吳啟哲看著面前冷冰冰的初號機，知道在紫色塗裝的裝甲內，有著與使徒類似的生命體，XIONG前也有一個類似使徒核的球體。
它與碇真嗣之間存在的奇妙關係以及在暴走時所發揮出的令人驚訝的戰鬥力尤其引人注目。
殲滅第十四使徒之後亦完好地儲存了下來的初號機，在劇場版中亦加入了戰鬥，是EVA系列的核心機種，人類補完計劃的重要組成部分。
碇源堂一直將其與其它兩機分開處理且格外的重視，可見它的重要性。
EVA就是所謂的“終極泛用人型決戰兵器”，也就是一種巨大的人形兵器，是使徒的複製品(初號機是莉莉絲的複製品）
與使徒們同樣具“A.T.FIELD”。因為是從使徒複製而成，因而有使徒般毀滅性的戰鬥能力，同時也是生物科技與精密電子機械組合而成的產物。
但是，實質上仍然屬於生物的範疇。在動中提及的EVANGELION共有十四臺，但只有EVANGELION初號機是才是“人類補完計劃”的最重要組成環節。
EVA的表面皮膚並非是先天生長出來的，而是後天由人類加上去的，實際並不是皮膚也不是葛城美裡所說的保護EVA的裝甲，而是抑制EVA真正的可怕力量的約束器。
注入了人類接觸實驗而覺醒的亞當發出強大AT力場，由此引發了第二次衝擊。而莉莉絲於南極在移動之前就被炸成碎片，即是被釘在十字架上的白色七眼巨人（莉莉絲身體殘缺且被朗基努斯槍封印，抑制其生長，靈魂和身體;均被分離。靈魂寄宿在綾波麗體內）。
冬月教授第一次到地下城市的秘密實驗室時指著建造中的零號機向碇元渡發問：“這就是從南極撿回來的巨人？”
碇源堂告訴對方初號機只是複製品。
南極的巨人是亞當，零號機為亞當的複製品，而初號機，在後來赤木博士曾提到過初號機是莉莉絲的複製品。
碇真嗣的母親在初號機的試驗中發生事故不幸離世，其靈魂寄宿在初號機當中。
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吳啟哲很很懷疑碇源堂的老婆碇唯的靈魂會不會就藏在使徒核的球體內，他嘴角泛起一絲壞笑，要知道他可是連靈魂都不會放過的男人啊！
通訊器裡傳來赤木律子的聲音，初號機已經進入了啟動程式。
“啟哲君，你準備好了嗎？”赤木律子的聲音響起
“準備好了，可以開始了。”吳啟哲知道其實駕駛初號機的關鍵就在於神經元連線。
說白了，EVA的朝操，就是讓人類的靈魂代替人造人，去指揮初號機於使徒展開戰鬥，也可以說是神經共享，利用神經元聯結器和EVA進行同步連線，只有這樣本身沒有靈魂的EVA才能以人得意志去行動。
而這種方式的弊端就是，如果EVA受到攻擊或者受傷的話，EVA的駕駛員也會產生相同的痛楚，甚至要比EVA承受的痛楚更甚！
當然其實EVA本身是沒有思想的，所以戰鬥所產生的痛楚，多半還是要傳導在駕駛員身上。
很快，在赤木律子的指揮下走向升降梯，坐進了所謂的插/入栓中。
“冷卻完畢，駕駛員準備，插/入栓準備插/入！”另一位女通訊員的的聲音在CHA入栓內響起。
很快CHA入栓已經達到安全深度，駕駛艙內開始注水。
一股黃色的液體開始注入吳啟哲所在的駕駛艙，他臉上沒有任何表情。
見吳啟哲沒有任何動靜，葛城美裡忍不住問了一句：“啟哲你沒事吧。”
“我很好，你們不用擔心。”吳啟哲本身在水下呼吸就沒有任何問題。
“主電源連線，全部迴路動力傳達，啟動開始！！”
就在這個時候意外情況突然發生了，通訊器裡傳來焦急的聲音：“神經元系統，接觸異常，精神陷入深度汙染。”
葛城美裡和赤木律子對視一眼，都看出了對方眼中的緊張，如果在這樣下去，吳啟哲可能直接死在初號機機體內。
凌波麗清麗的臉上也寫滿了焦急，早知道無論如何也要阻止吳啟哲去駕駛初號機。
但事實真的是如此嗎？吳啟哲陷入了精神的深度汙染？
完全不是這樣，而是吳啟哲用元神出竅直接進入了使徒核的核心。
吳啟哲很快就看到了一個女人，長相清麗秀美，看上去和凌波麗相似度極高，當然凌波麗本來也是她的克隆體。
吳啟哲知道面前的靈魂體就是男主角的老媽，碇源堂心心念念想要見到的女人碇唯。
他剛一進入使徒核的球體就感受到一股力量想要吞噬他的元神，但很可惜，這樣的無主力量，想要吞噬他簡直痴心妄想。
吳啟哲元神之力猛的爆發，那股侵蝕過來的使徒核心的力量瞬間被震散。
他掃視了一下周圍，這完全就是一片被血色籠罩的空間，而碇唯就閉著眼睛躺在最中央的地方。
吳啟哲還發現了一個有趣的地方，碇唯竟然什麼也沒穿，不過也正常，靈魂嘛，本身就是一團靈體，沒有衣服在正常不過。
他上下打量了一番碇唯的玉體，怎麼說呢，纖細苗條，XIONG前那對並不大，這也難怪作為她克隆體的凌波麗身體也並不誇張，當然輪廓和大小剛剛好，一隻手完全可以掌握。
吳啟哲忍不住靠近了，就在這時候碇唯突然睜開了眼睛，她有些茫然的看著吳啟哲。
在碇唯的記憶裡吳啟哲完全是個陌生人，所以看到吳啟哲靠近，她下意識開始害怕，想要調動使徒核的力量來趕走對方。
很可惜，使徒核的力量對吳啟哲來說根本造不出威脅，而碇唯也不能有效的控制這股力量來攻擊吳啟哲。
吳啟哲繼續朝碇唯靠近，看著那張成熟秀美的臉龐，下意識的伸手想要去撫摸，很可惜被對方躲開了。
碇唯神色慌張的開口吳啟哲，緊張道：“你到底是誰？為什麼我從來沒有見過你。”
吳啟哲笑而不語，碇唯不斷後退，他在不斷逼近，直到被逼到死角裡。
他隨手一招，碇唯的魂體便不由自主的朝他飄了過來，很快便落入了他的懷抱。
吳啟哲開始用上了靈YU交融的方法，很快就採取了主動權，不光碇唯無法在反抗他，就連使徒核的力量也被他所控制。
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