朱由檢現在面對到的最大難題，最突出的表象是財政危機，用錢的地方越來越多，收上來的錢越來越少，大明朝這家已經經營了將近三百年的公司，到今天終於開始要破產了，入不敷出，寅吃卯糧，已經到達了崩潰的邊緣。
朱由檢費盡心力尋找解決辦法，但他過去學到的知識，不管是聖君修德，還是多作善事，統統沒用，什麼聖人之道，什麼帝王手段，落實到實際當中全都不能解決問題，沒錢還是沒錢。
正因為這樣，他才會失態地痛哭出來，他感覺到無助，感覺到彷徨，不知道該怎麼做。
李雲崖跟他說：“所謂能救急救不了窮，我算這次借給你錢渡過難關，用不了多久你還是缺錢，不但舊債還不上還會增添新債，總有一天會到了我也救不了的時候。”
朱由檢不是傻子，相反他還很聰明，這回情緒已經穩定下來，讓李雲崖稍等，叫太監端水進來洗臉淨手，重新穩定下來，聽李雲崖一番訴說，他站起來走到李雲崖面前，深深鞠了一躬：“還望雲崖不吝賜教！”學的是古代明君請教聖賢的作風。
李雲崖樂了，讓他坐回去，耐心地講：“你沒有錢主要原因有兩個，第一個最深層次的原因是土地兼併，大明朝立國近三百年，越來越多的土地都落到官紳手裡，而他們是不用交稅的。交稅的人越來越少，國庫自然越來越空。譬如這次後金入寇，京畿地區處處狼藉，死傷無數，很多滿門被殺，地主官紳乘機用各種手段吞食無主土地，我這幾個月都進賬了一百多萬畝，但我是不用交稅的，那些官紳也是一樣。”
朱由檢聽完默然不語，考得功名不納糧，是開國留下來的祖制，甚至是過去歷朝歷代留下來的傳統，他又有什麼辦法呢？聽李雲崖臉不紅氣不喘地說自己弄了一百多萬畝地，朱由檢更是鬱悶，他的皇莊加起來都不如人家的一半多。
“第二個原因，是官員們欺上瞞下，這兩年朝廷裡有辭官潮，一個個老人家回到家鄉，搞書院辦學，培植鄉黨，又相互勾結，說朝堂上有我這個妖道作祟，他們絕不出仕，現在很多有志青年都寧願在民間一面苦讀聖賢書，一面大罵朝廷，我估計如果去年我沒有親自帶兵跟建奴打上一場，此刻他們早起來要清君側了。”
“他們敢！”朱由檢怒道。
“他們有什麼不敢的？這班人跟地方政府沆瀣一氣，故意虛報災荒，或是從中截留，交上來的錢糧越來越少。你派人下去，也因為他們盤根錯節，回來告訴你的也是虛假訊息。我聽說還有一部分士子甚至是官員已經投靠了流寇，現在的高迎祥、張獻忠等人身邊都有人輔佐，這些人幫他們宣傳，說大明朝氣數已盡，高迎祥身上有龍氣是真命天子，張獻忠更是天神下凡，懲治明朝這條赤焰孽龍……”
“砰！”朱由檢狠狠捶了一下桌子，氣哼哼地沒有說話，這會外面的太監學乖了，沒有再冒失失地跑進來。
“不然你以為西北那些流寇怎麼會發展的這麼快？高迎祥甚至打出了佔據關中，守潼關稱帝的旗號，張獻忠也要入川，賀人龍他們幾個打得那麼艱苦，連洪承疇跟曹文詔也有些穩不住局面，主要是在於，流寇們的性質已經變了，若前段時間打下長安城，此時已經稱王稱帝了。”
朱由檢氣鼓鼓的：“雲崖想必已經有了對策了？”
“嗯，要解決這兩個問題，可用一個辦法，設立公安部。”
“公安部？”朱由檢聽這個詞感到新鮮，“可是跟六部一樣的？”
“是在六部之外，既然六部這個體質已經完全爛到根了，索性在六部體系外另設一部，所謂公安，即為公共安全，以我軍校出來的軍人為主，以你錦衣衛的人為輔，再加上一部分地方的捕快，中央設立公安部，各布政使司設立公安廳，州府設立公安局，縣設分局，鄉鎮設派出所。主要職能負責普查人口，偵辦破案，緝拿要犯，等穩定之後，讓他們收稅。”
“讓他們收稅？”
“對，不經過戶部，收上來的錢直接給你。”
“此事關係重大，恐怕……”朱由檢滿臉為難。
“我知道你擔心什麼，可以先不收農稅，各地田賦仍然給戶部收，咱們共公安系統只收商稅，凡各地坐商，按規模和營業利潤分成五等，各自繳納一定數目的商稅，否則不得開張營業。”
朱由檢深吸了口氣：“萬曆年間張居正時曾經有人提過要收商稅，被朝臣群起攻之，說是與民爭利，此法一出，恐怕天下動盪，造反從賊之人更多。”
“不可能的。”李雲崖笑道，“拿我現在名下的產業威力，我一個瓷器店，每個月能掙上萬兩銀子，但是有很多當地的地痞流氓，縣衙差役，等上門卡要，當然他們不敢跟我的買賣勒索，但一般這樣規模的店鋪都會交出數百兩銀子不等，咱們成立公安部，是想要這份錢，每個月收一百兩，然後嚴厲打擊一切勒索強要，他們會很願意給的，而且，交錢的商戶發給他們一張營業文書，不需要再向任何人繳納任何無關費用，你想想，天底下有多少家商戶，比我那瓷器店更大的也有，如果這些錢全能收上來，你再也不用為錢糧發愁了。”
朱由檢怦然心動：“那如何解決第一個問題呢？”
“那也簡單，用攤丁入畝，以及官紳一體納糧！”
“官紳一體納糧？”朱由檢雖然有預感他會說出這樣的話，但當真正聽到之後，也還是感到有點接受不了，畢竟不納糧是士大夫階層的福利，不只是明朝，往前的宋朝、唐朝、甚至更古老沒有科舉制時候的其他朝代，士大夫們也是不納糧的。
李雲崖說：“首先是攤丁入畝，過去咱們收人頭稅，按人收稅，但很多人的地已經賣掉了，他沒有土地了，仍然要交稅，而很多大地主擁有無數土地，卻又只交一個人的賦稅，所以要改革稅制，不再收人頭稅，改收土地稅。至於說官紳一體納糧，譬如我名下有一百多萬畝土地，按三分之一繳納公糧，一年也能給你八十多萬石糧食，夠你養活多少軍隊？夠你賑濟多少災民？這還單是我一家，整個北京城裡有多少比我地更多的高官顯宦，王公貴胄，說句不好聽的，國家危難時，他們不能出一把力嗎？”
攤丁入畝在明朝時已經在搞了，只是進展不大，要到清朝康乾年間才落實，至於官紳一體納糧是雍正皇帝主推的，當時清朝財政緊張，雍正排除萬難落實下去，也正因為這點，雍正在歷史上留下了許多罵名，得罪了掌握話語權的士大夫階層們，連皇帝都別想有好名聲。
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朱由檢到底有沒有後世雍正的魄力？李雲崖把決定權交給他自己，反正藥方自己是開出來了，你不吃別人也沒辦法。
最終，朱由檢只答應他組建公安部，至於攤丁入畝和官紳一體納糧他還要再斟酌斟酌，等日後再決定要不要推行。
李雲崖回到京營，立即開始抽人，挑出一萬名素質還算不錯的，再去錦衣衛調了五千人，共一萬五，明朝錦衣衛和東廠在魏忠賢手裡得到迅猛發展，人數激增，全國各地特務遍地，到了崇禎朝被朱由檢各種打壓，人數也下來了，而且遠沒有當年威風，一個個都得夾著尾巴做人。
李雲崖從中央到地方，整個錦衣衛系統裡面抽掉了五千名歲數合適的年輕人，把他們混編在一起，然後散放到全國各地。
先在北直隸做樣板，李雲崖親手設定構架，先於北直隸設公安廳，順天府、永平府、保定府、真定府等設公安局，下面大興縣、宛平縣等設分局，再下面的鄉鎮設派出所。
所有的廳長、局長等掌管都是軍官學校出身，下面的分局長、所長大部分是京營才接受了一個多月訓練的士兵，也有一少部分是錦衣衛，他們在州縣裡面挑選適齡的衙役和捕快，合起來統一稱為警察，主警示巡察之意。
這些人大多沒念過什麼書，但是他們年輕、熱血，他們還沒有被社會大染缸腐蝕過，李雲崖不要求多，只要求自己的命令，他們能夠不打折扣低照辦，他連夜擬出一份最簡單的警察行為守則，讓他們知道自己的職責是什麼，該做什麼，不該做什麼，遇到問題怎樣處理等等，他精力有限，只能手把手建立一處順天公安局，一處大興分局，其他的靠他們自己照貓畫虎去搞，他再抽出時間到各處巡視，有不對的立即糾正，忙活了兩個多月，才搞得差不多了，然後把這些人散出去，以老帶新，將這套公安系統擴大到山東、山西、河南三省。