【支線任務：清除黑暗之根】
任務難度：Lv.20
任務簡介：清理拿著為了村子為藉口來隱藏心中貪念的黑暗之根。摧毀根部，拯救被當做實驗品的人。完成度越高，任務獎勵越高。
任務資訊：根組織比暗部隱藏得更深，所做的事也更加見不得光。他們以“寧錯殺，不放過”的姿態剷除村內外一切威脅。
任務期限：主線任務完成之前。
任務獎勵：隨機。
注：任務已完成，完成度80%。任務獎勵將於結算時一同下發。
……
當木葉暗部開始對團藏的勢力進行徹查時，這個來自大和的主線任務就已經完成。任務的完成度是80%，這也在林久的意料之中。
根部本來就是在暗部的基礎之中發展出來的，不少根部忍者都有著暗部身份，所以再怎麼清查，都不可能將根部忍者清理乾淨。
木葉有能力調查出這些人的身份，但也不會去揭穿。這無疑是在削弱自身的實力，所以這裡的徹查實際上是將參與到團藏實驗中的根部忍者清理。
而這些根部忍者失去了團藏的領導，跟暗部忍者沒什麼區別。林久也無法再進一步，那樣就是向木葉全面開戰了。
根部的徹查清理行動持續了一天多的時間。而木葉陣營的不少契約者透過自己的途徑參入到其中，得到了一些好處。讓他們對曉組織的來襲，加分許多。
至於木葉在這次事件重受損不少，這跟他們有半毛錢關係。
在木葉針對根部行動時，曉組織的空中堡壘一直停留在外，林久等人都沒有離去。
猿飛日斬已經在準備引咎辭職的事，並且開始為波風水門造勢。而木葉村外的曉組織空中堡壘彷佛就是壓在他們頭上的一朵陰雲，不免擔憂。
波風水門主動提出要來和曉組織的人商談，他看出曉組織的人既不對木葉有什麼行動，但又不離開，除了關注根部的處理情況之外，必然還有其他事。
木葉高層，以及那些家族的族長都同意波風水門的毛遂自薦。若是能輕鬆談判解決曉組織問題，波風水門擔任四代火影的事是沒跑了。
猿飛日斬在波風水門出發前特意還交代了關於大和的事。這老頭子還在想著有沒有機會將這個“木葉忍者”拉回他們木葉忍村。不管對方實力強弱，有木遁這個招牌在，對他們木葉就是一劑強心針。
“真的要跟我一起去嗎？”波風水門苦笑著看著身邊的旋渦久辛奈。
“哼，誰知道那小子是不是跟你真的有什麼關係。”旋渦久辛奈越看，越覺得鳴人和波風水門的相似，必須要搞清楚。
“幾位停留在這，還有什麼事嗎？”波風水門和旋渦久辛奈被天道分身帶上了空中堡壘。旋渦久辛奈無比好奇地打量著這座飛在空中的建築內部。而波風水門則是詢問正事。
波風水門和旋渦久辛奈都看到了紫色圈圈眼，一頭紅髮的長門。旋渦久辛奈眼神一頓，開口問道：“你也是旋渦一族的人？！”
她用的是疑問句，但語氣中十分肯定。這是她聽聞渦之國覆滅後，第一次見到自己的族人，有幾分驚喜。
長門只是衝著兩人微微點頭，隨即用天道雷罰這個分身對一個通道方向喊道：“鳴人，你老爹來了。”
本體在場，卻用分身呼喊，奇怪是奇怪，但問起來就是因為三代雷影嗓門大，聲音傳的遠。
聲音還在傳播，波風水門表情凝固，而身邊的旋渦久辛奈已經帶著殺氣舉起了握緊的拳頭：“好啊！”
“我與你們無冤無仇，為何要將我陷害於此。”波風水門聲音中包含冤屈。
“長門，你學壞了啊。”林久笑著對長門說道。身邊帶著鳴人，靠近這裡。大和與小櫻也是好奇的打量著被凋刻在火影巖上的四代火影，畢竟他們也是頭一回見到活著的四代火影。
特別是小櫻，她可是一路見證了鳴人的成長，怎麼也沒想到，這傢伙居然是四代火影的兒子。
“都是跟著赤大哥耳濡目染啊。”這句話長門也就是在心底默默說一聲。既然都被傳染了，長門自然知道林久的性格，這話要是說出來估計就要被拉去切磋一下了。
“鳴人，見到活著的爹媽高興吧。”林久拍拍鳴人的肩膀說道。
鳴人原本是挺高興的，但是聽到林久這話就沒那麼高興了。
“閣下這話是什麼意思？”波風水門有些懷疑自己的記憶，難道自己在外真有私生子。可是聽對方話語中的意思，這裡還有久辛奈的事，那就是不是私生子。可什麼時候有孩子的，他們本人怎麼不知道。
鳴人便將他們的來歷，以及經歷的一些事告訴了波風水門和旋渦久辛奈。這才讓兩人恍然大悟。
“難怪我們第一眼看你就特別親切。”旋渦久辛奈搓著鳴人的腦袋說道。這個時候的年輕旋渦久辛奈還沒有那種為人父母時的溫柔，搓得鳴人腦袋疼。
“難怪還有一隻九尾。等等，你們剛才說活著的……我們在你出生之後就死了？！”波風水門突然發現了林久話語中的盲點。
“你們聊吧。”林久沒給他們解釋這些的意思，讓他們自己聊。反正這個衍生世界已經被他改變成這樣，波風水門知不知道未來，都無所謂了。
波風水門夫婦、第七班三人圍在一起，交談了起來。當旋渦久辛奈得知波風水門居然是因為封印九尾而死，投去鄙夷的目光。讓你丫的學金剛封鎖你學的亂七八糟，連九尾都對付不了。
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旋渦久辛奈無法像初代火影夫婦那樣拿捏九尾，但天生的查克拉壓制，外加金剛封鎖，控制住暴走的九尾還是輕輕鬆鬆的。旋渦久辛奈只能一錘地板，可惜自己產後虛弱，否則錘爛九尾腦袋。
“你們都交談的差不多了吧。我們該說說正事了。”林久打斷和自己未來兒子聊個不停的兩人。
“果然有事啊。”波風水門決定看在自己兒子的份上，若是不是什麼過分的事他都可以答應。
林久：說得你有拒絕的實力一樣。
“這件事跟鳴人他們有關，根據我對龍脈能量的研究，單靠這龐大的能量是無法將你們送過去的。所以需要一個時空忍術作為引導，將這股力量作用於時空方面，才能將你們送回去。所以，你那個飛雷神的苦無給鳴人一支帶著。”
林久給幾人簡單解釋了一下。他言而有信，說過會送鳴人他們回去，自然會辦到。這次木葉之行，大和的任務是一點，拿到水門的飛雷神苦無也是一點。這個衍生世界，樓蘭可是他們曉組織的地盤，波風水門沒有前往執行任務的機會，飛雷神苦無就只能上門來要了。
“原來如此。”事關自己兒子，波風水門自然沒有任何猶豫，拿了一支苦無交給鳴人。從鳴人口中，他對曉組織也有了更多的瞭解，有了幾分好感。