神盾局，其前身是戰略科學軍團（strategic scientific reserve，簡稱s.s.r）。這是米國在二戰時期創立的特殊組織，專門用來對付**德國的九頭蛇軍團。
後來二戰結束，這個臨時成立的組織在吸收合併了其他一些成員後其改名為國土戰略防御攻擊與後勤保障局。縮寫為s.h.i.e.l.d.，由於shield英文意為盾牌，所以又被稱為神盾局。
但是神盾局的真正起源遠比美國隊長想象的更加遙遠。它和九頭蛇的恩怨要從公元前2620年的古埃及說起。
在哪個時候，神盾局和九頭蛇的前身其實是聖盾兄弟會。這個龐大的秘密組織推翻了第一個統治人類的偽神-天啟。
但是隨後兩者就因為理念不合而分道揚鑣。
雙方糾纏數千年，爭鬥從未停止。
無數歷史上著名的人物，都是聖盾兄弟會的成員。只不過大家分屬神盾局或者九頭蛇，一個是為了保護世界，做幕後的守衛者，一個是野心勃勃，想要統一全世界。雙方的矛盾幾乎不可調和。
而二戰只不過是兩個龐大組織千年恩怨的一個小小歷史縮寫。雙方互相滲透，我中有你，你中有我，不分彼此。
當隊長從路仁哪裡聽到這個訊息時，感情上是不相信的。
九頭蛇是邪惡的**組織，而且隊長親手埋葬了他們。現在你跟他說，自己做的一切只不過消滅了一個九頭蛇的分支，實際上九頭蛇組織早已經分佈在世界各個角落，和神盾局一直糾纏不清。那不是隊長當年做的都是白工！
但是隨著路仁向他展示的證據越來越多，隊長看的心驚動魄。就連黑寡婦娜塔莎都驚恐的發現，自己的祖國前蘇聯的倒臺都有九頭蛇的身影存在。
而且更加可怕的是，在近代，九頭蛇的組織在世界上勢力範圍的越來越大，而神盾局因為誓言限制，只能隱藏在幕後。
雖然有各國的支援，但是也受到以米國為首的各個大國限制，甚至很多時候，他們神盾局成為了某些大國的工具，而這些野心勃勃的大國則成了九頭蛇的工具。
這樣來看，現在的神盾局完全成為了九頭蛇的工具，被對方隨意戲弄！
這讓得知了真相的隊長很傷心。
維護正義，保護弱小，驅除邪惡，這是他的理想，也是支援他持續戰鬥的信念。當這一切的基礎都不存在時，隊長的內心會有多麼崩潰，這幾乎可想而知！
唯一還能夠支撐他的就是，神盾局並非所有人都是九頭蛇的幫兇，大部分人只是奉命行事，他們並不知道自己的行為並不是保護那些弱者，而是成為了某些人的幫兇，剝削其他國家和底層人民。
而尼克弗瑞，就是因為察覺到了一些九頭蛇的秘密，所以才被暗殺。
甚至這個暗殺尼克弗瑞的人裡面，就有他的好基友-一位和他從小玩到大的最好的兄弟，冬兵巴基！
隱藏在網際網路中，能夠獲取到全米國各個地方監控攝像頭資料的紅後，以4k高畫質向美國隊長史蒂夫展示了他的好基友巴基是如何痛揍黑人局長尼克弗瑞的！
看到這位平時不苟言笑的黑人局長，被自己的好基友巴基揍得滿地找牙，史蒂夫突然有一種爽快的感覺。
“不不，我怎麼能夠這麼想！”
發現自己居然挺享受好基友巴基暴揍局長大人時，隊長的心中不由的一驚，然後趕緊想辦法平息自己這種邪念。
巴基是被邪惡的九頭蛇控制的，一切都是九頭蛇的錯！
想到這裡，美國隊長史蒂夫更加堅持了自己的信念。他一定要救回自己的好基友巴基，然後順便拯救一下神盾局，如果神盾局還有救的話。
抱著這個信念，史蒂夫掉頭殺回了神盾局總部。
沒有完成任務，還擅自返回總部，拒不接受命令，史蒂夫的行為已經讓亞歷山大非常忌憚了。
亞歷山大這位梟雄一般的人物，最為忌憚隊長這種保持著正（中）義（二）理念，同時又號召力（粉絲多）強大的人。
所以看到隊長沒有執行自己的命令，反倒是直接返回總部，他就已經感覺到不妙了。
所以這位奉行先下手為強，後下手遭殃的神盾局代局長，直接指示自己的親信交叉骨，帶了一群人去堵斯蒂夫。
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戰鬥就這樣突兀的在一座狹小的電梯內發生了。
十多名壯漢在交叉骨的帶領下，意圖採用強人鎖男的姿勢，制服隊長。
但是他們那裡知道，隊長可是對於他的好基友巴基是非常忠誠的。對於其他陌生男性，隊長都是會用最狠的方式，狠狠拒絕對方。
雙方在狹小的電梯內，舉步維艱，汗如雨下。
雙方互相推搡，使勁角力，最終還是隊長沒有成功的正面剛過十個虎背熊腰的大漢。
不得已，史蒂夫只好破窗而出，然後用那面完全不講道理的震金盾牌吸收了大量撞擊力，成功的從二十多層的樓上安全墜落到地面上。
然後在一群虎視眈眈的大漢注視下，隊長一瘸一拐的向另外一邊跑去。
“該死，快，攔住他！”
看到史蒂夫在十名猛男面前，都全身而退，交叉骨暴怒不已。
在交叉骨的命令下，這些凶神惡煞的專業打手，一股腦的從電梯衝了出去，向著隊長逃跑的方向追去。
而同時，一個聲音突然在整個神盾局大樓裡面響起。
當這個熟悉的聲音響起時，所有神盾局的員工都停下了手中的工作，然後聽著他們崇拜的英雄，隊長的心裡話。
當隊長講到神盾局內部混入了很多九頭蛇的人時，所有人都震驚的面面相覷。
大家一時間難以相信這件事情，特別是隊長說自己周圍的人都可能是九頭蛇的臥底。
也就說自己身邊的同事，說不定就是自己的敵人。
就在所有人都互相猜疑時，一群手拿衝鋒槍的恐怖分子衝進指揮室。
這群長得像恐怖分子實際上就是恐怖分子的九頭蛇戰士進來後，立刻控制了整個指揮室，然後一位大家都很熟悉的行動指揮官，7級特工交叉骨趾高氣昂的走了進來。
只見他走到天空母艦的發射控制臺上，咧嘴笑著對控制檯旁邊坐著的一位中年男子說道
“開啟天空母艦的發射平臺。”
不過令他有些意外的是，這個有些膽怯的中年男子居然拒絕了！
“隊長剛才說了，絕對不可以讓天空戰艦升空。”
“我命令你，立刻開啟！”
看到這個膽怯的男子居然敢反抗自己的命令，暴怒的交叉骨一把掏出手槍頂著對方的腦門大聲的命令道。
看到交叉骨掏出手槍，一時間整個指揮室立刻亂做一團。所有人都站了起來。
有人掏槍指向交叉骨的人，而有人卻掏槍指向那些忠於隊長的神盾局成員。
一下子，整個指揮室變成了大型互相舉槍致敬的詭異場景。