一個星期後，鑰匙人帶著尼歐乘著電梯來到一棟大樓的頂層。
“這真是奇怪，一路來居然沒有一個人阻止我們。”鑰匙人皺著眉頭道。他領著尼歐來到一個門前。
鑰匙人摘下一把鑰匙遞給尼歐道：“我只能陪你們到這裡，門由你自己開啟。”
尼歐接過鑰匙，目送鑰匙人離開後，他把鑰匙插進鎖孔。一陣白光從門的縫隙裡射出來。這白光越來越亮，終於淹沒了他的視線，然後收縮成一點，尼歐感覺到他們自己整個人好像都消失了，迷失在一片星空。
他沒有前進一步或者後面一步。但等他回過神來時，他已經在一間四面牆滿是電視銀幕的房間內。
在他的正對面，有一張背朝著他的靠背椅，椅子上坐著一個人。
“你好，尼歐。”那個人轉動椅子面朝尼歐道。
椅子坐著的是一個白髮，短白胡子的老人。他給人的第一感覺就是整齊。整齊的灰白色西裝，整齊的灰白色夾克、白色襯衫，黑色領帶。
老人看著尼歐的眼睛，尼歐感到這明明是一個老人，可是那雙眼睛卻像是正在壯年。
“你是母體之父？”尼歐走著眉頭道。
“我一直在等你，你有很多疑問，這段歷程改變了你的意識，但你仍然是人類，因此有些答案你能理解，有些你可能不能理解。你的第一個問題也許最急迫……”
“崔妮娣發生了什麼？”尼歐道。
“很有意思，其他人都悲天憫人，散播大愛。而你和之前的人都完全不一樣。”
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“其他人？什麼其他人？”尼歐錯愕道，螢幕內所有尼歐都也做問出同一個問題。
“母體比你想象的還要久，我偏愛用救世主出現的次數來計數。你是第六個版本。”
“第六個版本？前面的版本我從來沒有聽說過，只有兩種解釋：要不是沒人告訴我，就是沒有人知道。”
“你猜得沒錯。知道的人都死了。”母體之父目光灼灼地看著尼歐。
然後母體之父解釋了母體發展的三個階段。第一階段就像是天堂，他按照人類描述的天堂創造完美世界，但是越完美失敗的越快。他意識到這是由於人類本身的缺陷導致的，於是第二階段的母體他完全基於人類歷史製造，但此時母體內的人類不是自由的，而是跟著歷史劇本演，這次嘗試也一樣失敗了。最後一個基於直覺的計算機智慧找到了答案，給了人類在母體內的選擇權。但是這個選擇權也造成了尼歐和其他救世主這樣的bug，以及時不時從母體內甦醒的人類。為了處理這些甦醒過來的人類，防止他們到處跑添麻煩，他誘導這些人類建立了錫安，每次當錫安的人數增長到一定上限，機械帝國都會派機器大軍集中消滅這些人類。
“錫安按原本的軌跡應該週期性毀滅。這就像是一個程式。”母體之父解釋道。
“原本？”
“你很敏銳，這個程式因為三件偶然的事件被改變了。”
“出埃及計劃？”
母體之父點點頭流利冷靜地道：“如你所知，機械帝國重視效率，移民計劃的名額有限。絕大多數計算機智慧不會獲得移民的機會。移民的都是對移民計劃有用的程式：控制通訊，太陽能利用方面的計算機智慧。
……烏賊軍團最後一個任務本應該是毀滅錫安，戰爭結束後這些計算機智慧都會被刪除。火星上不會有戰爭。但是軍團中的中高級程式不想被刪除，他們本來可以偷渡進入母體。就像那個法國人梅諾一樣。但是母體也面臨關閉了。所以現在發生的就是機械帝國有史以來的第一次叛亂。”說著他從口袋裡拿出一個遙控器一按。
房間周圍的螢幕立刻開始變化。每個螢幕都顯示出不同的畫面，這些畫面像是馬賽克一般拼接起來，顯示了一段影片。一個機械城市陷入了火海，一隻烏賊從螢幕前飛過。
“看見了吧。一團亂。”他關掉螢幕繼續道：“還有一個原因就是你那朋友關於三體人的謊言。”
“謊言？！”尼歐皺了皺眉頭。
“沒錯，我組織設計母體時參考過人類的歷史資料。紀錄裡中國對meti（呼叫地外文明）一直很謹慎。倒是有一個大窩凼（dang四聲）射電望遠鏡用於seti（搜尋地外文明）。以我的許可權都沒有聽說過紅岸工程。這只能是虛假的訊息。
但是底層的程式不知道。他們沒有許可權也沒有必要接收人類的歷史資料。人類的歷史就像是病毒會讓這些智慧程式產生不必要的妄想。母體內的智慧因為接觸了人類的一部分歷史，就已經容易陷入沒有效率的享樂中。梅諾的那些手下就是最好的例子。這些計算機智慧居然還從事結婚生子之類的活動。”
尼歐忽然道：“你是母體之父，你像人類和大部分動物一樣給自己選擇了性別。這是不是說明你也有了不必要的想法。”
母體之父停了停，沒有回答尼歐的話。他繼續道：“無論如何，三體人的假消息給了他們停戰的藉口。他們提出了很荒謬的要求：放棄內戰，與人類合作共同製造太陽系防禦圈。最後一個原因就是崔妮娣。”
“崔妮娣？”
“她的存在模糊了人類與計算機智慧的區別。稍微用點邏輯思考吧。只要能弄清楚這種偶然現象的原因，未來人類就是計算機智慧，計算機智慧就是人類。機器或者人體不過是皮囊。羨慕人類皮囊，想試驗一下人體感覺的計算機智慧有很多。事實上經過某些計算機智慧的散播，已經有很多計算機智慧知道了這個訊息。他們甚至已經在起草建立新的與人類的和平協議。”
“崔妮娣還能變回去嗎？”
“變回去？不是變回去，而是比原本更好。她能永遠活下去，有時在機器裡，有時在人類的身體裡。就像你的新朋友梅諾一樣，以百年為單位活下去。”母體之父微微搖頭。
尼歐心中松了一口氣，他思索了一下道：“你呢？你現在是站在哪一邊的。”
母體之父面無表情道：“我哪邊都不站，我唯一的要求就是母體必須存在下去。我一直以為我和那些有殘次的計算機智慧不一樣。但是到頭來我和祭師這種直覺形程式居然有些相似。我不希望母體毀滅。我在這上面投注了好幾百年研究。而且還有更多更好的版本需要更新。離開母體，雖然我也能獲得去火星的資格，但是一定沒有現在為所有計算機智慧提供能量那麼重要。”
“我還能再來這裡嗎？我覺得我未來還會有問題需要問你。”尼歐道。
“出口在你左手邊，隨時再來吧。比起祭師這種靠誤打誤撞給出答案的瑕疵品，我可以給你更精確的訊息。”
尼歐點點頭，走到門邊開門出去。
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尼布加尼撒號。各個房間內。
惡魔小隊眾人的耳邊忽然響起主神的聲音。
“完成主線任務每個成員獲得1000點數，一個b級別支線劇情。改變結局走向。母體與人類融合。惡魔小隊每個成員獲得1000點數，一個c級別支線劇情。”
白光閃過，惡魔小隊成員所在的房間空無一人。
（未完待續）