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黃帝在位九十九年，其在位期間發明和建造了。歷數、天文、陰陽五行、甲子紀年、文字、圖畫、著書、音律、樂器、醫藥、祭祀、婚喪、棺槨、墳墓、祭鼎、祭壇、祠廟、占卜等等。
此外黃帝還建立了古國體制：劃野分疆，八家為一井，三井為一鄰，三鄰為一朋，三朋為一里，五里為一邑，十邑為都，十都為一師，十師為一州，全國共分九州。這也是中國有叫九州的由來。
設官司職，置左右大監，監於萬國，設三公、三少、四輔、四史、六相、九德；共120個官位管理國家。
對各級官員提出“六禁重”，即“聲禁重、色禁重、衣禁重、香禁重、味禁重、室禁重”，要求官員節簡樸素，反對奢靡。提出以德治國，修德振兵，以德施天下，一道修德，惟仁是行，修德立義，尤其是設立九德之臣，教養百姓九行，即擔任法官、后土擔任獄官，對犯罪重者判處流失，罪大罪極者判處斬首等。
當然黃帝給後人印象最深的還是和蚩尤的大戰。
蚩尤作兵伐黃帝。黃帝乃令應龍攻之冀州之野。應龍畜水。蚩尤請風伯雨師縱大風雨。黃帝乃下天女曰魃，雨止，遂殺蚩尤。
強悍善戰的九黎部落，酋長蚩尤不服神農傳位於黃帝；他有九個兒子，都是萬夫莫當的勇士，附近部落都臣服在他的控制之下。於是對黃帝的有熊部落發動了戰爭。
黃帝好不退讓揮軍渡過黃河，一直挺進到九黎部落的根據地涿鹿。大戰就在涿鹿郊野進行，兩軍膠著，不分勝負。蚩尤跟黃帝一樣，也是大能轉世，轉世的自然是東皇的老對手祖巫帝江了，當然也可以說是新生吧。
他張開大口，噴出滾滾濃霧，三日三夜不散，有熊部落的士兵都迷失了方向。黃帝用大智慧發明了指南車，使他的部隊雖在濃霧之中，仍能辨識道路。破解了蚩尤的大霧。
蚩尤見一招不成於是又向風神雨神求援，二神前來立刻颳起倒山拔樹的狂風，降下瀑布般大雨，大地上波浪滔天，一片汪洋。一時間黃帝帶領的軍隊一片哀嚎，苦不堪言。
黃帝之女被大水淹死了，卻化作了旱魃。變成旱魃的帝女相貌猙獰可怕，眼睛生在頭頂上，秀髮全是一條一條的小蛇，身上長滿白毛，所到之處，連一滴雨都不會有，往往一連大旱三年，赤地千里，所有生物，全部乾渴而死。人們聽到她的名字都會發抖。
然而在對戰風神雨神時旱魃卻是發揮了作用。她一出現，風神雨神就狼狽逃走，霎時間風停雨住，大水消失，泥濘乾涸。姬軒轅乘機反攻，九黎部落大敗。
蚩尤卻不投降，手中虎魄刀舞動起來。和黃帝就是糾纏在了一起，黃帝一開始用普通的兵器對敵，皆被虎魄斷了，其師廣成子借仙寶居然也不能當虎魄。
當是時黃帝卻想到了小夏送給他的軒轅劍，原本黃帝見軒轅劍外表華貴以為是見飾品，不想取來和虎魄一對竟然穩穩壓制。
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黃帝用軒轅劍斬了蚩尤，一舉戰勝了強大的九黎部落。
而小夏道長此時在黃牛部落中卻是和丫頭兩手相握，慢慢閉上了雙眼，第二天小二發現了已經沒有氣息的兩人，一碰之下卻發現兩人的身體，卻是化做點點星光消失不見了，桌上只留下了小夏道長留下的一封信。
小二拆開看到：“吾徒小二親啟。小二啊！為師歷練紅塵幾百載了，能收到你和忘程也是有緣，如今為師帶你師孃回山去了，勿憂勿念。有緣自會相見。若用麻煩，為師自會相助。”