眾人聽得公孫勝之言，都是紛紛附和，晁蓋滿意的的點了點頭，又與眾人說了一會話，然後便叫眾兄弟散去了。
但是晁蓋卻是將太學狂生呂將，鐵算公聞煥章，小留侯許貫忠，智多星吳用，豹子頭林沖，小關羽雲天彪，神機軍師朱武，大刀關勝，花和尚魯智深，寶光如來鄧元覺，小羅成唐斌，布衣人鏡歐陽澈，浩然書生陳東，文麴酒仙婁敏中和八斗書生祖士遠幾個人留下來。
眾人來到了晁蓋的書房裡，紛紛坐定，看著人都來齊了，晁蓋這才說道：“幾位兄弟，我梁山水泊如今興旺發達，蒸蒸日上，上承天命，叫我大小一共一百五十二員好漢聚義梁山，人才濟濟，如今我群眾聚義，俗話說無有規矩，不成方圓，從今日起我梁山便可稱之為義軍，再也不是落草為寇的山大王了，所以說這山上的職務安排我們應當抓緊時間商議出來一個結果。”
聽得晁蓋之言，書房裡的幾個人都是贊同的點了點頭，他們也知道晁蓋留下他們是什的意思，一個個面色凝重，因為這可不是一個簡單的安排就好了，老資歷的，新入夥的，功勞大的，能力高的，都需要考慮，而且相互之間的配合，性格搭配也都在考慮的範圍內，一不小心便會出現差錯。
接下來的半個月的時間裡面，晁蓋等人都是在商討著山上各個頭領的安排問題，一連過去半個多月，將近二十天，這才最終定下了一個職務名單。
當下，晁蓋便選定良辰吉日，在聚義大廳擂鼓聚將，三通鼓響，梁山大小頭領全都來到，檢察院的檢察長布衣人鏡歐陽澈親自查點了頭領人數，無誤之後，來到晁蓋近前，拱手施禮，說道：“回稟哥哥，梁山大小頭領一百五十二人全都到齊，無一人缺席。”
晁蓋點了點頭，然後朗聲說道：“眾位兄弟，我梁山英雄一百五十二員好漢聚義梁山，可以說人才濟濟，龍虎英雄會，但是俗話說無有規矩，不成方圓，我等需要擬出一個章程來，安排職位，各司其職。”
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“我等謹遵哥哥將令！”晁蓋話音剛落，聚義廳上眾人便朝著晁蓋沉沉的一抱拳，齊聲說道。
晁蓋見得眾兄弟的回答，滿意的點了點頭，然後看了看旁邊的政務院秘書司司長聖手書生蕭讓，說道：“蕭讓兄弟，便有你宣讀我梁山各頭領的職務安排。”
“是。”蕭讓應了一聲，然後站了出來，將早已經寫好的黃紙拿了出來，開始宣讀梁山軍馬的改編和頭領職務。
梁山軍馬改編為梁山人民軍，託塔天王晁蓋擔任梁山軍人民軍大都督，掌管梁山人民軍管轄範圍之內的所有軍政大權。
設立政務院，由左右僕射負責，右僕射由鐵算公聞煥章擔任，左僕射由文麴酒仙婁敏中擔任；政務院下設八個部門，秘書司司長聖手書生蕭讓、財政司司長神運算元蔣敬、商業司司長飛天虎扈成、外交司司長小旋風柴進、教育司司長浩然書生陳東、農業司司長八斗書生祖士遠、醫療司司長閻王敵範百齡和後勤司司長笑面虎朱富。
另後勤司下設伙房署，由小庖丁武植負責；庫房署，由母大蟲顧大嫂負責；農牧漁場，由菜園子張青和母夜叉孫二娘負責；獸醫署，由紫髯伯皇甫端負責。
設立軍務院，軍務院的領導機構是軍機處，也就是之前的梁山軍事委員會改編的，軍機大臣設定為十三人，分別是太學狂生呂將，小關羽雲天彪，鐵算公聞煥章，智多星吳用，小留侯許貫忠，神機軍師朱武，豹子頭林沖，賽秦瓊王進，大刀關勝，鬚眉俠士蕭嘉穗，入雲龍公孫勝，賽雄信劉廣和混江龍李俊。
軍務院下設八個部門，分別是參謀司，政治司，裝備司，後勤司，編練司，軍法司，情報司和警備司。
參謀司的作用概括起來無外乎兩點：一是輔助決策，或者說決策支援，也就是作為軍事主官的大腦，負責蒐集處理資訊、制定計劃、對企業戰略和管理的重大問題進行專案研究；二是監督決策的執行，也就是作為軍事主官的耳目，對決策執行的各環節、各階段進行跟蹤考察，將各執行部門的情況及時分析、反饋到決策層，結合外部環境的變化提出意見和建議。
參謀司由鬚眉俠士蕭嘉穗出任總參謀長，神機軍師朱武，小留侯許貫忠，太學狂生呂將，入雲龍公孫勝和女諸葛劉慧娘擔任副參謀長，其他參謀數目不等。
政治司的作用在晁蓋看來就是讓將士們明白他們是為了什麼而參軍，為什麼而戰鬥，保證梁山最高首腦的路線、方針、政策、指示在軍隊軍隊中的貫徹執行，保證梁山人民軍統帥對軍隊的絕對領導，保證三軍在思想上同人民軍的目標保持高度一致。
政治司的司長依舊是智多星吳用，政治司重中之重，而吳用又是梁山元老級別的人物，晁蓋讓他掌管政治司，就是間接的控制了梁山軍隊的大腦，到時候即便是有哪一個將領想要造反起義，他手底下的士兵也是不同意的，這就從根本上解決了類似“趙匡胤黃袍加身”的事情。
裝備司的作用就是負責梁山人民軍的裝備的研發和裝備，可以說梁山軍隊的所有武器裝備全是由裝備司調撥的。
裝備司的司長是賽雄信劉廣，劉廣原先是沂州的防禦使，管理能力有目共睹，而且劉廣如今年紀也是稍微有一點大了，已經過了壯年時期，再讓他征戰沙場有點不合適了，所以晁蓋便安排了劉廣擔任裝備司的主官，負責全軍的裝備，也可以說是人盡其才。
裝備司還下設兵器署，由金錢豹子湯隆負責；火炮署，由賽公輸呂恆負責；戰船署，由玉幡竿孟康和巧匠葉春負責；戰馬署，由金毛犬段景住負責……旌旗袍襖署，由通臂猿侯健負責。
後勤司顧名思義便是負責梁山軍隊中的後勤工作，包括軍隊中的糧草，軍餉，醫務，軍隊農場牧場漁場等工作。後勤司司長是鎮三山黃信，後勤司還有一個兩萬人的農墾兵團，就是專門負責軍隊後勤的保障工作的，都是戰鬥部隊中傷殘不能復員的戰士們組成，為梁山的軍隊再次的發光發熱，這也解決了軍隊軍士的去留問題。
編練司便是負責梁山軍隊的招募，新兵訓練以及俘虜轉化的工作，所有新兵必須在編練司訓練至少兩個月的軍事和思想當面得訓練，經過考核之後才能進入戰鬥部隊。
編練司的司長是原八十萬禁軍總教頭賽秦瓊王進，對於如何訓練軍隊王進可是這方面得行家裡手，而且王進也是年紀大了，便讓他掌管編練司，負責梁山軍馬的招募訓練工作。
編練司不能只有王進一個總教頭，下面還有七個教頭，分別是毛頭獅厲天佑，險道神鬱保四，操刀鬼曹正，摸著天杜遷，雲裡金剛宋萬，獨角龍鄒淵和出林龍鄒潤。
軍法司是軍隊的軍事法庭，負責監督軍隊違法亂紀的部門，軍法司的司長是寶光如來鄧元覺，鄧大師梁山泊的元老，自打晁蓋上山便一直跟著晁蓋，資歷威望梁山沒有幾個人能夠比得上，而且為人最是不知變通，一就是一二就是二，鐵面無私，便是花和尚魯智深見了頭皮發麻，讓他擔任軍法司的司長在合適不過，而且軍法司的工作性質不同，需要有一個武藝高強的人坐鎮，無疑，鄧元覺是一個合適的人選。