真嗣轉校的學校是日本新首都第三新東京市(位於日本箱根)的市立第一中學。
校內有NERV的人員，2年A班也是一個校方安排的特殊班級，在這裡的孩子都被“馬爾杜克機關”作為後備駕駛員，同時所有人家庭都不完全，都是缺少母親的孩子。
馬爾都克機關（MardukProject）是為了選拔EVA駕駛員而設立的一個諮詢機構，直屬於人類補完委員會（SEELE明面上以監督碇源渡實行人類補完計劃為目的而成立的直屬組織）。
在記錄上，適格者們都是由此機關加以甄選稽核之後才送到NERV的，唯一的例外是第五適格者渚薰。不過，根據暗中潛入NERV內部做調查的加持所得到的情報顯示，跟這個機構有關係的108家公司中，有107家都只是掛名的空頭公司。在遮遮掩掩的障眼法背後，似乎意味著EVA操縱者的產生過程有相當的隱情。或許馬爾都克機關背後的正體就是NERV，更或者是碇司令本人也說不定。
綾波麗一開始就被安排進入2年A班級學習，不過由於性格冷漠，一直被孤立而不自覺，或者說氣場讓人不敢接近。
大部分人喜歡綾波麗，是因為她幾乎符合青春期男生對異性的所有幻想，無論是起初的神秘冷漠、中間解開心扉還是最後的遺憾。
真嗣一大早就去學校辦理了轉學手續，然後就到2年A班報到。
他一進教室，就在黑板上寫了自己的名字，“大家好，我是新到的轉學生碇真嗣，請多指教。”畢竟沒真正上過學，真嗣昨晚特地問了美里怎麼走流程。
班裡突然安靜下來，然後眾人開始竊竊私語，對真嗣品頭論足。
“蠻帥哦~是我喜歡的型別~”這是女同學的反應。
“切！”男同學的反應。
此時使徒還沒來，班裡處於人數最多的時候，所以空位只能在最後邊加張桌子了。
真嗣目光一掃，就找到坐在窗邊的綾波麗，她正一臉出神地注視窗外。在嘈雜的教室裡，她座位周圍竟然有些冷清。
“綾波！”表人格的真嗣一看到她就滿臉傻笑，走到她身前，“我轉學過來了，以後就跟你是同班同學啦！”
同學們紛紛側目，綾波在學校沒一個朋友，這個男同學主動找她說話好像之前認識的樣子，大家都想知道冰山女神作何反應。
綾波不為所動，連目光都沒收回來，繼續支著手不理人。
“我們以後好好相處吧！”真嗣這個厚臉皮又湊近了幾分。
“為什麼？”
“以後我們就是戰鬥夥伴了。”真嗣已經知道綾波是第一適格者(FirstChildren)。
“是命令我就做。”綾波回答。
裡人格也鬱悶得很，這是應付明日香的臺詞吧。
如果是正常人肯定被噎得說不了話，甚至被傷害脆弱的自尊。但表人格的真嗣卻非常高興，按他理解，綾波的意思是達到條件就可以做朋友。
“你服從我父親的命令嗎？”
“是。”
“太好啦。”真嗣說著就掏出了手機給老碇打電話，這可是最新款的觸屏手機，售價不菲。
呼叫了半天，竟然接通了，真嗣無視他人直接開了揚聲器。
“什麼事？”電話裡傳來老碇不耐煩的聲音，綾波麗終於轉過頭，注意真嗣這邊。
如果是原版真嗣，肯定支支吾吾說不清楚。但現在的真嗣又愣又呆，他只把老碇當成一個稱呼叫“父親”的人，全沒有父子血親的概念，也不怕他。畢竟他從未得到過父愛也就沒有失去的痛苦。
“父親，能不能拜託你一件事？”
“說！”
“你能不能命令綾波麗跟我做朋友，她說只聽你的命令。”
電話裡沉默了幾秒，氣氛幾乎凝固了。
“不要為了這種無聊的事打電話過來，我沒時間陪你過家家。”好一會兒才傳來老碇的訓斥聲。
“別這麼小氣嘛，就一句話的事情……”真嗣還沒說完電話就被老碇掛了。
綾波麗繼續三無臉。
“我也不是很願意找你這個蘿莉控父親啊。”真嗣嘟囔道。
綾波麗的眼神變得犀利起來。揚起手，“啪”地一聲就給了真嗣一記愛的鞭笞。
同學們立刻驚呼起來，真嗣被打蒙了，捂著臉，眼睛紅紅的就要哭了。畢竟從小到大還沒捱過這樣的打，太委屈了。
裡人格趕緊清醒救場，他也不知道無口女神這麼兇啊。要是在眾人面前大聲哭出來，以後沒臉在學校混了。
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先進行一番自我暗示的安慰，用《讀懂女人》裡面的解釋：女人是情緒化生物。情緒變化比翻書還快，上一秒鐘還是很高興的樣子，可能僅僅因為一句話、一個小動作立馬變臉，要及時注意她的情緒變化。
《少男少女交友秘技》的解釋：如果一個女生打你，罵你，說明她還是在乎你。愛的另一面不是恨，而是漠然。有情緒，是因為有需要。
“嗯，我是被需要的我是被需要的！”先仰頭把淚光憋回去。
真嗣對坐在綾波麗右手邊的男生說：“同學你好！能否把這個位子讓給我，這是一點心意。“說著遞上一個信封。
那位看熱鬧的男同學開啟信封一看，立馬收拾東西。走開的時候還拍拍真嗣的肩膀悄聲說，“幹吧嗲哥們兒，我看好你哦。”畢竟換個座位就得到好幾個月的零花錢誰不開心。
真嗣從此成為一中最出名的轉學生，畢竟第一天就因為泡女生挨了巴掌可不多見。又因為真嗣出身不凡的樣子，出手闊綽，所以學校裡流傳了關於他好幾個版本的故事，什麼富二代調戲女同學捱打，還有始亂終棄之類的流言。
相對的，綾波麗在班裡的氣場又冷了幾分，以前是誰也不敢跟她說話，現在是連目視也要小心翼翼了。
上課時，大家都用電子版教材，人手一個膝上型電腦。所以班裡聊天資訊傳瘋了，真嗣就收到班裡好幾個男同學的招呼，說哥們兒勇氣可嘉。好幾個女同學則透過旁敲側擊詢問真嗣的家庭資訊，真嗣一概不鳥。
他上課一手託腮，用受傷小狗的眼神關注著綾波麗，無口女神毫不在意，把他當空氣。
放學後，真嗣緊跟綾波麗，亦步亦趨。
綾波麗腳步明顯加快了，表人格鼓起勇氣又追了上去。
“為什麼跟著我？”
“因為我想瞭解你。”
“為什麼？”
“因為你很特別。”真嗣見她願意說話很高興。
綾波麗突然停住，回頭直視著真嗣，被那雙殷紅的眼睛盯著，真嗣感到無形的壓力。
“不要再跟著我了。”綾波麗再次警告。
“女人說‘不要’就是‘要’……女人生氣了那根本不是生氣了，是要你哄她……”表人格唸唸有詞。
“我請你吃飯吧，綾波？”真嗣嘗試用美食來哄綾波麗。
“啪！”綾波麗毫不留情又給了真嗣一巴掌。
“嗚——”真嗣終於受不了了，哭著跑掉了。
表個人格實際上還是個孩子啊，好不容易鼓起勇氣第一次主動交朋友卻遭受如此慘痛的打擊，就是個正常男人都受不了，自尊早就被踩得粉碎了。
“靠，看得我尷尬症又犯了……”裡人格吐槽，太羞恥了。