方國安早在八月間，就曾會同王之仁等部配合當地義師，收復了富陽、於潛等地，並一度逼近杭州，但未能得手。
清閩浙總督張存仁給多爾袞的奏報便言，“叛賊方國安、王之仁從富陽渡江進犯杭城。遣副將張傑、王定國督兵圍剿，斬首四千級，餘賊盤踞復陽。又令定國追繳，大敗方國安，擒其子方士衍等，斬之。”
方國安有之前的失敗，對於杭州清軍的戰力自然有所瞭解，但魯王政權急於下杭城，以獲得與隆武帝相抗的威望，攻與不攻，退與不退，都非他一人說的算。
他聽了夏完淳的相勸之語，一陣默然，半響後才說道：“今殿下發兵十萬，若寸功未立，便退回南岸，必為天下恥笑，且民氣可鼓不可洩，即便退軍，亦須先勝一陣也！”
夏完淳聞語，臉上不禁一陣愕然，知魯王政權為奪大位，已經迷失本心，急於求成，他隨欲再勸，但他只是一中書舍人，而且還是親近隆武朝廷的一派，魯王政權自然聽不下他的話語。
方國安見夏完淳默然不語，多少知道他的一些想法，但有時候，人總是身不由己，他即便知道可能會敗，但眼下魯王政權的局勢，卻不許他輕易撤退，而且他心中也存在一絲僥倖，因而開口道：“若二十五日前，不能下杭州，本將必然勸魯王退兵，而再此之前，還請小隱轉告陳公，無論如何也要堅守湖州，莫使清軍支援杭州。”
夏完淳只得應下，也沒拜見魯王，便匆匆返回湖州。
陳子龍守城已有四五日，見夏完淳回，連忙相問杭州的情況，夏完淳卻道：“恐怕要敗。”
陳子龍聞語一驚，他知道他這個徒兒的才能，知他不會憑空說出此語，隨連忙詢問原因，而夏完淳則將在杭州城外的見聞一一告知。
“唐、魯之爭，非國朝之福也！”陳子龍很快就認同了夏完淳的判斷。
唐、魯決裂，而從地裡位置來言，魯監國政權處於抗清的第一線，給南面的隆武政權提供了屏障。
魯監國勢力弱小，本該依靠福建隆武政權，以東南為後盾，徐圖進取，但由於魯監國堅持同隆武朝廷分庭抗禮，使得浙東失去隆武帝的支援，而本就不願意派兵出閩的鄭芝龍，心中更是竊喜，他終於有了安兵不動的藉口。
以浙東之地，對抗江南清兵，防守尚顯不足，魯王政權卻急於求成，要攻杭城，失敗已經不可避免。
“且守到二十五日吧！”陳子龍不禁長嘆一聲，國運不振，時時不順，他能做的也就只有守住湖州，避免魯王大軍被清軍兩面夾擊，希望他們不要敗得太過難看。
湖州城外，恭順王孔有德每日炮擊湖州，除了最初幾日發步軍猛攻城池之外，這幾日卻很少攻城，讓守軍的壓力頓時減輕。
孔有德的軍隊乃是跟隨北虜多年的老漢賊，十分精銳，陳子龍本十分擔心，是否能夠守到二十五日，現在見其不再猛攻城池，心中隨放下心來，但夏完淳卻覺得事態有些反常，心存疑慮。
義軍中不少人認為，這是孔有德在最初的攻城失利後，覺得短時間內無法攻破湖州，又不願手下出現太多傷亡，隨改變攻城策略，但夏完淳卻感覺不會那麼簡單，清廷內部法度森嚴，特別是對待漢將，令進則進，令退則退，稍有違抗，便會遭受重罰，多鐸既然讓孔有德援救杭州，他豈有不拼命攻城的道理。
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二十日夜，夏完淳心中憂鬱，無法入眠，隨上城尋視，卻正遇一身著夜行服的武者，以繩索攀爬而上，正好被士卒拿下。
那武者卻不反抗，只說有要事面稟報陳侍郎，夏完淳奇之，隨將他帶到陳子龍面前。陳子龍相問，那武者才行禮道：“天地會青木堂餘太初拜見陳公。”
胡為宗奉王彥之命，返回江南組建天地會，在漕運上收編了不少江湖好，正好從南京城中撤出的錦衣衛殘餘勢力也在漕運上活動，他便攜帶從揚州取出的銀兩，將他們統統收編為天地會的青木堂。
這些錦衣衛都是諜報、刺探方面的好手，如今有了銀錢支援，原本已經廢掉的一些關係，頓時又重新組建起來，使得天地會很快就在江南立足。
這一次，餘太初來見陳子龍，卻是潛伏在洪承疇身邊的侯方域傳出訊息，多鐸有意讓孔有德牽制湖州守軍，而他則親領水師，去襲義軍在太湖上的水寨。
陳子龍與夏完淳聽了餘太初的訴說，心裡頓時大驚，夏完淳立馬諫言退出湖州，保下水塞要緊，而陳子龍卻心中猶豫，擔心杭州魯王大軍，會因為他撤離湖州，而被清軍殺得大敗。
餘太初見此卻道：“天地會已經快馬飛報魯王，而且仙霞關外的博洛軍，也已經秘密回援杭州，陳公兵馬守衛湖州已經沒有任何意義！”
陳子龍聞語，頹然坐下，雖說他早有面對失敗的準備，但真當失敗來臨之時，他還是不禁一陣黯然。
是夜，陳子龍命士卒在城市多插旌旗，又擺草人守城，便連夜帶著義軍撤離湖州，返回太湖。
不一日，多鐸領水師至太湖，他以為陳子龍還在湖州，太湖水塞只有吳易與少量義軍守衛，隨領著大船直撲水寨，卻不想陳子龍已經早回一日，而且設下埋伏，以數百艘滿載柴草火油的小船突然自蘆葦蕩中殺出，清軍大船無法轉向，頓時百船俱焚，清軍大敗，多鐸倉皇逃離太湖。
杭州府境內，魯王大軍雖然得到天地會的訊息，但卻未能引起重視，甚至前往稟報的天地會義士，都沒能見到領軍大將，便被打發回去。
不久，博洛大軍從西面殺至，本就不佔優勢的魯王大軍，頓時大敗，大將方國安首先敗逃，十萬人馬頓時蹦潰。
這一戰下來，魯王軍中被俘虜的副將就有十一人，參將、遊擊、都司、守備則達到四十八人之眾。
在渡江復杭戰役失敗後，魯監國政權壯志頓消，基本上轉為劃江憑險而守，再也沒有了進取的決心。