在軍火賣得不亦樂乎的同時，李雲崖跟朱由檢繼續進行全國性的軍事調動,他倆把全國各地水師的艦船全部集中起來,包括鄭芝龍的那些船,挑出能戰堪用的,重新編入各支艦隊當中,並組建新的北海艦隊，司令是袁可立的兒子袁樞。
至此,大明朝各路水師全部整編完畢，有北海、東海、南海、西海四支艦隊,其中北海和東海艦隊統屬於東北戰區，由盧象升統御,朱由檢在崇禎十一年年初的時候，單獨把國防部的人召集到一起開軍事會議，連同李雲崖一起制定了收服日本的策略,也被列於第二個五年計劃當中,只是這些沒有對外界公開。
北海艦隊成立伊始駐紮在海參崴,向北封鎖韃靼海峽,佔據庫頁島,東海艦隊則駐紮在釜山,佔據濟州島、對馬島，封鎖對馬海峽，盧象升下令袁樞和袁崇煥，分別從一南一北夾住日本，將日本島周邊地區設為禁航區，不論任何國家的船隻，只要出現在這片海域上立即擊沉。
禁航令一出，荷蘭等常做貿易的諸國首先提出抗議，但是沒用，他們還要買大明的武器，不敢跟大明翻臉，荷蘭一支擁有兩艘海鯊艦護航的船隊被擊沉三分之一，其餘全被俘虜，船上貨物都歸了大明，船上的人一百兩銀子一個讓他們贖回去，至於船隻能用的都拉回天津拍賣，那兩條海鯊艦修整修整，打八折賣給了正缺貨的西班牙。
這回各國終於徹底死心，知道大明玩真的，再沒有外界的任何一艘船敢靠近日本。日本內部的船隻也出不來，包括打魚的漁船，只偶爾有個別越獄成功的，但數量極少。
卻說在萬曆年間，鼎鼎大名的豐田秀吉以武力統一全國，然後開始制定了先佔領朝鮮，再征服中國，然後向南洋擴張的軍事計劃。日本這個國家，因為島上地震火山頻發，颶風海嘯什麼的也不少，多災多難，始終垂涎中國廣袤富饒的土地，早在唐朝時候爆發過白江口之戰，唐朝派大將蘇定方率軍十三萬馳援新羅，一戰而勝，打得日本服服帖帖，在此後幾百年間，派遣十幾批“遣唐使”到中國來，全面學習中國的文化、政治、經驗等。
直到三四十年前，豐臣秀吉統一全國，於是又開始惦記登陸，要征服中華和朝鮮，要把“唐”之領土納金日本版圖，短短兩個月的時間，朝鮮三京十八道全部陷落，一直打到鴨綠江南岸，並要求琉球、呂宋等皆奉他為正朔，成為日本藩屬國。萬曆皇帝派大將李如松率兵馳援，經歷一番大戰，又把日本打回了老家。
鐵一般的事實證明，日本這個國家，只要被打服一次，能老實一段時間，時間的長短跟捱揍的輕重力度成正比，如果揍得狠了，他還會主動跟你交好，跟你親善。
後來的日軍侵華，跟萬曆年的這場大戰如出一轍，都是欲奪中國，先奪朝鮮，李雲崖為了使悲劇不再重演，決心將日本徹底搞定。
如今豐臣家族已經□□掉了，日本進入幕府時代，在原先的戰國時代，日本對外貿易比較發達，跟中國、朝鮮、東南亞各國都有大量的貿易往來，一些藩國透過跟西方貿易，實力迅速擴張。德川幕府掌權之後，開始釋出鎖國令，嚴禁跟西班牙、葡萄牙等國貿易，只有荷蘭搞得好，跟中國、朝鮮得到允許，但是只准在長崎一地進行，還規定日本人不許出國，甚至禁止製造遠洋船艦。
這回被大明海軍徹底封鎖，非但所有的貿易全部歸零，連到稍微離陸地遠一點的地方捕魚都不允許，袁樞率領的北海艦隊創下了一日擊沉日本漁船七百二十艘的記錄。
日本的人口密度一直都很大，這時候初略估計，已經有八百多萬人口，全部擠在災害頻發的島子上面，周邊被徹底封鎖之後，裡面的情況可想而知。
德川幕府大怒，湊了兩千多只戰船，來跟明軍拼命，這一戰，雙方投入船隻多達三千多艘，在日本海上展開大決戰，盧象升磨刀霍霍，等的是這一天，下令兩支艦隊南北夾擊，雖然明軍船少，但噸位都大的離譜，東海艦隊的旗艦蛟龍艦排水量達到了恐怖的五千三百多噸，艦首炮採用雙管並行，能同時發射兩枚超大號的炮彈，一炮過去，木屑紛飛，船碎人亡，遇到小船直接硬衝過去，如書上寫的“車碾螳螂”一半，其餘改進型的巡海夜叉，虎鯨4，海鯊31，以及新建造的海鰍船，都已經採用全蒸汽動力，風帆完全扔掉，甲板上架設滿了各種各樣的武器。
明軍鐵甲艦總數高達一百零七艘，衝進日軍戰船堆裡，像虎入羊群，炮聲隆隆，硝煙滾滾，於無邊洪波之上，直打到風起雲湧，烏雲閉合，最後暴風雨要來了，雙方才各自收兵。
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日軍損失慘重，不用風帆的鐵甲艦讓他們敬畏神物，趕緊派人來向大明求和，表示願意洗心革面，不再要琉球、呂宋那些國家奉他為宗主國了，而且願意年年進貢，歲歲稱臣，還要派人來學習中國的鐵甲艦技術……結果當然是被拒絕了，明軍也不上岸，在日本周邊地區封鎖著，日本到底沒有膽量駕駛殘餘艦船出來再打一場，只能努力在家裡種田，自給自足。
在東北開戰的同時，西北也在動手，孫傳庭率領十萬騎兵橫掃西域，李雲崖劃定的大明版圖西北是以鄂畢河、額爾齊斯河為界，向南包攬新疆一直到帕米爾高原，讓人築城，設立州府，這部分裡面的所有反叛部落，不肯歸順的，讓孫傳庭全部幹掉，要麼死，要麼跑，跑出國界不管你，哪去哪去，明軍戰鬥力強悍，彈藥充足，自從李雲崖跟朱由檢開始賣軍火之後，更充足了，這些還在彎弓射大雕的部落根本不是對手，比較棘手的是俄國的哥薩克起兵，他們一波一波地從烏拉爾山那邊過來，遇到有人的地方，燒殺搶掠，不管是哪個部族，下手都毫不手軟。
明軍跟他們遭遇過幾次，警告過幾次，然後開始驅逐，明軍武器先進，但這片地區太大了，始終無法全面阻止，只能見著殺，對方三次集結軍隊，數量越來越大，最多的一次，共三萬騎兵在廣袤的西伯利亞平原上跟明軍決戰，時打時跑，反反覆覆打了兩年多，最終被孫傳庭消滅了兩萬多人，只剩下六千殘兵被趕回鄂畢河西岸。
孫傳庭將這邊的情況寫成奏摺發往北京，有人建議放棄這些不毛之地，明軍為了這些地方徒耗軍力錢糧實在不智，而且俄軍比當初的滿清國力更加強大，所需要建設防禦的戰線更長。
李雲崖堅決反對這些人的建議，並在報紙上發表“一寸山河一寸血，一億青年一億兵”專題文章，十分明確地告訴大家國土、國境、國家、民族的概念，朱由檢也做出最後決定，大明朝的土地，一寸也不能丟，再有言放棄國土者，以叛國罪論處！
守土的基調定下來，下面是如何守了，這時候大家的意見都傾向於修築防線，甚至是衛所，連孫承宗的意見都是，像當年構建寧錦防線一樣，重新構築一條跨越西伯利亞以及蒙古高原的北方防線——他們這樣做，也是委婉地提醒李雲崖守護這些地方所需的成本。
李雲崖不同意：“我們比他們強，憑什麼要防禦？他們能過來殺人，我們為何不能？”他建議先發制人，以攻為守，主動打擊。
朱由檢最終採納李雲崖的建議，命面令孫傳庭越過鄂畢河，收服鄂畢河西岸的部落，以戰養戰，最終湊夠十萬騎兵，擺出一副要殺到莫斯科的架勢，俄國人緊急動員了二十萬大軍，雙方在烏拉爾山一脈展開血腥拼殺，到了這裡，後方的彈藥補給已經跟不上，彈藥打光之後剩下的唯有刀刀見骨的殊死血拼。
這一仗直殺得殘肢遍野，血凝冰山，打了半個多月，明軍只餘五萬多人撤回鄂畢河東岸修整，俄國人死傷更重，所剩六萬多殘軍，守著烏拉爾山，再不敢輕易東向。
朱由檢又找來荷蘭、法國、丹麥等代表，嚴厲地表達自己的不滿，讓他們向自己的俄國盟友轉達，如果他再敢覬覦東方領土，他要對他們這邊的新教聯盟國家實行武器禁運，一顆子彈也不會再賣給他們，並且為西班牙提供三千萬銀圓的貸款，還威脅要集結海陸大軍，一路從陸地上殺向莫斯科，另一路派出南海艦隊跟西班牙聯合殺去歐洲找俄國人算賬！
這下可把各國代表嚇壞了，歐洲的三十年戰爭原本十分慘烈，德意志地區人口死亡超過六成，如今有了明朝的軍火支援，慘烈指數更上升了幾倍，戰火覆蓋的地域更廣，死亡的人數更多，現在雙方都有點筋疲力盡，又只能咬牙苦撐，如果這個時候，明朝派軍艦過去，一艘火蛟號戰列艦，四艘改進之後的巡海夜叉和三十二艘海鯊艦，這樣一支艦隊出現在歐洲戰場上，不管是幫助哪一方都立即能夠取得壓倒性的勝利，這對他們這一邊的各國聯軍簡直是一場堪比末日降臨的災難！更不用說還要拒絕買給子彈。
各國代表趕緊回去向國王報告，各國立即跟俄國練習，俄國剛跟明軍在烏拉爾山血拼了一場，血還沒有舔乾淨，再被各國施壓，只能答應，不再派正規士兵進入鄂畢河以東的地區。
暫時解決了俄國的問題，李雲崖加緊在北方建城，派中科院的專家去按照氣候、風俗等因素重新劃定草場，新築北溟城、新月城、玉山城三座，用最快的速度吸納人口，使得最北邊的北溟城很快達到一萬餘戶。
孫傳庭留下三萬騎兵常駐新月州，自率領剩餘人馬到青海駐紮，厲馬秣兵，為將來進攻**地區做準備，事實上，**原來被大元統治，還在這裡駐軍，請查戶口，設立萬戶，修建驛站等，後來明朝推翻元朝，在這裡任命宣慰司、招討司、萬戶府、千戶等，但多是任命當地人，而且沒有駐軍，而**始終跟蒙古人保持聯繫，後來的四世□□竟然是俺達汗的曾孫。
在原本的歷史上，在崇禎末年，蒙古人再次進軍**，消滅了藏巴汗，建立了統治青藏高原的和碩特汗廷，如今蒙古各部落，要麼被明軍消滅，要麼吸收同化，要麼被迫西遷，**名義上還是明朝地區，但跟中央已經基本上不怎麼有太多的來往了。
西北地廣人稀，軍費所需巨大，現在主要戰略都放在東方，西方只能暫緩，讓孫傳庭加緊做戰前準備，只等將來一聲令下殺過去。