朝廷並未對此次學術論戰給出個明確的結論，只是明令：今後省試和殿試依據傳統的儒家經典，不再固定一個或幾個學派的學說，參加考試的學子們可以儘管揮，只要你能言之成據即可。
對於原來高宗趙構時期“樹理學、打壓其他學派”的做法，周復很是不以為然，因為他覺得學術之爭靠的就是辯論，道理越辯越明，用權力去壓服或是認定，根本沒什麼意義。
只要是在正常的學術討論範圍內，大家儘管暢所欲言、百家爭鳴，學說應該是可以兼容幷蓄、共同展的。對於各派之間的互相攻擊，朝廷反而應該進行制止。
皇太子為原來被奸相蔡京等人列為“罪臣”的北宋名家蘇軾的文集作序，並讚揚其為人、學風，隨後奏請天子趙昚，追諡蘇軾“文忠”、其弟蘇轍“文定”，追贈蘇軾為太師，支援他所創立的蘇氏蜀學重新興起。
此次辯論對大宋朝廷是個收攏人才的好機會，原本一些為了各種各樣原因不願意出仕的有才之人，此時大都來到了京師臨安。
皇太子正式下旨召願意留在朝中任職的賢才從政，一大批在民間素有名望，卻因為科舉等原因無法入仕的賢才進入朝廷。雖然他們暫時擔任的都是一些閒職或低階的職務，卻為後面官制的變革準備了可供選擇的人才。
論戰之後，公開反對恢復中原和進行變革的聲音從此消失。
就算有人對變革不滿，大家也是就事論事，不再僅僅是以祖宗規據或是傳統來進行反對，至少在反對的時候言之有物。
本來在朝野瀰漫著的死摳儒家經典，蔑視實務、農商的空氣漸漸散去，空談性理的所謂“清談君子”沒有了市場。
藉著臨安雜術講座火爆的盛況，皇太子隨即宣佈：在京師臨安設立國家級別的臨安公學，該學校專門負責教授“雜術”。一般學子只要能透過臨安公學的入學考試，就可以進入學校學習，在學習期間待遇和太學、國子監、臨安武校學員待遇相同。朝廷及各地官府與雜術相關的官吏在升職之時，都要到臨安公學接受培訓。
臨安公學從此成為了大宋科學技術的集中之地，無數從它這裡畢業的學子把各種各樣的知識傳播開來。之後，在它基礎上設立的臨安公學院成為了大宋先進技術的研究核心，尤其是軍事技術。
金和西夏、西方吐蕃各部都想得到臨安公學院的研究成果，環繞著臨安公學院也成為各國探子們鬥智鬥勇的舞臺。
隨後一年左右的時間裡，軍隊中的軍制改革進行的較為順利，中央的整個軍事體制改革也提上了日程，這是大家爭議較大的一塊。
自高宗收取兵權以來，軍隊由朝廷掌握，又基本回到了原宋朝的舊體制上，高級將領無法直接領兵，一遇戰事，所有大臣都有權參與討論，決定領兵大將、軍事決策權，然後由皇帝決定。這種制度的好處，是徹底消滅了將領擁兵對皇權的威脅，也使得權責明確，可以保證軍隊的後勤供應和軍事技術的展；弊端也很明顯，“將不知兵、兵不知將”，讓將領如何指揮？這樣的軍隊很難有戰鬥力。
尤其是遇上沒什麼軍事素養又喜歡干預軍務的皇帝和文臣，有時，甚至以沒有軍事經驗的文臣和士家子弟領軍打仗，這仗就沒辦法打了！
經過此次調整，兵部成為處理日常事務、人事、後勤的機構，沒有對軍隊的直接管理權；設元帥府，高級將領平時在元帥府任職，管理軍隊的訓練和調動，方便將領熟悉各支部隊的特點，戰時元帥府節制諸軍、統一全**事戰略指揮，但不得干涉政務；樞密院最終成了專門的參謀機構，負責平時的情報、戰事的建議，對軍事指揮有制衡之權。
調兵權還掌握在皇帝的手中，一旦指派了高級將領擔任戰場的指揮官，同樣派出謀士團作為協助，戰場指揮權從此下放到負責指揮的將領手中，不再由皇帝干預。
宰相和中樞官員平時可以透過兵部任命、罷免將領、各級軍事官員，制定軍事法規來調整軍務，但不能干涉具體的軍事指揮，徹底取消了文官對戰事程序的干預。
在宋朝原來已經制定的《賞罰格條》基礎上，再由朝廷制定全面的軍法，保證軍隊訓練和後勤，以打造一支既忠於國家，又可以決勝疆場的軍隊。
最後，太子周復決定：在兵部設軍法司，各部的軍法官員由兵部直接派出，他們的升遷由兵部考核，各級將領不得干涉，下一級軍法官向上一級負責。軍法官在各軍中都有著絕對的權威，依軍法處置將士，就連主將也不得干涉；但一旦他們徇私枉法、或是處置錯誤，也得承擔相應的責任。
在臨安武校下面，恢復仁宗、神宗時曾經設立中央和各府兩級武學，實行“武舉”、“御試”等制度，培養各級將領。未來將領、謀士、士兵也由各地方武學按兵部所定的標準負責選用，一旦進入軍隊，可以保證得到穩定的軍餉用於養家，立功後也能得到較為豐厚的賞賜，以此逐步改變軍人被過度輕視的傳統。
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在上述基礎上，改變整個官方關於軍事的工場，所有關於軍事的工場都轉由兵部控制，工場中的工匠身份提高，不再屬於賤民，立下功勞的工匠也有可能得到朝廷所賜的官身。而且，兵部有權呼叫擁有新技術的工匠。
另外，在臨安公學中設立臨安公學院，加強對宋朝相對領先技術的管理，以保證火器等制作方法不為外人獲取，並規定敢於洩露者死！
利用設立臨安公學院的機會，周復還把自己長姐趙姬的駙馬王守成任命為公學院的副學政。)
按大宋歷來的嚴規，駙馬不得干政，這也導致了有志進入朝堂的才學之士不願意成為駙馬。
王守成當初是因為家世的關係，依禮被選為長公主趙姬的駙馬，從此就再也無法從政。好在他與一般人有所不同，他喜歡的是雜學中的火器製造，這也是因為家傳，他的祖父和父親都是當年兵部製造司的主事官員。在火器上，王守成堪稱是當代大師一級的人物。