為繼的時候，再以普通查克拉將千鳥流查克拉所開闢經脈牢牢佔據。
查克拉，真是一種神奇的物質，雖然普通查克拉遠遠不及醫療查克拉那麼的治療顯著，但長時間的普通查克拉保持供應還是起到了應有的效果。普通查克拉被開闢經脈就近的吸收，被千鳥流查克拉創傷的細胞得到了最好的恢復。查克拉自人體細胞提取而來，當查克拉重歸受損的細胞之後，細胞的生命性得到補充。
一天時間，卡卡西只做兩次的嘗試：命門穴至左腿的委中穴、命門穴至右腿的委中穴。一次嘗試，查克拉長達一天的溫陽。
卡卡西的恢復，完全是自己一個人在進行。醫療忍者？對不起，卡卡西暫時沒有這個打算。醫療查克拉的存在固然會減輕一定的痛苦，但這並不是卡卡西所需要的；醫療查克拉的存在固然會加快經脈的癒合，但這同樣不是卡卡西所需要的。
對於前者，這種深入骨髓的極致痛苦是磨練精神、純粹靈魂的不二法門；而對於後者，查克拉是精神能量、肉體能量的產物，帶有一個忍者最主觀、最直接的意志。卡卡西不會讓自己新生的經脈習慣於醫療查克拉的存在：忍界，別以為醫療忍者就不會殺人。對於那些隱藏在暗中的深深敵意，卡卡西能靠的從來只是自己一人而已。
作為擁有著這樣危險思想的男人，卡卡西查克拉的排它性未來必將前所未有的激烈：每日的千鳥流查克拉貫通經脈，每日的普通查克拉保持經脈，每天都可以感受到全新經脈的開闢、每天都可以精神力量的增強，卡卡西度過了一段最具有特殊意義的日子！
這是一場華麗到極點的蛻變，當卡卡西品味了這世界的最強物理痛苦時候，他終於是有了精神與肉體合二為一、二者產生最密不可分的聯絡。一旦徹底笑話此次的收穫，戰鬥神經必將更上一個臺階。
入院後第十日，卡卡西命門穴自兩腿委中穴經脈得到貫通；
入院後十三日，卡卡西命門穴自兩腿委中穴經脈得到穩定；
入院後十四日，卡卡西千鳥流查克拉自委中穴而發，與兩腳腳心的湧泉穴發生感應；
入院後十五日，卡卡西委中穴自兩腳湧泉穴經脈得到貫通；
在雷遁雷分身的攙扶下，第十六日清晨木葉的臨時醫院，沒有了旗木卡卡西的身影。這是卡卡西九尾之夜後，第一次靠自己的力量重新站起！