1，發展歷程
ZAFT是Zodiac－Alliance－of－Freedom－Treaty（自由條約黃道聯盟）的簡稱，前身為Zodiac－Alliance（黃道聯盟），成立於50年，是西格爾?克萊因和帕特里克?薩拉為了爭取PLANT的獨立和平等待遇而成立的政治組織，53年格雷恩暗殺事件和54年S2流感大爆發使調整者與自然人的衝突急劇惡化，居住在地面的調整者大批移民PLANT，ZA的活動逐漸公開化，57年，克萊因和薩拉衝破理事國的阻撓進入最高評議會，ZA開始進入到PLANT的核心領導層，成為PLANT重要的政治力量。
63年，ZA開始MS軍用化研究，65年與幾個激進主義調整者團體合併成為ZAFT，而克萊因與薩拉因為政治觀的分歧開始分道揚鑣，克萊因派的勢力逐漸退出ZA，以及之後的ZAFT。
68年評議會選舉中ZAFT大獲全勝，掌握最高評議會，並在7月因為6月25日的曼德爾布羅特事件後與PLANT警察安保組織合併重組為裝備Ginn的軍事組織，隸屬於薩拉委員長領導的國防委員會。
在理事國的嚴密監視下，直到戰爭爆發，ZAFT仍然只是一支而精的軍事力量，因此得以普遍裝備最先進的武器，每一臺Ginn都是根據駕駛員進行改裝，相比之下理事國宇宙部隊則大量裝備量產的中低端武器。
70年2月戰爭爆發後，迅速擴軍的ZAFT作為PLANT實質上的國防軍與聯合軍作戰，成為可以抗衡聯合各**隊的強大軍事力量。
70年3月，在初步穩定局勢後，ZAFT進行了第一次整編，日後的ZAFT組織結構被確定下來，戰術手冊和指揮體系也是在這次整編中確立起來。
71年10月，ZAFT在獨立戰爭結束後進行了第二次整編，正規化程序至此正式完成。
72年4月，根據新一屆最高評議會稽核透過的《PLANT國家憲法》，ZAFT成為PLANT國防軍的正式名稱。
2，組織
作為民兵組織，ZAFT所有人員原則上志願加入，在成為PLANT實質意義上的國防軍後，ZAFT獲得在戰時緊急徵召國民進入ZAFT的權利。
由於是多個機構合併的產物，ZAFT本身的組成頗為繁雜，基本上任何和暴力相關的事務都處在ZAFT的管轄之下，從前線作戰（國防軍）、潛伏突襲（諜戰）、國內治安（警察）、武器生產（兵工廠）、軍事技術開發（設計局）無所不包。
70年3月底，ZAFT進行了第一次整編，理清了組織結構。
軍政方面，ZAFT歸屬最高評議會國防委員會領導，最高權力機構為國防委員會議（最高六人團），常設指揮機構為參謀本部，所屬成員分為作戰部隊（戰鬥艦隊）和非作戰部隊（參謀本部、軍情局、司法局、統合設計局、後勤整備司）兩種。
軍令方面，ZAFT的指揮序列只有三級，即綠衣―戰士，紅衣/黑衣/白衣―指揮官，紫衣―參謀/最高六人團。
戰鬥艦隊
人員組成包括操作員（軍服綠色，代號M，Manipulater）、MS駕駛員（軍服綠色、紅色、白色、紫色，代號P，Pilot），艦長軍服黑色、白色，歸屬在操作員。
戰鬥艦隊是ZAFT的機動部隊，一般用於主動進攻，是ZAFT最主要的作戰力量，一般而言人員不是太多，戰艦上的整備人員、醫護、伙食等後勤人員（軍服綠色）不屬於戰鬥編制，他們的身份歸屬仍然在原單位（醫院等），只擁有臨時的ZAFT成員身份，不屬於ZAFT正式成員，當然，待遇和正式人員一樣，指揮序列也歸屬各艘戰艦。
參謀本部
人員組成包括操作員（軍服綠色，代號M，Manipulater）、參謀（軍服紫色，代號S，Staff），是ZAFT常設作戰指揮機構，負責作戰計劃案的編訂、人員升遷調動、軍功考評等。
參謀本部作為ZAFT的大腦，實際上工作人員不是很多，即使在70年3月的時候也只有662人，其中操作員550人，參謀112人，特殊情況下，參謀也會參加戰鬥，其指揮序列在白衣隊長之上。
軍情局
人員組成包括總務處、內勤處、外勤處三部分，沒有軍服。
軍內識別號以SS開頭，是ZAFT僅有的八位識別號。
軍情局的職責包括對外情報搜集、國內對其他國家/勢力情報人員的甄別、對內部人員的監視及情報搜集以及機密作戰三部分，一般而言人員並不多，即使在勢力最盛的71年7月也沒有達到10000人。
但作為ZAFT最為隱秘的部門，軍情局局長有著與國防委員同級別的地位，也是國防委員會最為銳利的尖刀。
司法局
組織機構包括總局、各市區分局。
人員組成包括操作員（軍服綠色，代號M，Manipulater）、武裝兵（軍服綠色，代號A，Armsman）、各局局長/隊長（軍服綠色，代號C，Chiefman）。
職責類似警察，負責國內治安以及針對內部敵人、滲透分子的武裝作戰，同時也裝備有一定數量的Ginn，是戰鬥艦隊的第一序列補充兵員。
根據69年4月透過的《PLANT組織法》，司法局正式編制人員24480人（武裝兵19440人），71年7月，司法局被重組，人員擴大到37500人（武裝兵28400人）。
除了國內，ZAFT總部以及各大要塞、基地的武裝兵部隊也屬於司法局，是司法局的派出部隊，可以算作是內衛部隊，但一般這部分人員獨立於司法局的指揮體系而歸屬各個要塞、基地的指揮機構，在調回國內時返回司法局指揮序列。
統合設計局
組織機構包括各個技術驗證組。
人員組成包括測試駕駛員（軍服綠色、紅色，代號P，Pilot）、技術協助人員（軍服綠色，代號M，Manipulater）。
成立於70年3月，是原本三個兵器設計局合併而成。
擁有一定的機體、戰艦生產能力，是ZAFT最主要的機體設計開發部門，但實際上關鍵技術開發並不在這裡，而是在凡爾納設計局。
測試駕駛員一般直屬現役，但並不直接參戰。
後勤整備司
組織機構包括總務處以及派出在各市區、前線基地、戰鬥艦隊的整備人員。
人員組成為整備員（軍服綠色，代號R，Recondition）、操作員（軍服綠色，代號M，Manipulater）。
這是ZAFT人員最多的組成部門，一般而言除了各市區人員歸屬總務處指揮以外，其他人員歸屬所在地/艦指揮。
3，軍內識別號/編號
所有ZAFT成員包括臨時成員在內，每個人都有一個首字母+六位數數字組成的個人軍內識別號，本人轉屬後這個識別號也不會改變，除非職責改變，比如從整備員變成了戰鬥駕駛，那麼軍內識別號會重新指定。
以阿斯蘭?薩拉舉例明，阿斯蘭的軍內編號為P285002，一般簡稱285002，因為一般只有戰鬥駕駛才會因為轉屬等等原因，需要確認這個編號。
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首字母P明他的職責是戰鬥駕駛（Pilot）。
第一個數字2，表明他是正規軍校士官生出身。
ZAFT的駕駛員一般有4個來源。
外來駕駛員移民，編號1，在70年之後數量極少，但最初的駕駛員很多都是來自他國戰鬥部隊的調整者移民。
士官生，編號2，這也是正常情況下最主要的駕駛員來源，但可惜，ZAFT直到72年之後才算成為一個比較正常的組織。
職責轉換，編號3，即原本不是駕駛員的ZAFT成員轉換職責成為駕駛員，以數量而言，這是獨立戰爭時期最大的駕駛員來源。
平民，編號4，原本的平民因為某種原因成為戰鬥駕駛，之前既不是ZAFT成員也不是士官生、駕駛員，這在Junius－7事件之後一個月內最為常見。
第二個數字8，表明他是第8期士官生，即70屆士官生。
ZAFT的戰鬥駕駛培訓始於62年，但實際上，第1期的培訓時間很長，達到2年，這一期學員總數只有8人，包括勞?盧?克魯澤、安德留?巴爾特菲爾德、馬爾科?莫拉希姆等人，這也是唯一一批兩年期士官生。
64年，隨著MS開發所需的測試數據越來越多，ZA開始第2期戰鬥駕駛培訓。
65年，ZAFT成立的當年，阿米泰爾士官學校正式成立，戰鬥駕駛培訓走上正軌。
到70年，是第8期士官生。
第三數字5，表明他是70年第5批稽核進入ZAFT的志願人員。
ZAFT每年的參加稽核是每兩個月進行一次，特殊情況下有所增減，比如70年，在2月11日完成第1批稽核，而後因為戰爭原因造成第2、第3、第4批稽核幾乎擠在一起進行，而當年的士官生則被編在了第5批。
最後三個數字002，這是畢業時序，即他是當期士官生中第二個畢業人員，如同時畢業的話則以畢業測試成績排序，比如同時畢業的伊扎克?玖爾識別號為P285003。
4，基地
ZAFT以MS為主力兵器，以戰艦為活動基地，限於資源不足，大型軍事太空站以及要塞的建設直到戰爭中後期才開始。
Jachin－Due
前身為PLANT開採的資源衛星，59年被地球引力捕獲的行星，62年開始開採，70年4月在Jachin－Due附近進行了戰爭前期聯合宇宙軍最後一次大規模進攻戰，ZAFT從5月開始對Jachin－Due進行軍事化改造，71年6月完成。
作為軍事要塞，Jachin－Due常駐部隊包括40艘戰艦、350臺MS，作戰部隊15000人，71年6月底，建設中的GENESIS也配屬到Jachin－Due。
9月25日，在戰爭的最後，Jachin－Due要塞自爆。
Boaz
前身為東亞共和國所屬資源衛星Nova，70年7月被ZAFT奪取，71年6月完成軍事化改造，駐守部隊包括30艘戰艦、270臺MS，作戰部隊9000人。
9月23日Boaz被聯合軍核攻擊摧毀，駐防部隊陣亡超過3000人。
總部
戰爭開始後開始建造的環形軍事太空站，70年11月建成，內環半徑12km，外環半徑12.5km，厚度15km，作為ZAFT本土防衛部隊的主要集結區，駐防部隊80艘戰艦、300臺MS，作戰部隊27000人。
ZAFT總部作為軍事太空站，建設有大量的船塢、整備工場、軍事倉庫，承擔著ZAFT本土區域60%的維修整備任務。
5，兵力規模及戰爭損失
70年2月11日
作戰部隊包括31艘勞拉西亞級戰艦、209臺Ginn、244名駕駛員，總兵力8282人。
ZAFT成員總數5.1萬人。
70年4月1日
ZAFT完成整編，89艘勞拉西亞級戰艦、694臺MS、887名駕駛員，作戰部隊5.6萬人。
ZAFT成員總數28萬人。
70年8月
兵力規模256艘戰艦、1800臺MS，作戰部隊9.2萬人。
ZAFT成員總數35萬人。
71年9月11日
最終決戰前，作戰部隊包括220艘戰艦、1950臺MS，9.5萬人。
ZAFT成員總數37萬人。
戰爭期間，ZAFT有14.7萬人戰死，2.2萬人死於清洗，26.8萬人負傷，傷亡總計43.7萬人，損失4881臺MS、304艘戰艦，3915名駕駛員戰死、406名駕駛員死於清洗。
6，著名部隊
6.1，克魯澤部隊
以62屆紅衣勞?盧?克魯澤為隊長建立。
克魯澤62年加入ZA，成為首批測試駕駛員之一，67年ZGMF－1017，Ginn完成，68年7月ZAFT正式組建MS部隊，最初的MS部隊包括四支，即克魯澤部隊、薩蘭特部隊、莫拉希姆部隊和巴爾特菲爾德部隊。
69年4月，憑藉在驅逐理事國聯軍行動中的優異表現，克魯澤部隊獲得紅衣優先權，成為“克魯澤紅衣部隊”，70年2月迅速擴大，22日擔任“世界樹”的奇襲部隊時已經包括了4支MS隊，5月在月面戰線作為尖刀連續多次撕破聯合軍陣線，最終迫使聯合軍選擇用Clcyops－System發動自殺式攻擊，戰鬥中ZAFT月面攻略的戰鬥部隊損失70%，克魯澤部隊也損失了一半兵力，ZAFT被迫撤離月面戰線。
之後，克魯澤部隊離開前線，成為專門執行特殊任務的精英部隊。
9月，阿斯蘭等人加入克魯澤部隊，71年1月成功強奪G，2月11日毀滅第8艦隊，克魯澤部隊成為ZAFT的象徵之一，9月，因克魯澤本人戰死，克魯澤部隊解散。
6.2，巴爾特菲爾德部隊
以62屆紅衣安迪?巴爾特菲爾德為隊長建立。
巴爾特菲爾德57年加入ZA，62年成為首批MS測試駕駛員之一，68年7月建立巴爾特菲爾德部隊，70年2月參加“世界樹”攻防戰，但因為無法接受ZAFT的屠殺行為而放棄作戰指揮，導致部隊成為此戰中兩支戰績最差的部隊之一（另一支是薩蘭特部隊）。
4月開赴地面，成為第一支MS地面部隊，5月在第一次蘇伊士攻防戰中指揮陸戰四足獸MS，BaCUE擊敗歐亞聯邦戰車部隊，成為ZAFT北非部隊指揮官。
71年5月，帶領部隊參加直布羅陀攻防戰，6月ZAFT放棄直布羅陀，歐亞聯邦軍攻略北非，在第二次蘇伊士攻防戰中巴爾特菲爾德部隊幾乎全滅，本人重傷。
7月在溫和派的安排下假意投靠強硬派，受命成為“永恆號”艦長，但在7月11日薩拉發動對溫和派的清洗後，於7月12日配合克萊因派奪取“永恆號”叛逃，29日在與追擊的雲雀部隊戰鬥中戰死，巴爾特菲爾德部隊成為歷史。
6.3，莫拉希姆部隊
以62屆駕駛員馬爾科?莫拉希姆為隊長建立。
莫拉希姆54年加入ZA，62年成為首批MS測試駕駛員之一，68年7月建立莫拉希姆部隊，70年2月參加“世界樹”攻防戰，4月開赴地面，成為第一支MS水下部隊，指揮水戰實驗MS，Gu00N和ZnO擊敗聯合軍對卡潘塔利亞基地的壓制作戰。
之後，以莫拉希姆部隊的戰鬥資料為基礎，ZAFT組建水下部隊，71年5月直布羅陀戰敗之後，ZAFT開始逐步撤出地面，6月底，莫拉希姆部隊與聯合軍第一支水下部隊Forbidden－Blue激戰，損失過半，隨後ZAFT完全撤出地面。
72年2月ZAFT重建水下部隊時，莫拉希姆部隊再次返回地面。
6.4，薩蘭特部隊
以65屆紅衣拉斐爾?薩蘭特為隊長建立。
薩蘭特65年加入ZA，68年7月建立薩蘭特部隊，70年2月成為“世界樹”攻防戰表現最差的兩支部隊之一，僅比巴爾特菲爾德部隊好一，之後在Nova表現出色，成為ZAFT第二號王牌部隊。
71年4月27日緊急支援高雄，5月2日拉斐爾薩蘭特重傷，二號王牌雷奧萊特納陣亡，部隊全滅，7月薩蘭特傷愈歸隊，9月24日在Jachin－Due戰死，薩蘭特部隊至此消失。
6.5，雲雀部隊
以70屆紅衣虹?阿瑪菲為隊長建立。
虹?阿瑪菲於69年加入ZAFT，一直作為後方技術人員，71年1月完成Phoenix之後加入前線，2月組建雲雀部隊，隨著阿斯蘭等人的轉屬取代克魯澤部隊成為新的紅衣部隊
5月之後先後支援高雄攻防戰、直布羅陀攻防戰，6月參加巴拿馬攻防戰，支援蘇伊士攻防戰、維多利亞攻防戰、卡潘塔利亞攻防戰，一直作為斷後部隊活躍在前線。
9月25日停戰之後，聯合軍基本毀滅，10月4日，雲雀部隊解散。
由於集中了大量ACE和精銳MS，雲雀部隊成為大戰中戰績最高的部隊，ZAFT單人戰績最高的8人中雲雀部隊佔據6人。
7，Top－Ace
7.1，基拉?大和
座機：Freedom
軍內識別號：P485010
所屬：雲雀部隊
戰績：227臺MS，107臺MA，戰艦25艘
簡介：71年2月11日參戰，10月4日退役
=
7.2，辛?拉斯特
座機：Testament
軍內識別號：P182202
所屬：雲雀部隊
戰績：226臺MS，151臺MA，戰艦12艘
簡介：70年2月25日參戰，71年10月4日退役
=
7.3，勞?盧?克魯澤
座機：Providence
軍內識別號：P211001
所屬：克魯澤部隊
戰績：201臺MS，139臺MA，戰艦12艘
簡介：70年2月11日參戰，71年9月25日戰死
=
7.4，阿斯蘭?薩拉
座機：Justice
軍內識別號：P285002
所屬：雲雀部隊
戰績：161臺MS，106臺MA，戰艦14艘
簡介：70年9月22日參戰
=
7.5，迪亞哥?艾爾斯曼
座機：601G
軍內識別號：P285005
所屬：雲雀部隊
戰績：132臺MS，71臺MA，戰艦39艘
簡介：70年9月22日參戰
=
7.6，詩和?哈尼夫斯
座機：601G
軍內識別號：P285009
所屬：雲雀部隊
戰績：109臺MS，46臺MA，戰艦14艘
簡介：71年4月7日參戰，10月3日退役
=
7.7虹阿瑪菲
座機：Phoenix
軍內識別號：P175001
所屬：雲雀部隊
戰績：107臺MS，77臺MA，戰艦36艘
簡介：71年1月26日參戰，10月4日退役
=
7.8，拉斐爾?薩蘭特
座機：601AS
軍內識別號：P230502
所屬：薩蘭特部隊
戰績：105臺MS，56臺MA，5艘戰艦
簡介：70年2月11日參戰，71年9月24日戰死