本部的醫院內。
在電力恢復，影片系統也恢復工作之後，按照美里的指示，醫療隊與工程隊第一時間對殘存的EVA們進行了回收，將四名適任者從插入栓就出後，EVA與駕駛員們分別被送往了不同的區域進行下一步處理。
司流這幫駕駛員畢竟是人類，這個世界的科技又很發達，只要還有口氣，基本就能救回來。而EVA們則不同，雖然徹底放開限制的話也能令殘肢斷臂如同使徒一般快速回覆，但是能夠有效控制它們才是最根本的目的。
因此總體上來說，對於EVA的修復可能比駕駛員們的療傷還要慢一點。
四名駕駛員全部存活，但是除了司流以外都處於昏迷狀態，只有司流自己是清醒的。
當然了，這並不代表司流的傷最輕，他的左臂發生了嚴重骨折，頭上也被打了一個大包，沒昏過去只是因為他是玩家而不是劇本中人物，痛感遭到了壓制而已。
傷勢最重的是綾波麗，胸腹間有貫穿性傷口，以及嚴重的出血。明日香的雙臂都有骨裂現象，當然相對於其他人算比較好的了，頭部的輕微腦震盪也不難治療。
最完好的則是碇真嗣，基本上一點傷都沒有，起碼一點外傷都沒有，但是自從昏迷中甦醒過來後，他就一句話都沒說，眼神呆滯，如同木頭人一般，也不知道是不是在初號機的暴走中受到了精神創傷，或者生吞萬翼天使的舉動太過噁心。
總而言之，在數小時之後，司流等駕駛員，以及指揮官美里，副司令冬月，都集中在了一間手術室前，門上亮著代表手術中的紅光。
司流的腦袋被包紮地嚴嚴實實地，左手打著石膏吊在胸前，來回踱著步子。明日香稍微好一點，雙手扎著繃帶，像骨裂這樣的輕傷很容易治療，垂著頭不知道在想什麼。
冬月依舊沉靜如常，站在窗邊望著窗外，美里則是叼著一根煙，高跟鞋時不時地在地上敲出一點響聲。
至於真嗣，他正坐在不遠處的牆角，身上的衣服都是別人幫忙換的，頭伏在雙膝上，眼神空洞。
冬月跟美里都已經在這裡等了許久，碇司令也來過，但是在司流他們來之前就離開了。司流跟明日香的傷勢都沒怎麼費時間，且不需要臥床靜養，因此也在包紮好後就拉著真嗣來到綾波麗這邊。
時間過去越久，他們的心情也就越著急，生怕會得到醫生的壞消息，尤其是司流，他嘴裡不停地用別人聽不到的低聲唸叨著：“身子我都看過了，所以一定不要死在我面前啊，不然我怎麼對你負責啊……”
又過了一會兒，終於，手術室上的紅燈滅了，進行手術的醫生們隨即走了出來。
“醫生，她的情況怎麼樣？”美里忙問道。
“副司令先生，指揮官女士。”主刀醫生嘆口氣道，“暫時沒有生命危險了，但是她失血過多，傷口又傷到了內臟，能不能醒過來，我也不能確定……我們盡力了。”
說完後，醫生便離開了。
這幫人可都是有文化有修養的人，不可能做出威脅醫生之類的事情，僅僅是對視幾眼後，便進入到了手術室中。
綾波麗正躺在一張病床上，身上蓋著雪白的被子，但是她的臉色比這被子還要白，表情平靜如常，呼吸卻微弱的難以察覺，一隻手露在外面，上面插著好幾根管子，紅的白的透明的，旁邊的機器上，心跳的曲線也極其微弱。
“你這個傻瓜……”明日香的聲音有些哽咽，“明明是個木偶，待在那邊就好了，幹嘛要衝過來啊！把自己搞成這樣，就讓我中槍就好了啊，我又不像你這麼脆弱！傻瓜！”
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“你冷靜點！”美里拉住她，“麗是拿你們當作同伴，才會做出這樣的舉動，她是為了保護你們啊！”
“哎，這孩子，從來就不會為自己考慮……”冬月嘆口氣道，臉上的皺紋似乎更深了。
司流站的位置最靠前，他的手藏在口袋裡，緊緊握著生死輪盤，心說：“你們要是不在這，我就兩槍把麗救回來了！只是如果當著你們面這麼做的話，恐怕我會先被抓起來，然後慢慢切片研究吧……”
就在現場氣氛被渲染地極為悲情的時候，一陣劇烈的震動傳來，使手術室內的人們連帶著病床都晃動了幾下，司流忙一手摁住床頭，生怕綾波麗摔下來。
幾乎是在同一秒，病房外的紅色警報燈亮了起來，刺耳的防空警報也響起，迴盪在整個本部當中。
“怎麼回事？難道那不知名的使徒還活著？”美里道。
司流張張嘴，但卻不知道該怎麼回答，他自然知道萬翼天使已經被吃乾淨了，不可能再活過來，初號機的主角光環也不會允許那種事……但是轉念一想，這些東西不應該是一個未成年的駕駛員所能知道的，所以終究還是沒說什麼。
美里拿起腰間的電話，摁下一個鍵道：“什麼情況？為什麼有警報？剛才的震動是什麼？”
隨著電話那邊的聲音，美里的臉色變得越來越難看，她放回電話，看著冬月到：“副司令，我們需要馬上回指揮室。”
冬月看了她半秒後回道：“當然。”雖然年紀大，但是他走路的步伐很沉穩。
在離開這手術室的大門前，美里又回過頭問道：“你們，傷的怎麼樣，還能打麼？”
司流跟明日香對視一眼後立刻回道：“沒問題！”
“那就一起來！麗在這裡不會有問題的，前提是……我們能活下來。”美里道。
在出門的時候，司流看到真嗣居然站了起來，而且位置靠近了房門一點，他停下腳步問道：“有情況，真嗣，你狀態最好，快一起來！”他心說：初號機可是剛吞下了一個使徒，這下子連S機關都有了，還不是天下無敵？再來啥使徒都不會是完全體初號機的對手啊……
然而真嗣只是抬頭看了他一眼，什麼話都沒說，什麼動作也都沒有，眼神宛如一個死人。
“別管他了，他一直這樣！簡直跟你一樣廢柴！”明日香喊道。
“喂，我還在這呢好不好，當面說我廢柴啊？我可是救過你！”司流回道。
眼看美里逐漸走遠，司流又看了真嗣一眼，嘆口氣，無奈地追了上去。
指揮室中。
美里一腳踹開門，人還沒進來聲音便先傳了進來：“什麼情況？是誰這麼大膽敢突襲我們！”
“美里上尉，身為軍事指揮官，怎麼能沒有點指揮官的樣子？你要更成熟一點才行。”碇司令道，他已經回到了自己的位子，雙手仍舊像粘在下巴上一樣。
碇司令的話剛說完，門又被踹開了，這次進來的是冬月副司令，嘴裡還在罵罵咧咧的：“是誰這麼不長眼，敢來打我們？不想活了麼？”
碇司令於是不發表意見了，好在他臉黑又帶著眼睛，在用雙手擋住半張臉，位置又高，別人也看不到他臉紅。
整個指揮室也是一片戰爭一般的分為，甚至比萬翼天使入侵時來的更嚴重，每一個螢幕都在閃著紅光，技術人員們也更加焦急與忙碌。
因為使徒他們見的多了，打敗了起碼五六個，本部還沒有遭受過太大的威脅。
然而這一次，本部遭到了直接的入侵，因為他們面對的不再是使徒，反而是……人類。
本部的地形圖上顯示，有一小部分已然變成了紅色，也就是被入侵失去了控制權，這紅色的區域還在進一步擴散。
“怎麼回事？他們到底從哪裡進來的，為什麼我們沒有提前預警？這幫傢伙又究竟是什麼人！僱傭兵？還是哪國的軍隊？”美里一拍桌子吼道。
技術人員猶豫了兩秒才回道：“美里上尉……因為之前使徒的戰鬥，我們的部分設施遭到了破壞，本來用作第一層防禦的地面城市也全毀，所以……”
“可惡，為什麼前腳有使徒降臨，後腳就來了……他們到底是什麼人，查清楚了麼？”美里又道，橫眉倒豎。
隨著技術人員的幾下操作，螢幕上出現了一幅畫面，裡面是一小隊人，全副武裝，手中端著漆黑的槍械，腰間胸前也掛著各種武器，帶著黑色頭盔，一身黑衣，沒有任何標誌，而畫面的最後一幕，就是其中一人朝著鏡頭的方向扣動了扳機。
“是他們。”碇司令沉聲道。
在碇司令身後，冬月不知道什麼時候又站在了他的老位置，這年紀一大把的老人行動倒是很麻利。
“是……SEELE麼？”冬月道。
“沒錯，只有他們，才能這麼準確地找到我們的位置，並且知道使徒的降臨。”碇司令道，“他們總算忍不住要動手了。”
“但是僅憑這些人馬，不足以對我們造成太大的威脅。”冬月道，“雖然EVA也受創嚴重，但只要有一臺能行動，就能將他們全滅。”
他的話音剛落，又一陣更急促的警報聲響起，螢幕的地圖上，一列紅點快速飄過，向著城市的方向靠近過來。
“警報！有新的目標出現！速度很快！而且這個訊號……”技術員妹子道，她確認了下引數，臉色變得有些難看，“是使徒！不止一個！”
“想不到，他們瞞著我們，居然能做到這一步啊。”冬月道，“看來之前進攻的那個使徒，很可能也是他們的手筆。”
“畢竟是SEELE，這樣的陣仗才是撕破臉應有的態度。”碇司令起身，走到他那專屬的升降電梯上，“那麼冬月老師，下面就交給你了。”說完，他再一次沉下，很快消失在了眾人的視線中。
冬月看著碇司令慢慢消失，嘆口氣，輕輕搖了搖頭，接著看著臺下說道：“美里上尉，行動吧，行使你軍事指揮官的職責。”
“哼。”美里咬牙，“EVA的修復進度怎麼樣了？”
“零號機受損嚴重，目前修復進度百分之四十，短時間內無法出戰。”
“初號機修復進度百分之百。”
“二號機修復進度百分之九十四，可以出戰。”
“四號機修復進度百分之七十五，但是損傷主要在頭部，暫時無法出戰。”
“很好，兩臺EVA，對付那些使徒問題應該不大。”美里一回頭，“明日香，真嗣，你們上，外面來的使徒就交給你們了……”她的聲音突然頓住了，“真嗣呢？”
“他估計還在綾波麗的病房那吧。”司流道，“而且，他的狀態好像也不怎麼適合出戰。”
“是麼，偏偏在這個時候……”美里皺眉，“但是只靠明日香自己的話，敵人的數量有些多啊……”
“放心吧，我不需要那個廢柴的幫助，我跟我的二號機無所畏懼！”明日香拍拍挺翹的胸脯，順手拆掉了手上的綁帶，指頭捏得咔吧作響，“正好我憋了一肚子的火氣需要發洩一下呢，不是就幾個使徒麼，就交給我吧！”
“你小心點，隨時撤退，我們沒必要跟他們硬拼。”美里囑咐道。
“放心，我有數。”明日香說著，一臉殺氣地向著EVA的區域走去。
“你的四號機暫時還不能用。”美里說著，朝司流遞過來一把手槍，“這個拿著防身，保護好自己，我可不能人手再有一個手下變成麗那樣。”
司流沉默著接過槍，這是一把馬卡洛夫手槍，倒是挺符合美里的身份，雖然只是普通槍械，但是對手也只是一般士兵，用這樣的武器也沒問題，雖然在司流看來只比沒有武器好一點罷了。
“所有人，進入一級戰爭狀態！”美里提高了音量，大聲喊道，“這次敵人欺負上門了，我們何時受到過這樣的侮辱？都拿上你們會用的槍，能拿多少拿多少，看到不是自己人的，儘管給我開槍！子彈管夠！平時去靶場打靶不是都嫌不過癮麼？這次一次讓你們射個夠！”
雖然在場的人們中技術人員居多，但是同樣會玩槍，很快已經各自拿上武器，至於本部的護衛就更不用說了，早已經跟入侵者交手了……（未完待續）