黑暗迪迦跟隨著珈亞斯消失了，只有大古知道，他們還在地球上，當齊結拉的花朵開滿整個地球時，在迪迦奧特曼陷入絕境時，黑暗迪迦出現了，小狗怪獸賽迪也出現了。
三個巨人同時對戰齊結拉的花朵，因為大古，正木敬吾是光也是人類，所以，齊結拉的花粉對人類有用，在三人的聯手下也慘敗被徹底焚燒。
黑暗迪迦本來與大古是死敵，但在林天的干預下，沒有內耗，全力對外，
如果人類滅亡了，他們的對決沒有任何意義。
“我說，你別裝深沉行不行，明明就一小屁孩，該整天擺出副撲克臉，一點都不像。”正木敬吾雖說成了林天的僕人，可嘴上從來沒有尊重過，手中逗弄著白色的小狗，後者微憨，吐著舌頭舔著手心，直癢癢。
精緻的眼眸轉了過來，厲色一閃，滔天的煞恐怖氣籠罩了敬吾君，世界成了一片血色，彷彿置身地獄，被屍山血海包圍，無數只骨手自血海深處，把他拖入無盡黑暗，虛空，深淵……體內的光之力量絲毫發揮不出。
這是……什麼力量？！
正木敬吾恍然驚醒，一身冷汗，眼眸露出驚恐，彷彿看怪物一般，自藤椅站起來瘋狂大吼，
“你是誰！不可能是光！你絕對不是光！到底是誰？你不是人！！”
“…………，你才不是人，你全家都不是人！一點障眼法而已，大呼小叫，是對你不尊的懲罰，就算是這個星球~”
林天眼中露出譏諷還有冷酷嘲笑，湊近正木敬吾耳邊，血液開始凝結，冰冷的輕笑迴盪。
“捏爆它，也不費太大功夫。不過，我沒興趣。”
果然正木敬吾臉果然成了鐵青色，惡魔，恐怖邪惡的惡魔！大古那笨蛋到底惹了一尊什麼樣的存在啊！這蠢貨，被人賣了，還在替人數錢呢！
“別瞎猜了，你那點小心思我都知道，最終的黑暗即將甦醒，而你，端木君，人類面臨滅種絕族的危機，會怎麼辦呢？在能量耗盡之前必須解除變身，不然你會失去變成光的能力。”
“是神！就去拯救你的子民吧！他們需要你的力量。”
正木敬吾睜大眼睛，窗外，無數的鳥形怪獸飛舞，瘋狂破壞人類的城市，最終之戰的帷幕正式拉開！
“你要怎麼樣才肯出手幫人類？”
敬吾君銀牙一咬，詢問林天，發現他早已消失了，而他絲毫沒有察覺。
“不用我幫，人類自會渡過難關，只要心有希望之光。”
正木敬吾和白毛小狗賽迪化光飛走，屋裡林天的身影現化，資料流轉後身影出現，臉露沉思。
“齊結拉的花苞被我偷走，幻世花粉應該對分身有進化作用，夢的力量，能毀滅一個文明的幻術還是有點用處，其它神話級怪獸，手裡也多出了幾張神話級別卡僕怪獸，聯體怪獸【梅珠拉?】長的很醜，醜到看一眼就要爆掉的境界，【查利加?,亞那加基?】三隻怪獸為護教之獸。不過最終的黑暗的支配者，哼~成為我的奴隸吧！”
層層濃厚的黑暗遮天蔽日，更加極致的黑暗力量開始侵蝕地球的每一處角落，遠處看地球，正在被黑暗快速吞噬著。
“佐加，雖然也有神話一二星實力，只不過受黑暗支配者加坦傑厄控制，收服很難，算了，見機行事，我看上的東西，沒有得不到的。”
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……
“麥格斯動力系統，只有它才能追上佐加。”
麗娜喃喃自語，可是隊長命令她不許再駕駛勝利飛燕1號飛機，她就開始打白雪號的主意，沒有人知道她到底要幹什麼。
剛剛走出飛機庫的麗娜正巧被大古看到，大古叫住她問，
“你為什麼總是躲著我，是不是自己做錯了什麼，”
麗娜回過頭，用含淚的眼睛看著他，要說什麼卻說不出來，最後一轉身哭著走了，大古看著她的背影不知所措。
與此同時，正坐在由新城駕駛的海豚0號裡到紐西蘭海底進行勘察的崛井發現這座海底宮殿正如隊長所說的，不像人類所建造的，可那會是誰呢，三千萬年前，那麼遙遠，誰會在這裡建造。
大古與麗娜接到隊長的命令後，麗娜立刻駕駛著白雪號帶著大古返回基地，在返回基地的路上，他們發現世界已被籠罩在一片黑暗裡，麗娜不禁擔心起來，問
“大古，這次，我們能贏嗎？如果我們的命運註定滅亡，大古說這算什麼命運，他們一定要改變它，”
麗娜受到大古的鼓舞，不禁點了點頭。還沒進入基地，他們就驚見基地已被黑霧籠罩，他們趕緊進入基地。
此刻，基地內部的人也發現了異常情況，野瑞用電腦探測到一種不明物體從基地底下正在往上衝，可安全防禦系統卻沒有啟動，也沒有任何質量的反應，野瑞正在不知所錯時，大家又接到一個壞消息：
美國的TPC支部——布魯特隊全軍覆沒，那些佐加飛得比他們的戰鬥機還要快。
這時，大古與麗娜回來了，他們把基地被黑霧封鎖的事告訴給了大家，正在大家商量對策間，八尾博士突然慌慌張張地跑來說F4機庫出問題了，野瑞用對講機與F4機庫裡的職員進行聯絡，卻沒有應答，大家趕到事情不妙，宗方立刻帶著大古趕到F4機庫，
與此同時，從太平洋的海底突然冒出了一隻巨大的怪獸，它就是黑暗的支配者——加坦傑厄。
宗方與大古來到F4機庫，只見黑霧已逼近了F4機庫，F4機庫裡的工作人員正在慌忙逃跑，隊長趕緊命麗娜用電腦把亞克迪斯號調離F4機庫，麗娜把亞克迪斯號調上了號起飛軌道，澤井命F4機庫的工作人員都到亞克迪斯號裡去避難。
被黑霧籠罩的範圍在不斷地擴大，宗方把防禦門關上，可黑霧竟從門縫裡鑽了出來，用物理的力量根本阻止不了它，澤井見此狀況，不得不下令讓所有的職員到亞克迪斯號裡去避難，可吉岡卻不肯，他說誓死也要保住基地，決不能把基地拱手讓人，澤井生氣了，說勝利的前提條件是他要活著，正在兩人爭執間，麗娜驚見黑霧已慢慢逼進了司令室。
若再不走就來不及了，到了這時，吉岡也不得不聽從澤井的命令趕快撤離。
正當大家準備走出司令室時，麗娜突然注意到了大古的猶豫不覺，她叫大古，大古說他想一個人去，麗娜明白大古是想變成迪迦奧特曼去對付加坦傑厄，麗娜立刻阻止他，這時，隊長突然對澤井他們說，讓他們先走。
大家上了亞克迪斯號，八尾博士讓野瑞把麥格斯的動力充滿。司令室裡，隊長居間惠待澤井等人走後，上前對大古道，
“我剛看到迪迦奧特曼時還以為見到了上帝，後來才慢慢發現，原來迪迦奧特曼即是光也是人類！”
麗娜驚看隊長，她竟也知道了大古就是迪迦奧特曼。
隊長居間惠說“所以大古沒有義務去對付一個根本贏不了的敵人。”
大古一頓，突然轉身對麗娜和隊長說，
“也許人類還有一線生機，只要找到…珈亞斯！”
“就是帶走黑暗迪迦，還有賽迪的那個神秘巨人？！”居間惠若有所悟，“不過，自那一次之後，他就再沒有出現，有的只是黑暗迪迦和賽迪。怎麼找到他呢？！”
“不對，珈亞斯也出現過，還帶走了其它怪獸，查利迦,亞那加基。我可以感覺的到他的力量，深不可測，比之加坦傑厄更甚！”
正在這時，基地司令室的黑暗似遇到了死敵，瘋狂褪去，隨之光茫照耀，外界大放光明，蒸發成點點黑色菸絲消失，隱隱約約基地上空傳來一聲高昂龍吟，響徹雲霄，震懾八方。
冰藍光龍萬丈龍身盤曲在基地外，猙獰龍頭噴吐著光焰龍息，對抗外界濃厚的黑暗，藍金雙色龍息遇到黑暗如積雪剎那融化，龍息光柱去勢不減，天地為之一清，出現一條黑暗空洞。
巨龍見黑暗再次源源不斷覆蓋剛剛製造的空洞，便不作那無用功，口噴出一顆夢幻珠子，迎風漲大，藍金水晶球覆蓋了基地。
冰藍光龍仰天長嘯，身軀破碎，化成點點光塵消散，光塵湧入基地內部，化為人形。
“我已經到了！”
漂浮在虛空，林天看了大古一眼，轉身看向其它兩個女人，口裡念出名字。
“居間惠，麗娜，你們好，我是，珈亞斯。”
三人大喜，正準備說話，林天卻抬手打斷。
“我已經在地球各處人類離散地佈下結界，加坦傑厄的黑暗力量無法滲透這裡，算是為人類留下根基。加坦傑厄的力量比我差了很多，此舉消耗我的大部分力量，需要時間恢復。所以我需要迪迦給我爭取時間。”
“加坦傑厄它並不是不可戰勝的，希望之光，喚醒所有人類的希望之光，此戰，迪迦就必勝！”
“就算迪迦勝不了，我也會出手，地球，本就是我的家。所以你們不用擔心，大古！”
“啊？！”大古有些驚喜，瞬間感覺身上的擔子輕了很多，畢竟珈亞斯的力量讓他也無法估計。
“加坦傑厄最後，我會帶走。不過你知道什麼是希望之光！？”
“不知道………但，我一定會找到答案的。”大古明顯沉思了，但時間緊迫，不敢耽擱，取出了神光棒，化成了光，飛走。
“你們只要找到了希望之光，不需要我的力量也能打敗加坦傑厄，迪迦奧特曼的極限遠遠不止於此。”
說完，身體漸漸變得透明，消失了在虛空一中，外界黑暗深處一隻巨大眼眸睜開，看著林天出現的地方，傳出高高在上的意念。
“人類！你確定要和本座為敵？！”（未完待續）