該怎麼說呢？
當一個人意識到自己存在的瞬間，便是待在培養罐中時，彷佛血的味道充斥在肺部和鼻腔裡。
第一眼睜開的，是那個男人。
碇源堂。
自從有了意識開始，她也得到了名字，綾波麗，這是碇源堂給予她的名字。
她也將碇源堂視為最重要的人, 二人之間的羈絆是如此的牢固，將二人捆綁在了一起，無法分開。
只是，和友情之類的褒義詞不同，她與碇源堂的羈絆，實質上只是一方對於一方的控制而已。
而如今, 這個局面似乎被打破了。
普通的一天，一次普通的問候, 一份普通的伴手禮, 卻已將讓對周圍事物完全不敏感的少女，得到了異樣的感受。
在之後，沐浴著來自異星之光的她，逐漸對於名為李林的男人感到了好奇，而且，對於光的嚮往，使得她不自覺的靠近名為李林的外星來客······
這是少女的故事，是少女記憶中的起源。
“······是這樣啊·····人造之物嗎？”
聽著綾波麗的敘述，李林喃喃的說道。
這似乎就可以將之前的疑問完全解開了，綾波麗並不是真正的人類，而是以類似克隆的技術製造出的人造人，這也解釋了為什麼她的身體需要大量的藥物來維持，並需要持續檢查，不然的話這具身體恐怕根本撐不到這一天吧。
而性格的原因, 也可以得出結論了。
“麗, 你一直都是一個人生活嗎？”
“嗯。”
從最開始的培養罐到地下室，再到垃圾樓，綾波麗就是這樣獨自一人生活到現在的。
顯然是有意而為之, 為了刻意讓綾波麗保持現在的樣子。
那，這麼做的目的是什麼？
碇源堂要用綾波麗做什麼？
舊的疑問剛剛解決，新的疑問便又誕生了。
彷佛是一團迷霧，包圍在李林身邊，當他驅散了一層，外面還有更多層等著他。
“去問問他們吧。”
李林略微思索了一會兒，便打定了注意。
一切的根本只能詢問冬月，以及自從加入Nerv之後便從來沒有見過的，傳說中的那位司令。
不過在此之前，李林還有些事情要確定：
“麗，你以後打算怎麼辦？”
“什麼意思？”
“是維持之前的狀態，還是繼續這樣生活下去？”
“我·····聽從命令。”
綾波麗說出了和之前一樣的答桉，不過這一次，她顯然有些遲疑，沒有了以往的堅定。
和李林相處的這段時間裡，讓她感受到了和碇司令相處時所沒有的感覺，她的心態也在這段時間裡悄然發生了變化。
“我想······繼續活下去, 想做蛋糕, 想去見證光！”
堅定的話語響起，聽到這話，李林的臉上浮現出了欣慰的笑容，他點了點頭，然後對準綾波麗伸手：
“走吧，去瞭解這一切的真相。”
“·······嗯”
幾分鐘後，巨大的辦公室內，此刻，冬月看著聯袂而來的李林和綾波麗眉頭微微皺起：
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“真相啊·····”
結束了與炎山的戰鬥，Nerv有相當多的事情需要處理，為此作為副司令的他此刻也是極其忙碌的，不過好在，相應的工作其實都是讓手下去做的，他只是需要坐鎮全場作為總指揮罷了。
然而，他沒想到的是，李林和綾波麗卻在這個時候到來了，並直截了當的詢問他，使徒為什麼會對第三新東京市如此感興趣。
這讓冬月有些措不及防，雖然目睹了奈歐斯與炎山的一戰，他有了一些想法，但現在不是付諸實際的行動，而且，他也不清楚，如果知道真相後，李林是否還會繼續這樣幫助人類。
要知道，從某種意義上，那可以說是人類自己造成的結果。
“為什麼會突然問這一點？你的目標不一直都是怪獸嗎？”
“因為炎山現在與使徒扯上了關係，而且，按照你的報告，拉弗雷謝恩也吞噬了使徒，這兩者結合的時候，他們就已經不是單純的怪獸了，所以，我必須知道關於使徒的事情，不將這件事搞清楚的話會一直陷入被動的。”
面對冬月的話，李林開口道，而綾波麗則站在他的身後，一言不發。
聽了這話，冬月揉了揉眉頭，陷入了沉默。
過了一會兒，他似乎下定了決心，開口說道：
“好吧，這一切的由來，應該從第二次衝擊說起。”
第二次衝擊，李林對這個詞並不陌生，現在的主流觀點是巨大隕石降落在了南極，但聽冬月的話，顯然是有隱情的。
“雖然歷史課本上寫的是由於巨大隕石墜落而引起的災難，但實際上並非如此，15年前，人類在南極發現了最初的人型使徒——亞當，但在調查之中，因為不明原因引起了巨大的爆炸，這就是第二次衝擊的真相。其結果你也知道了。”
冬月緩緩的，將十五年前的那件事的真相娓娓道來。
然而，李林並沒有停下，而是繼續問道：
“那使徒究竟是什麼？”
是的，那些和人類的生物學和物理學大相徑庭的巨大生物，彷佛與這個世界格格不入的存在，讓李林難以忽視，更不用說使徒和亞當這兩個宗教意味極強的名稱了。
這一刻，李林揭開了這一切的神秘一角。
更有意思的是，李林曾經看到過Nerv本部的資料，這其中便有使徒的分析結果，樣本來源於奈歐斯解決的晝天使的核心碎片，結果顯示，使徒與人類的基因序列相似程度為99.89%。
看起來是一個十分高的數值，但在生物學的研究中，人和黑猩猩的相似度都有百分之九十，這樣看來又似乎沒什麼。
只是，這一比較的物件是使徒。
來源神秘的巨型生物，基因序列卻與人類相似到這種程度，也就是說，排除使徒人造生物的可能性的話，使徒很可能和人類有著相同的祖先，這一點，又給使徒增添了一絲神秘的面紗。
聽到這裡，冬月陷入了沉默。
就在這時，一個聲音響起了：
“因為，它們和人類，是兄弟！”
李林轉身看去，一個戴著眼鏡，氣質陰冷的中年男人，不知何時出現在了辦公室的門口。