1866年國會選舉之後，激進派穩固地掌握了兩院的三分之二的多數，據此，激進派發動了進攻，在1867年2月，史蒂文斯以重建委員會的名義提出了第一個激進派的重建方案，這個法案很快就在眾議院透過，但是在經過參議院時，遭到了保守派的強烈反對，激進派無奈，只能與保守派進行妥協，最終，雙方達成妥協，法案將南部各州的政治重建分成了三步。第一步，除了田納西州之外（田納西州由激進派所控制），南部各州的州政府是不合法的，對於這些不合法的州政府，實行軍管，將十個州分成了五個軍管區。第二步，在不受種族、不受膚色、不受過去社會地位的選民選舉產生各州的制憲代表大會，在合眾國憲法的基礎上制定各州的憲法；第三步，在指定的州憲法的基礎上，產生議會和政府，在走完這三步之後，各州才能重新回到聯邦，結束軍管。
當時，在總統約翰遜的內閣成員中，只有陸軍部長斯坦頓是支援激進派的，激進派為了保護他們在內閣中的唯一的盟友，國會還規定總統無權直接向軍隊下達命令，而且不經過參議院的同意，也無權罷免陸軍上將的職務。國會的這一手可謂是釜底抽薪，有些架空了總統的權力。
當激進派的重建法案的已經公佈之後，廣大的人民群眾都非常擁護，尤其是黑人們，都樂瘋了。但是總統約翰遜卻很惱火，利用手中的權力將該法案給否決了，但是國會是掌握在激進派的手裡，國會又以超過三分之二的多數推翻了總統的否決。
在史蒂文斯提出的重建法案之後，又陸續透過了三個補充法案。在1867年3月透過的第一個補充法案規定，各州的軍管局首先要做的是進行選民的登記和宣誓，在多數選民贊同的基礎上，召開制憲會議制定州憲法。同年7月，第二個補充法案出臺，該法案重申了軍管局在各州的絕對權威。在1868年3月，最後一個補充法案規定，南部各州的新憲法只要得到實際參加投票人數的多數票支援即可生效。這些法案讓約翰遜非常的不痛快，都利用總統的權力進行了否決，但是在掌握了國會三分之二多數的激進派面前，一切都是浮雲。
在於總統的激烈鬥爭中，激進派取得了決定性的勝利，總統說的話估計就和放屁差不了多少了，整個局勢掌握在激進派手中，他的重建法案得到了迅速推行。
雖然在激進派和總統約翰遜的鬥爭中佔據了上風，但是總統約翰遜並沒有坐以待斃，而是進行了反擊。
首先，他認為國會透過的這些法案都違憲，既然我治不了，那就找人治，從而告到了高等法院，準備走司法程序。除此之外，他還把手伸向了軍權。在1867年6月，約翰遜不顧軍隊指揮權法的規定，直接向南部5個軍管區釋出了旨在削弱軍管區司令權力的命令，在此之後，又陸續解除了或調離了所有同情和支援激進派的軍區司令。在1867年8月，約翰遜無視國會“未經參議院同意，無權停止或罷免陸軍上將的職務”的法令，下令停止唯一支援激進派的內閣成員、陸軍部長斯坦頓的職務，要格蘭特擔任陸軍部長一職。但是斯坦頓寸步不讓，拒絕離職，而約翰遜又堅持自己的意見。雙方互不相讓，但是法令畢竟是法令，約翰遜只能在當年12月向國會遞交了任免陸軍部長的決定。參議兩院可是激進派的地盤，結果可想而知，在來年1月，參議院正式拒絕了總統約翰遜的決定。格蘭特也看清了形勢，和約翰遜劃清了界限，將陸軍部長的職務交還給了斯坦頓。但是約翰遜不甘心失敗，為了軍權他又做出了一次努力，在1868年2月再次任命托馬斯少將為臨時陸軍部長，但是斯坦頓穩如磐石，巋然不動。約翰遜控制陸軍部的計劃最終以失敗告終。
約翰遜無視國會立法，尤其是兩次無端下令免除斯坦頓的行為，著實惹惱了大部分的共和黨議員，老虎不發威，你當我是病貓阿，國會因此決定對約翰遜進行反擊，給他點顏色看看。約翰遜對此卻表示了蔑視，表示就憑你們還能把我怎麼樣？！是可忍孰不可忍阿，眾議院於1868年2月24日以126票對47票的壓倒性多數決定立即發動對約翰遜的彈劾，並且組成了以史蒂文斯為首的七人委員會。3月初，眾議院透過該委員會提出的彈劾檔案，其中一共列舉了約翰遜的11項罪狀，包括對抗人民意志、違法國會透過法令等等。
眾議院透過之後，參議院開始進行彈劾，現在只差最後一步了，只要參議院透過彈劾案，那麼約翰遜就得下臺了。3月5日，在最高法院首席法官薩蒙蔡斯的主持之下，參議院開始審理彈劾案。在最終的投票中，雖然以35票對19票，僅以一票之差未能達到法定的三分之二多數，最終，約翰遜險而又險地逃過了一劫。
雖然激進派的彈劾未獲成功，但是卻也讓世人們看到了激進派的地位，擴大了激進派的影響。
就在激進派和約翰遜在首都華盛頓鬥法的時候，南部的重建就已經開始了。在1867年3月，南部開始實行軍管。其中在南部推行激進派重建政策的力量由三部分組成，分別是來自北方的激進派共和黨人，他們是核心，而廣大南部地區獲得解放的黑人則提供了廣大的社會基礎，南部的貧窮百人小農也站在了激進派這一邊。這是支援激進派重建政策的力量，同樣的，在南部也存在著反對激進派政策的強大力量，他們就是南部種植園主、民主黨人和約翰遜時期的州政府，以及民間的反對組織，比較有名的諸如3K黨。這些人開始利用各種手段阻止激進派的南部重建法案。
黑人們為了自己的權力，用舉行集會、發表宣言等等措施推行激進派法案的實行。各地的州政府為了保證重建的順利進行，也採取了一系列措施，他們免除了6名州長和大批中下層行政官員的職務；以軍事法庭代替了原來的州法庭；並且對各種恐怖活動進行了嚴酷的鎮壓；為了保證黑人有機會參加選民登記和投票，有的軍管區還延長了登記和選舉期限。
經過激烈的鬥爭，南部各州在1867年10月先後完成了選民登記程式，到了1868年5月，除了德克薩斯州，其他各州都完成了制定憲法的工作，到了1869年末，南部10州選出了州議會、行政官員及參加國會的參、眾議員，各州政府先後宣告成立，到了1870年3月，南部各州在聯邦中的平等地位與正常關係終於得到恢復，重返聯邦的程式宣告完成。
南部各州的民主政權成立之後，立即開始進行整治、經濟和社會方面的民主改革工作。第一，確認了黑人的平等權利，實行民主整治，雖然各州政府和司法機關中都有一定數量的黑人，但是政權仍然掌握在百人手中，各州制定的民權法案也未得到認真實施，黑人們仍然遭受著嚴重的種族歧視。第二，進行土地和稅制改革。第三，獎勵工商業，資助鐵路，促進商品經濟發展。南部各州的獎勵工商政策，刺激了北方資本對南部投資的積極性，促進了南部經濟發展，同時也給投機者們以巧取豪奪的機會，從而形成了一批暴發戶。第四，改革教育制度，開班免費的公立學校。內戰前，奴隸被剝奪了受教育的權利，南部黑人文盲率達到了95%以上，公辦學校成立之後，很多的黑人獲得了受教育的權利。第五，醫治戰爭創傷，興辦慈善事業。面對嚴重的戰爭創傷和普遍貧困的局面，南部各州政府撥出大筆資金修復鐵路，架設橋樑，恢復和開辦醫院、孤兒院和救濟機構等公用事業，為黑人和下層白人提供社會福利服務。
南部的重建光靠政策是不夠的，還需要大筆大筆的真金白銀，在巨大的財富面前，南部出現了非常嚴重的貪汙腐敗現象。例如當時的路易斯安那州的州長亨利，當時的年薪為8000美元，但是在任職四年內，他總共獲利50萬美元。佛羅里達州的稅務官員竟然私分稅款50萬美元。
貪汙舞弊之風的盛行，極大的損害了南部激進派的形象，民主黨和保守派藉此發起了猛烈的進攻。一時間，反對南部改革的勢力驟然抬頭，一片山雨欲來風滿樓。但是最終激進派還是完成了南部的重建工作。
在南部重建過程中，獲得解放的廣大黑人群眾也做出了自己的努力。範圍比較廣的是在內戰時期成立的忠於聯邦的同盟會，剛開始在北方，但是隨著北軍的推進而發展到了南部各州，到了重建時期，同盟會已經成為了相當廣泛的全國性的組織。，等到了1867年的時候，同盟會在南部各州已經擁有了50萬的會員，他們為維護南部重建進行了卓有成效的鬥爭。單獨的猶如南卡羅來納州和佐治亞州，他們分別在各自的州內進行了積極的鬥爭。（未完待續）
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