在第三艦隊被徹底消滅過後，開菊獸繼續回到了岸邊，並且繼續對舊金山市進行襲擊。
好在趁著這一段時間，不少的居民已經被緊急撤離，同時大量的軍隊也被調集了過來。
只是在嘗試了常規武器沒有效果，並且開菊獸還在不斷地擴大攻擊範圍之後，美國最終還是和原劇情一樣，選擇使用核彈將它殺死。
在開菊獸死亡之後，美國第一時間行動起來，把斧首死亡的地方封閉取來，並且針對開菊獸的殘骸進行研究。
這個時候，改頭換面的林克也作為參與研究的科學團隊的一員，來到了被封閉的區域，並且對開菊獸殘餘的屍體進行了有針對性的研究。
根據電影中的一些提示，林克的研究很有方向性，很快就提交了一大批的研究成果，其中包括開菊獸血液的作用，還有利用開菊獸血液可以製作的資訊追蹤雷達。
緊接著還有對於開菊獸來歷的研究，在終結者還有林克的引導下，最終發現了海底深處的蟲洞，做出來了對方是外星入侵者的假設。
最終，這些研究成果被公開給了世界上每一個國家，並且開始籌劃建立一個國際性的組織來解決開菊獸的問題。
這個時候，林克透過整理出來的專業資料，向世界各國提出了‘獵人計劃’，提議建造巨大的機甲來和開菊獸對抗。
巨大的機甲，可以把開菊獸有效的阻擋在大陸架當中，並且憑藉強大的動力，使用鐵拳來把開菊獸打成內傷，然後在儘量不流血，不造成汙染的前提下殺死它們！
在林克和他手下大量終結者造勢和帶動之下，整個世界都開始忙碌了起來。
“……現在我榮幸和莊嚴的宣佈！為了對抗開菊獸的威脅！人類將團結一致！環太平洋聯合軍防部隊（PPDC）就是我們人類的利劍！而現在，這把即將刺向開菊獸胸膛的武器，正式出鞘！”
2013年9月15日，聯合國召開峰會，‘環太平洋聯合軍防部隊’正式成立，在發表了一番振奮人心的演講之後，由世界各國派遣代表，組成了PPDC的初步框架。
在峰會上，首次確認了這種怪獸的名稱為開菊獸，並且把入侵美國舊金山的那只開菊獸命名為斧首。
建造巨型機甲來對抗開菊獸的獵人計劃正式提交PPDC進行討論，並且獲得了最大的支援。
2013年12月，在美國阿拉斯加州的科迪亞克島上，PPDC的第一個獵人基地就建立在這裡。
林克以首席科學家的身份加入基地，和他一起的還有佩吉，她主要是負責研究開菊獸，同時林克還招攬了精通機械制造的科學家加斯帕·謝菲爾德和腦神經科學家凱瑟琳·萊特卡普。
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四個人開始了合作，佩吉最擅長的就是生物改造方面的研究，加斯帕擅長獵人機甲的研發，凱瑟琳則負責開發人腦和機甲連線的相關技術，林克則給他們提供支援和建議，完善他們的研究。
在林克的指引之下，他們的研究進度都非常不錯，利用開菊獸殘骸發現了一種特殊的晶體結構，該物質與地球上所有已知元素不同，被命名為開菊結晶。
當利用將開菊結晶融入金屬當中之後，合金的韌性和強度都得到了極大地加強，這也是機甲獵人得意建造出來的關鍵。
另外林克利用天界模擬倉的相關技術，成功的構建了人腦與機甲連線的系統。
按照劇情，連線系統開發出來之後，因為一個人的大腦無法承擔這麼複雜的計算量，所以不得不研發由雙人共同連線操作的方式來操縱機甲。
不過這個方案被林克直接否決了，他拿出來了超級人工智慧‘星河’。
作為超級人工智慧，‘星河’擁有極其強大的計算能力，可以輔助人腦完成超過百分之九十的複雜計算，如此一來，就極大地緩解了人腦的壓力，讓單人操縱機甲得以實現。
2014年2月，就在首個機甲獵人開始建造的時候，新的開菊獸‘巨爪’在菲律賓馬尼**陸，早有準備的軍隊很快將開菊獸引誘到無人區，然後兩枚核彈炸死。
一個月之後，獵人機甲初次試驗開始進行，這個實驗型機甲儘管還有很多的缺陷，只能夠勉強做到行動，許多動作都無法做出來，不用實驗，就知道完全無法對抗開菊獸。
但這一臺實驗性機甲也成功的實現了從無到有的突破，任何一個作為科研的人都知道，從零突破到1是最難得一部分，這一部分解決了，接下來的研究頓時進入了快車道。
2014年6月，開菊獸‘梭角’襲擊了墨西哥的聖盧卡斯角，這只開菊獸身體結構非常牢固，被核彈殺死之後甚至留下了全屍。它的屍體被美國用航母運送到了阿拉斯加州科迪亞克島的獵人基地當中用於研究。
藉助了這一隻開菊獸的屍體，林克針對開菊獸的研究也加快了許多，其中關鍵是開菊獸的大腦資訊讀取實驗。
用科技的方法，除非像原劇情那樣危險的方式，否則沒有其他的辦法。
林克自然不會冒險，因此他選擇了使用神念攝取，只是最終只得到一些簡單並且零散的資訊。
作為生物兵器，開菊獸被製造出來之後，就得到了進入蟲洞到達地球然後盡全力破壞的命令，它的大腦中關於外星人的資訊近乎於無。
不過透過記憶的畫面，林克還是推斷出來了一些東西，其中主要是蟲洞那邊開菊獸被培養出來的環境，整個風格和地球迥異，不過在林克看來，更像是一個大型生物實驗室，而不是兵工廠。
“不過這也正常，畢竟只是一個兵器，是不需要什麼思想的。”林克心中想著：
“看來想要透過開菊獸更多的知道蟲洞那邊的資訊是不太可能了，不過開菊獸本身代表的生物科技卻有極大的價值。”
開菊獸本身代表的生物技術是很不錯的，佩吉就從其中延伸出來了數種生物技術，可以重新啟用人體細胞，延長壽命。
如今佩吉正在著手開發超級強化藥劑，主要是加強人體體質，突破人體極限，有一些類似於美國隊長的超級血清。
除此之外，還有超能血清的開發進度也得到了加快，這方面技術主要來源於緋彈世界的弗拉德。
他利用自己特殊的體質，融合了多種超能力，不過其中弗拉德本身的吸血鬼體質起到了最關鍵的作用。
在弗拉德被林克捕獲之後，他就成了實驗品，佩吉一直都想要研發出來可以讓普通人都覺醒超能力的血清，不過到現在為止，並沒有什麼特別的成果。
不過在研究了開菊獸之後，佩吉也延伸出來了幾個方法，正準備進行實驗。