以智騰長老為首的佛光寺和尚們都被送進大牢，由東廠和錦衣衛共同審問。
這些和尚人多嘴雜，嚴刑拷打之下，真相你一嘴我一嘴地就吐出來了。五臺山的智騰長老在宮廷有熟人，搭著這條關係，他知道皇后是佛教的信徒。由此，智騰心生一計，想出個讓惠恩和尚自1焚的毒計。他先是依靠關係找到坤寧宮管事太監曹化淳，將自己的想法傳達給皇后。曹化淳收受了五千兩銀子的賄賂，利用職務告訴了張嫣。
“關係”真是一條奇怪的紐帶，任何時期都有這門高深精微、妙不可言的“關係學”。
一切事務調查清楚之後，廠衛準備抓人。大內自然不能隨意讓這些校尉進出，抓人的職責交給了魏忠賢和他的乾兒子李朝欽。
魏忠賢帶著十幾位年輕力壯的宦官，來到曹化淳的面前，宣告要帶他去外頭問話。曹化淳一聽此言，忽然把右肩聳起來貼到右臉頰上來拼命搔癢。
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這原是曹化淳在市井里閭時養成的不登大雅之堂的習慣，做大太監後改掉了，但每當驚慌失措時，又會情不自禁地故態復萌。魏忠賢是紫禁城裡的老人了，他對曹化淳的這點小細節瞭如指掌。魏公公心裡想道：完了，這人救不回來了。
“來，把曹公公帶走。”魏忠賢喊道。
曹化淳就被宦官們押到大牢裡，跟和尚們一同被審問。
罪犯們暫且不論，皇后張嫣在乾清宮裡向皇帝下跪賠罪。
“寶珠，你可知罪嗎？”天子低沉而威嚴有力的聲音打破了尷尬的寂靜。
“臣妾知罪。本朝祖宗家法甚嚴，不準后妃干預宮外之事。臣妾因為信佛，誤交佛門敗類，險些害死人命鑄成大錯。請皇上發落！”張嫣一邊說著，眼淚就“吧嗒”地一滴一滴落下。
看見張嫣的認錯態度好，皇帝語氣和緩道：“皇后貴為天下母，更應該以慈愛之心待人，怎麼詭異的佛門‘盛事’，你為何就看不明白，還是寶珠你的心田出了問題！”
“皇上，請給臣妾一個機會，讓我痛改前非吧，皇上，嗚嗚——”張嫣真是被嚇到了。
正當朱由校要回話時，劉若愚從殿外走進來，行完禮說道：“萬歲爺，順妃娘娘說有關於此案的急事稟告。”
“順妃有急事，寶珠你先起來。”朱由校用手一指旁邊的杌凳，“你到這裡坐好。”隨後，皇帝跟劉公公吩咐道：“你傳順妃進來吧！”
也許是皇帝寵愛的緣故，也許是因為她是蒙古來的女子，反正張嫣總是提防著海蘭珠。
海蘭珠身披一件織錦點翠羽緞外衣走了進來，生完孩子的她，體態更加豐滿妖嬈，相比其他的妃嬪，身形可用渾圓二字形容。
“臣妾給皇上，皇后娘娘行禮了。”海蘭珠按照宮廷禮節一絲不苟地行禮。
“順妃起來吧，有何事要告知朕嗎？”朱由校問道。
“在幾天前，有一位叫劉娟的宮女，她為此次佛事刺血寫了一本《金剛經》，得到了皇后娘娘的獎賞。”
“朕知道，怎麼了？”
“這都人劉娟就是那被逼自1焚的惠恩和尚的親妹妹啊！”
“啊——竟然還有這麼巧的事？”
“回皇上，千真萬確，臣妾不敢撒謊。”
對話間，海蘭珠一直盯著皇上講話，看都沒看皇后一眼。
皇帝微微一笑道：“看來這家人真是有福氣，劉恩被朕救了，劉恩他爹被沈將軍救了，劉恩他妹妹被愛妃你救了。好吧，就讓他們團聚吧！”
“皇上之心大慈大悲，真是活佛。”海蘭珠稱讚道。
普通百姓人家養了兒子，巴望他讀書做官出將入相，生了女兒，卻沒有幾個父母願意把她送進皇宮。偌大一座紫禁城數千宮女，幸運者只是極少數，大多數宮女的命運都非常悽慘。青絲紅顏燦爛如花的少女一旦走進紅牆碧瓦的皇宮深院，從此就暌違永隔親情難覓，哪怕熬到白髮雞膚老態龍鍾，也絕不可能離開宮門一步。
因此讓劉娟出宮，這的確是特別大的恩典。被智騰長老毒啞了的劉恩在喻嘉言的治療下，漸漸痊癒了。幸好毒藥被錦衣衛查出來了。喻嘉言知道病是怎麼來的，能對症下藥。
劉家人聚在一起，紛紛流出了喜悅的眼淚，感恩皇上的厚德。曹化淳、智騰長老等罪犯的家產被抄沒，十天以後，要在西市集體處斬。
皇帝為此還特地發聖旨給各省各州縣的官員們，要他們嚴查寺廟、道觀的犯罪行為。如有作奸犯科者，立即上報京城。
至於皇后嗎，朱由校對張嫣畢竟還是有感情的，她生的大皇子，對大明王朝來書，也意味著希望和未來。皇帝不會廢后，也沒有施加別的懲罰。
不光如此，皇帝還允許張嫣每日花兩個時辰親自撫養兒子。這是不符合規矩的事，以前的皇子普遍是乳孃撫養長大的。張嫣熟知宮廷典籍，得此訊息真可謂欣喜若狂。皇后並不是例外，海蘭珠也有此待遇。
喻嘉言在治癒了無數病人之後，皇帝認可了他的能力讓他擔任大明醫學院的院長。
得到了皇帝的重用，喻嘉言很高興，同時也覺得肩上的責任重大。他在京城行醫這幾年，經歷了許多與庸醫打交道的過程，也經常納悶，怎麼這些人總是出錯。
正好醫學院給了喻嘉言一個機會，讓他能幫助別的大夫提高醫學水平。首先，是把他的弟子集中到一起。
面對第一屆的醫學生，喻嘉言提出每次給人看病之前，要先議病後用藥。
先議病，就是在診完了脈以後，先不著急給病人開藥，要先仔細思考，然後把病講清楚，這個病是什麼原因得的，病人的體質是什麼樣的，如何治療，用的什麼方法、什麼藥，藥效怎樣。這些都要跟病人及家屬說清楚，然後再給病人
下方子開藥，經過這樣仔細的思考，就會少走彎路。
這麼做還不夠完備，大夫還要寫下一個議病式。議病式就是中醫歷史上第一個完備的病歷格式。
接診一個病人，要先寫下接診的年月日和地點，還要記錄病人的年齡、體形、膚色、皮膚的枯燥或者潤澤、說話聲音的清濁、說話聲音的長短、情緒如何、什麼時候發病的、服用藥物的歷史、以前服藥的效果、病情白天重還是晚上重、身上寒熱如何、飲食如何、大小便如何，等等。
在穿越者看來，這個病歷格式非常先進。比如說，關於病人說話聲音狀態的記錄就很科學。說話聲音的確是診斷的一個重要資訊來源。
寫下月份，那是要記錄春夏秋冬四季對患者發病的影響。記錄地點也是類似的道理。
開方子之前還要寫下用的是什麼方子，根據什麼組成方子，方子中的藥都是什麼性味的，要用來做什麼，什麼時候能夠見效，什麼時候能夠痊癒，都要事先寫下來。
這個規定可以說是極其嚴格了，應當說大部分大夫都做不到這一點。但朱由校是要百分百支援喻嘉言的規定執行下去。
這個時代的醫學說到底是依靠經驗治病的，如果每個大夫的行醫經驗能夠彙總到一起。那必然是巨大的進步，可以篩選有效的處方。
朱由校親自撥款，在外城尋一處地方建了一家大醫院。光是建醫院還不夠，朱由校還要想辦法推動外科手術的發展，他公開宣稱送到醫學院解剖的屍體，可以給家屬一些賞錢。解剖研究之後，要請道士為屍體作法。這件事引起了軒然大波，許多朝臣上疏反對，但皇帝意志堅定，堅決推行。
數理院今年也有新發明，他們研究光學的小組，發明了探照燈。原理就是以凹面鏡放大光源，作為反光鏡，使光源向一個方向反射。
除了探照燈以外，數理院還發明了簡易的顯微鏡、放大鏡和近視、遠視眼鏡。
負責機械制造的副院長王徴則是向皇帝獻上了腳踏車。這是一輛雙輪小車，長約三尺，可以坐一人，不用推動就可以自行。一天能跑八十裡路。
皇帝看著目瞪口呆，親自上去騎了一番，的確好用。只是目前這門技術還實現不了生產線大規模製造。朱由校最後重獎了這些為天下做科學研究的人才，發了五萬兩白銀作為獎勵。
時間過得很快，到了天啟十年的春節，剛剛下過一場雪，萬歲山的峰巒上白雪皚皚。
皇帝與眾嬪妃玩一種新的冬日遊戲——滑雪板。滑雪板有四尺半長，一尺半闊，上端翹起，中間有一根撐木，木上置有劃竿，中後部設有騎木。從事滑雪者，跨在騎木上，推動劃竿，滑雪板就會前進，滑行速度不斷增加。但是，這種滑雪板不易在速行中保持平衡，稍微不慎，就會翻側摔倒。
朱由校是在西苑的太液池上玩此遊戲，湖水被凍得極為硬實。大家的歡聲笑語驅散了嚴寒的天氣。