隨著賠款到位，明軍開始分批釋放俘虜——不僅僅是在東瀛本土抓捕的那些，還有在高麗被俘的8萬多人。
大明把從東瀛軍那裡繳獲的舊式步槍，以及自己國內落後的儲備武器一股腦傾銷給東瀛人（從大明銀行團的貸款中直接扣除相應價格），讓東瀛有能力重新武裝這些部隊。
到885年4月初，符拉迪沃斯託克港化凍，俄軍可以向東瀛前線派出增援的時候，東瀛人已經在青森一線重新整合了大約10萬近代軍隊，這樣的力量足以讓俄圖斯人無力繼續擴大戰果了。
於是，幾乎遭到所有人反對的俄圖斯人主動提議與東瀛和談，早已無力再戰，急著獲得和平的東瀛人立刻同意。
最終的結果，俄圖斯佔據整個北海道，同時勒索4000萬盧布的現金，之後撤出青森。
至此，這場持續時間接近一年，讓東瀛人付出巨大代價的戰爭才算徹底結束。
戰爭的結果，是東瀛人失去了大片領土，付出近百萬傷亡（含民眾），20年維新所積攢的幾乎全部海陸軍覆滅，為了支付4.1億兩賠款（計算貸款利息的話，東瀛人實際需要支付超過10億兩，大概分五十年償還），還出售抵押了大部分國家權益。
可以說，從這時候開始，東瀛已經是個半殖民地國家了。
不過這該怪誰呢？畢竟總歸是他們首先挑起的戰爭不是嗎？
……
4月中旬，明軍從除了廣島和橫須賀之外的本州島各地全面撤軍，不過撤退之前，明軍對東瀛進行了一輪搜刮。
孫笑作為海軍的代表，視察了江戶灣各處炮臺，然後帶人把炮臺上所有先進火炮全部拆走。
海軍方面還扣押了所有東瀛蒸汽商船，並把其中狀態最好，噸位最大的那些當做戰利品帶走，其他狀態不好的船舶也全部扣押在長崎。
陸軍方面也是如此，明軍帶走了東瀛軍大部分先進的野戰火炮和關西地區所有要塞火炮，拿走了比較先進的村田22式步槍，撤退的時候還從佔領區勒索了大量糧食和錢財。
另外，陸軍系統性的銷燬了他們所能看到的所有東瀛紡織機，砍伐了大量桑樹——這是為了摧毀東瀛的繅絲業，給大明的絲紡織工業搶奪市場。
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除此之外，東瀛人所有機床、蒸汽機等先進設備也被明軍拆走。
東瀛人間接經濟損失已經無法計數了。
……
4月20日，大洋艦隊全師返回國內，大明海軍在這場戰爭中沒有損失任何一艘戰艦，連一艘魚雷艇都沒有損失過，反倒是繳獲了大量艦船，戰爭結束後，實力不降反升。
這些繳獲的艦船在大洋艦隊重新解散成各艦隊之前，就被分割完畢。
有優先挑選戰利品權利的北洋艦隊拿走了“笠置”號和“浪速”號巡洋艦，“八重山”和尚未完成的“宮古”號通報艦，以及“小鷹”和20號（更名為小隼號）兩艘魚雷艇。
南洋艦隊選擇了“橋立”號海防艦，“大和”號和“葛城”號舊式巡洋艦，以及10、12、13、15、16、17共6艘魚雷艇（被命名為雷13到雷18號）。
船政水師理所當然的得到了風帆訓練艦“幹珠”號以及小型炮艦“鳳翔”號——因為與明軍戰列艦重名，這艘船隨後被改名為“建勝”號，成了被俘戰艦（除魚雷艇外）唯一一艘改名的。
長江水師則帶走了1、2、3、4號魚雷艇，這些40噸的小艇照例拆除魚雷管，安裝兩門47小炮和兩挺諾登飛機槍，作為長江巡邏艇使用。
考慮到戰爭中獲得的教訓，明軍微調艦艇劃分標準，把“八重山”號通報艦和“南甲”級巡洋艦劃分為一個單獨的艦種——偵查艦。
此外“橋立”號被劃歸二等巡洋艦行列。
由此，戰爭結束後，北洋艦隊實力如下：
一等戰列艦：“龍威”、“鳳翔”
二等戰列艦：“定遠”、“鎮遠”
二等巡洋艦：“揚遠”、“威遠”、“超遠”、“勇遠”、“恆遠”、“興遠”、“笠置”、“浪速”
三等巡洋艦：“致遠”、“靖遠”、“經遠”、“來遠”、“濟遠”、“滄遠”
偵查艦：“八重山”、“宮古”
二等炮艦：“康濟”、“泰安”
魚雷艇：左隊一到左隊十二、右隊一到右隊十二、“小鷹”、“小隼”
合計22艦，魚雷艇26艘。
南洋艦隊實力如下：
二等戰列艦：“大捷”
二等巡洋艦：“橋立”
三等巡洋艦：“開濟”、“寰泰”、“南瑞”、“南琛”、“境明”、“保民”、“福靖”、“福寧”、“大和”、“葛城”
偵查艦：“南甲”、“南乙”、“南乙”、“南丙”
一等炮艦：“龍驤”、“虎威”
二等炮艦：“登瀛洲”、“海境”、“伏波”、“琛航”
魚雷艇：雷一號到雷十八號，南龍級6艘
合計22艦，魚雷艇24艘。
船政水師實力如下：
三等炮艦：“精靈”、“湄雲”、“鎮濤”、“測海”、“操江”、“建勝”
共計戰艦6艘，其他訓練用船（訓練魚雷艇和風帆訓練艦）不計。
不算長江水師和海關巡邏艦隊，大明總計有50艘戰艦，50艘魚雷艇，其實力已經達到二流列強（法、德、意、俄、米）末尾水準，略微超過三流列強（奧匈、西班牙、尼德蘭）。
這恐怕也是英、法、米等國願意與大明分享東瀛利益的原因所在吧。
大明海軍從東瀛獲得的利益還不止如此，即使不考慮賠款能夠分配給海軍的軍費，東瀛在戰前從西方訂購的幾艘戰艦——包括兩艘一等戰列艦（“富士”、“八島”），一艘二等巡洋艦（“高砂”），一艘通報艦（“龍田”），共4艘，因為無法支付後續造艦費用（現在付了以後也養不起了），因而東瀛人希望把他們折價出售。
對戰列艦極度渴望的大明立刻宣佈接手“富士”、“八島”兩艘戰列艦，因為他們不是戰利品，因而沿用在明法戰爭中英勇戰沉的兩艘軍艦的名字——“超勇”、“揚威”
另外一艘二等巡洋艦則被新成立的高麗海軍接手（收到五千萬兩的賠款，高麗也算有錢人了）。
排水量4150噸，極速23節，有2門203+10門120速射炮的二等巡洋艦被命名為“蔚山”號。
而排水量650噸，航速21節，安裝2門120速射炮的通報艦“龍田”號被琉球海軍接手，命名為“聯勝”號（這個是琉球中山府下屬的郡名）。