此時，近畿以內，朝倉，淺井早就已經灰飛煙滅；齋藤家，六角家早就已經成為了歷史，曾經是近畿霸主的三好家也只剩下一星半點殘餘勢力在苦苦掙扎。波多野家的殘餘勢力也只有依靠八上城的堅固城牆才得以苟延殘喘。
三個月後，織田信長將杜飛，德川家康兩位盟友召集起來，此時杜飛趁著兩個人休整部隊期間將三好家的飯盛城等領地佔有，並對本願寺家形成了有效地壓制。
織田信長望著躊躇滿志的杜飛和心機深沉的德川家康，乾笑幾聲後說道：“我們首先要慶賀一下，現在整個近畿幾乎都在我們的掌控之下了！本願寺這顆小釘子實在是太礙眼了！他們首先是毫無徵兆的跟我們對立，並且到現在還不肯向我們臣服！我決定，接下來的目標就是它！”
“目標是本願寺嗎????”德川家康似乎臉色有些不好看，他滿心希望下一個目標是武田家。因為武田家的領地距離他的領地很近，他一是怕武田勝賴糾集兵力來報仇，二是佔領了武田家的領地之後靠的比較近他能夠獲得更多的利益。
“家康，我知道你的想法，我早就說過了，不管我們攻略的目標在那裡，每個盟國都會有收益！不要計較一時的得失！”織田信長仗著自己兵多將廣在三人中總是扮演很強勢的角色，說來也奇怪，只要他一說話，德川家康就是有天大的不滿，立刻就閉上嘴不說話了。
但是杜飛往往不買他的帳：“信長，我也很想一舉攻下石山本願寺，但是據我的忍者多日以來的觀察，石山本願寺真不愧是天下第一固城！光是外層的城牆就將近三丈高！其堅固程度更是簡直可以用恐怖來形容????我覺得，要是硬攻的話至少要有五萬大軍圍城才會有勝算！以我們聯軍現在的兵力，最多只能湊齊兩萬人，相當得不划算啊?????”
“怎麼，一向無所畏懼的杜飛也怕了本願寺那些假和尚了嗎？”織田信長的臉上突然浮現出一絲詭異的笑容來：“誰說我們要硬攻了？猴子！出來！”
這時，木下藤吉郎帶著幾分羞怯從屏風後走了出來，將手中的一副石山本願寺的地圖開啟給幾個人看：“我已經從降將中山清秀那裡獲得了石山本願寺的地形圖，之前本願寺家和三好家作為盟友，去哪裡拜訪時中川清秀就特別留意了石山本願寺地形，沒想到如今真的派上了用場！”
他一邊指著地圖一邊說道：“各位請看，石山本願寺的城防一共分為三丸，每一層都有大量的鐵炮手守衛，他們處於三面環海的地形，唯一可以出入的就是正門????”
“這些我早就知道了，藤吉郎，你想說什麼就直接說吧！”杜飛直接了當的說。
“要是硬攻，當然不行咯???但是，他們這種三面環海的構造雖說便於防守，但是也有一個巨大的缺陷，一旦前門被堵死，那他們的補給就成了大問題！”猴子胸有成竹的說：“所以，對付本願寺家最好的計策，就是長期圍困加忍者騷擾破壞！”
德川家康突然插進來說道：“石山本願寺不是有三面靠海嗎？他們完全可以在海上運輸補給啊????”
“那是不可能的！”織田信長斬釘截鐵的說道：“我們麾下的熊野水軍會徹底的將水路封鎖！我敢保證，本願寺家在海上得不到任何的支援，得到的只有炮火！”
織田信長說完之後眼睛堅毅的看著遠方，似乎有一種穿透一切的氣魄！
幾日後???????
石山本願寺果然被織田聯盟軍圍得死死的，本願寺家的主持本願寺顯如卻是毫不畏懼：“讓他們來吧！竟敢侵犯佛門淨地！看我們的鐵炮怎麼收拾他們！”
但是那些躊躇滿志的本願寺家鐵炮僧兵等了整整一天，也沒有見到一個敵軍出現在射程以內，相反，那些織田聯盟軍在裡城池不遠處的地方大興土木修建起了各種工事和營地，似乎是要常駐一般。
這下子輪到本願寺顯如著急了：壞了！莫不是要打消耗戰？他開始盤算城池中的糧草夠吃多少天。此時，下間賴兼匆匆趕來，焦慮的對他說道：“主持！我們的運糧船被織田聯軍擊沉了！整個海路都被封鎖了！”
“什麼！”本願寺顯如聽到這個訊息猶如五雷轟頂！他一手扶著牆壁險些摔倒：“海路被封鎖了！那我們????”
“主持，您別太著急！我們可以想別的辦法!”下間賴兼連忙寬慰他說：“別忘了???我們還有???密道那！”
“你的意思是！我們要出入禁地？”本願寺顯如突然激動起來：“不行！那絕對不行！本願寺自建寺以來從來沒有人進入禁地，據說進去的人死後都會墮入阿鼻地獄，靈魂永不超生！這可使不得！”
下間賴兼見本願寺顯如態度如此堅決，也只好作罷。
於是，滿漫長的消耗戰開始了???織田信長做事一項非常的絕，不僅將本願寺家的糧路斷了，同時派遣忍者四下的騷擾，天天鬧得石山本願寺內雞飛狗跳，苦不堪言。
本願寺顯如的眼睛裡佈滿了血絲，他和下間賴兼都是幾天幾夜沒閤眼了，親自帶著僧兵守衛著僅有的一點糧草。他明白，此時這些糧草就是本願寺家的命根子，一旦糧草被燒，那就等於宣告城破了。
到了第四天，他終於撐不住進了，於是囑咐下間賴兼帶著人嚴密的守衛糧倉，自己在距糧倉不遠的地方隨便找了個營房倒頭便沉沉睡去。
沒睡多大一會兒，他又被一陣喧鬧聲驚醒！只聽外面四處在喊：“織田家的忍者混進城了！快抓住他！”
緊接著外面一陣嘈雜的腳步聲傳來，他和衛隊所在的屋子的紙推門被猛的開啟了！
只見一個身穿黑色夜行衣的織田家忍者一閃身竄了進來！剛冒頭就被本願寺顯如身邊的鐵炮手亂槍打死。
之後一大堆衛兵圍了過來，見到了主持殺死了奸細，都恭恭敬敬的施個禮散開了。
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本願寺顯如將手中的鐵炮丟到身旁衛兵手中，開始上前檢視那個倒黴的織田家忍者，只見這個忍者懷裡鼓鼓的，不知道揣的什麼東西。
他好奇的將那個忍者壞裡的東西掏出來一看，竟然是火藥，他不禁一陣寒顫，立刻又回到了糧倉檢視。
到了糧倉，只見那裡也同樣是一片狼藉。地上橫七豎八的臥著十幾名僧兵的屍體，此外還有四五個黑衣人趴在地上。
“怎麼回事！你這裡也受襲擊了？”本願寺顯如暴躁的問道。
只見下間賴廉捂著手臂說道：“是德川家的忍者???身手很不錯???一上來就打倒了我們十幾個弟兄??好在我們有暗哨，在背後用火槍射擊了他們???”
他看到本願寺顯如憂心忡忡的樣子，突然湊上前去低聲說道：“這樣下去不是辦法啊！主持！為了寺內幾千名僧眾，您應該想想辦法！實在不行，我一個人去密道！要下地獄也是我一個人的事！”
“別傻了！密道裡機關重重，別說我們沒去過，就是有地圖也不一定走出去！你忘了第三任主持橫死的事了？”
本願寺顯如所說的是外人幾乎都不知道的本願寺家的一樁醜事。第三人本願寺主持本願寺玄如由於自甘墮落，竟然想把自己貪贓下的寺裡財產私藏在禁地之中，他特地找到了前任主持封存的密道地圖，隻身帶著重金前往，不料卻橫死在了裡面。
關於密道一事，只有少數的本願寺親傳弟子知道，就連像七里賴周，鈴木左大夫這樣的分寺主持都不一定知道。是本願寺第一任主持坐化之地，據說裡面隱藏了本願寺家的最大的秘密，但是除了第一任主持，沒有一個人能夠進去後活著出來。
所以本願寺顯如才會這樣抵制這種做法，他覺得，寧可為了佛祖光明正大的戰死，也不能在臨死之前出賣自己的信仰和誓言。
下間賴廉只好閉上了嘴，他有些絕望了，作為本願寺顯如多年最得力的助手，他深深的瞭解本願寺顯如的脾氣，只要是他認準的事情，那是任何人都無法改變的。
糧倉裡的糧食只夠吃四天了，士兵們這些天幾乎都是天天喝稀飯，要知道，本願寺畢竟是半宗教型的組織，這些僧兵也並不像那些大名的士兵那樣令行禁止，連個屁都不敢放，稍稍吃的差些，就有一些不安分的搗蛋鬼開始抱怨。
這事要是發生在一個大名家，身為大名的本願寺顯如立刻就會拍案而起，手一揮，那些唧唧歪歪不老實的人們就會人頭落地！但是本願寺是主持，不是大名，所以他無法像那些人一樣，擁有絕對的權威和生殺大權。
他要處死一個弟子，要走的手續不業於一場戰役。逼近寺統監的人要管，宿老堂的人要管，並且各位家老也要管！
作為一寺之主，他擁有的處罰權力只有：面壁，餓飯，掃院子，三招。
一句話，本願寺的僧兵是靠著信仰來作戰，但是信仰不能當飯吃，一旦沒飯吃，再虔誠的信徒也會給你白眼看。
本願寺顯如在各種困難下咬牙忍耐著，他在等????他知道，一個人一定會來救援！