1911年11月初，這時的武昌因為漢口失陷而岌岌可危。都督府內有人建議請黃興出任作戰總司令，黎元洪欣然同意。於是，1911年11月日，閱馬廠高築將臺，舉行隆重的“拜帥大典”，將臺上置有高桌，蒙以黃布，周圍是雄赳赳氣昂昂的武裝士兵，上座的都是營長以上的軍官。由都督府到將臺過道兩旁，站滿了文武官吏。
黎元洪、黃興兩人是並轡而出，文官脫帽，武官撇刀，兵士舉槍，莊嚴隆重，有過於黎元洪就都督的誓師禮。宣讀完任命狀之後，即由黎元洪都督授令，授旗，訓話，然後由黃興總司令答禮、答詞。黎都督退席後，黃總司令則騎著那匹已經騎過的高頭大馬繞場巡行，全場官兵舉槍致敬，禮成。
黃興就任革命軍戰時總司令之後，首先以防禦漢陽為主要任務，設總司令部於昭忠祠，任命李書城為參謀長。李書城原在北京軍諮府任職，是清朝官員，但是此時棄官投身革命。當時南北兩軍苦戰，隔江漢二水對峙，革命軍因漢口之戰損失過重，新成立部隊官兵大半未受過訓練，因此不堪大戰。
1911年11月8日，據黃興接報，漢口方面有清軍一萬餘人，在漢口劉家廟至橋口附近、沿江佈防，革命軍則在漢陽南岸嘴至三眼橋一帶防禦。日決定渡河攻擊漢口，當時判斷漢口清軍兵力約一鎮以上，也就是大約一個師。革命軍的戰鬥在11月16日展開革命軍渡過襄河左岸攻擊，進攻時湖北軍在左，湖南軍在右。湖北軍是臨時招募的，所以毫無作戰經驗，湖南軍雖然很勇猛，但是獨立難支，最終還是打輸了。
革命軍傷亡慘重，陣亡官57人，士兵79人，丟失山炮18尊，步槍600餘支，子彈00餘箱，革命軍進攻漢口失敗，於是全力固守漢陽。清軍因洞悉革命軍方面作戰實力不強，軍令也不統一，於是大舉進攻漢陽，自11月18日至11月6日，連戰八晝夜，11月7日，漢陽又再淪陷。
黃興登臺拜將受任總司令
當時，黃興是同盟會內重要性和地位僅次於孫中山的革命領袖。在辛亥革命之前，有名的革命之役，他大多參加並擔任組織任務，是一個革命的行動家。
在辛亥武漢起義之前，湖北革命黨的領袖就曾派人去香港邀請他來武漢主持發動武裝起義。但黃花崗之役的失敗，黃興一時灰心喪氣。加之他對湖北的革命形勢認識不足，因而沒有應邀前來。
10月10日，武漢起義爆發。黃興得知武昌起義的勝利訊息後，假道上海前往武漢。11月日，革命黨人提議公推黃興為湖北湖南大都督，位於黎元洪之上。
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但這個提議遭到劉公、孫武、吳兆麟等人的反對，主張由黎元洪委任黃興為戰時總司令。當時宋教仁只得認同，說：“此事不過徵求大家同意，我們原無成見既有利害衝突，即作罷論可也。”最後大家一致同意推舉黃興為戰時總司令，對所有湖北革命軍及各省援軍，他都有調遣之權。
11月日，革命黨人在武漢閱馬廠設立了一座將臺，舉行了規模隆重的儀典。各機關人員及軍隊營以上的官佐集合於臺前，將臺四角樹立軍旗，中間是“戰時總司令黃”的六字大旗。軍樂隊奏樂，黎元洪登臺宣告：“本都督代表中華民國四萬萬同胞及全國軍界同胞，特拜黃君興為戰時總司令，於本日此時就職……我將士皆須誠心悅服，聽其指揮。”說完，黎元洪請黃興登臺就職，接受關防、聘狀、令箭。
黃興接受任命後，發表了慷慨激昂的講話：“此次革命，是光復漢族，建立共和政府……今日既承黎都督與諸同志舉兄弟為戰時總司令，為國盡瘁，亦屬義不容辭……尚望大眾努力前途為要。
當晚，黃興全副武裝，前往漢陽，在漢陽昭忠祠設司令部，於歸元寺設糧臺，準備保衛漢陽，反攻漢口。6日漢陽失守，黃興失望地退回武漢。隨後黃興抱憤辭去總司令一職，於當晚離漢返滬。（未完待續）